Analiz konplè regilatè piroptoz ak mikroanviwònman iminitè timè yo nan kansinòm selil ren selil klè.

Pou plis enfòmasyon. kontaktetina.xiang@wecistanche.com

Résumé

Background: Ogmante prèv te endike ke pyroptosis te kapab kontwole amikroanvironman iminitè timè(TAN) pou afekte devlopman timè. Kòm yon timè trè iminojenik, klè selil ren selil karsinom (ccRCC) ka benefisye de imunoterapi, men rechèch ki gen rapò sou piroptoz nan TIME nan ccRCCis toujou ensufizant.

Metòd: Done ki disponib ki sòti nan baz done TCGA ak GEO yo te analize pou idantifye pwofil ekspresyon diferan nan piroptoz nan ccRCC ak tisi nòmal, epi yo te evalye korelasyon regilatè piroptoz ak TIME nan cCRCC.

Rezilta yo: Dapre analiz gwoupman konsansis, yo te idantifye de nivo ekspresyon diferans nan subtip ki afekte pronostik pasyan yo, epi yo te gen rapò ak etap timè istolojik ak klas. Selil iminitè yo te kalkile pa algorithm CIBERSORT. Pi wo nivo enfiltre nan selil B nayif, selil T CD4 memwa repoze, selil NK repoze, monosit, ak makrofaj yo te obsève nan Cluster 1, pandan y ap pi wo nivo enfiltre nan selil CD8 plis T, selil T folikulèr, ak Tregs yo te obsève nan Cluster 2. Analiz anrichisman seri jenetik te endike ke Cluster 2 te anrichi nan plizyè chemen ki gen rapò ak iminitè, ki gen ladan chemen siyal JAK-STAT la. Anplis, ekspresyon de uit pòs iminitè yo te gen rapò ak devlopman ccRCC, espesyalman nan Cluster 2. Kòm kat regilatè piroptoz potansyèlman kle, AIM2, CASP5, NOD2, ak GZMB te konfime ke yo te regilasyon nan ccRCC pa analiz RT-qPCR ak plis verifye pa la. baz done HPA. Pli lwen analiz pan-kansè sijere ke kat regilatè piroptoz sa yo te eksprime diferan ak ki gen rapò ak TIME a nan kansè miltip.

Konklizyon: Etid la prezan bay yon View konplè sou regilatè piroptoz nan TIME nan ccRCC, ki ka bay valè potansyèl pou imunoterapi.

Mo kle: Karsinòm selil ren selil klè, piroptoz, mikroanvironnman iminitè timè, pòs iminitè, iminoterapi

Klike pou aprann herba cistanches trete fonksyon ren

Background

Kansòm selil ren(RCC) se timè solid ki pi komen nan ren nan granmoun, ki reprezante apeprè 3 pousan nan tout maladi malfezan adilt yo ak 90 pousan nan maladi malfezan ren yo[1]. Kounye a, kantite lanmò akòz RCC chak ane atravè lemond depase 1,00,000, epi to morbidite ak mòtalite yo ap ogmante nan yon pousantaj de 2-3 pousan chak 10 ane. [2]. Dapre vèsyon an 2004 nan klasifikasyon patolojik RCC OMS la, ensidans nan karsinòm selil ren selil klè (ccRCC) se apeprè 70 pousan [3]. Malgre ke reseksyon chirijikal se toujou pi bon tretman pou ccRCC, kounye a pa gen okenn tretman adjuvan apre operasyon efikas, ak ccRCC pa sansib a radyoterapi ak chimyoterapi. Dapre literati a, 20-40 pousan nan pasyan yo fè eksperyans repetisyon apre operasyon [4]. Kòm yon timè trè iminojenik, ccRCC ka benefisye de imunoterapi.

Pyroptosis se yon kalite lanmò selil pwograme akonpaye paenflamasyondeklanche pa enfeksyon mikwo-òganis patojèn oswa lòt siyal danjere [5]. Pyroptosis se sitou karakterize pa anfle selil, liz, ak liberasyon nan kontni sitoplasmik. Piroptoz apwopriye se yon mekanis enpòtan pou lame a reziste kont enfeksyon pa mikwo-òganis patojèn etranje yo. Sepandan, piroptoz twòp se danjere oswa menm fatal pou lame a. Yon kantite etid yo montre ke piroptoz jwe tou yon wòl enpòtan nan devlopman timè [6]. Piroptoz kreye yon anviwònman ki anpeche timè lè li lage faktè enflamatwa. Sepandan, piroptoz kapab tou febli fonksyon iminitè kò a nan selil timè yo ak akselere kwasans lan nan timè nan diferan kansè. Gen kèk etid yo montre ke efè pro-enflamatwa efikas nan piroptoz gen rapò ak règleman an nan mikro anviwònman iminitè timè [7]. Konklizyon sa yo sijere ke piroptoz jwe yon wòl enpòtan nan devlopman timè ak pwosesis anti-timè a. Sepandan, efè pyroptosis sou pronostik ccRCC pa klè. Yon konpreyansyon konplè sou piroptoz nan ccRCC toujou manke, ki gen ladan diafonis ki genyen ant regilatè piroptoz ak mikro anviwònman iminitè timè a.

Nan etid la prezan, nou te fè yon analiz retrospektiv konplè ki baze sou baz done The Cancer Genome Atlas (TCGA) ak Gene Expression Omnibus Database (GEO) pou estime enfliyans piroptoz sou TIME a epi plis eksplore mekanis ki kache ant piroptoz ak TIME endividyèl. karakterizasyon ki baze sou analiz gwoup konsansis la. Anplis de sa, etid la prezan tou verifye relasyon ki genyen ant piroptoz ak ekspresyon iminitè cho pòk.

Materyèl ak metòd

Done akizisyon ak idantifikasyon ekspresyon diferans

Done sekans RNA (RNA-seq) nan 539 tisi ccRCC ak 72 nòmalrenyo te jwenn tisi ak karakteristik klinik korespondan yo nan baz done TCGA (https://portal.gdc.cancer.gov/). Done GSE46699 ak GSE53757 ki soti nan baz done GEO (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) yo te kolekte epi itilize pou evalye ekspresyon regilatè piroptoz la. Anplis, done ekspresyon jèn TCGA pan-kansè pou 33 kalite timè malfezan ak enfòmasyon klinik ki koresponn, tankou nòt stemness ki baze sou mRNA (RNAss) ak DNA-methylation (DNAss) osi byen ke sub-kalite iminitè, yo te jwenn nan inivèsite a. Kalifòni Santa Cruz baz done (UCSC Xena, http://xena.ucsc.edu/). 37 regilatè piroptoz yo prezante nan dosye adisyonèl 4: Tablo S1 epi yo te ekstrè nan envestigasyon anvan yo [8, 9]. Lè w itilize pake "limma", plis pase de-pliye chanjman ak yon pousantaj dekouvèt fo (FDR, ajiste p-valè)<0.05 is="" considered="" differential="" gene="" expression.="" the="" immunohistochemistry="" (ihc)="" staining="" images="" of="" pyroptosis="" regulators="" in="" normal="" kidney="" and="" tumor="" tissues="" were="" analyzed="" and="" obtained="" from="" the="" hpa="" database="" (http://www.proteinatlas.org/).to="" compare="" the="" expression="" between="" normal="" and="" tumor="" samples,="" all="" tissues="" were="" selected="" using="" the="" same="">

Regroupement konsansis

Yo te itilize analiz regresyon Univariate Cox pou ekstrè regilatè pyroptosis atravè pakè R "siviv" p-valè.<0.05). consensus="" clustering="" was="" performed="" to="" explore="" the="" potential="" molecular="" subtype="" between="" the="" bca="" patients="" using="" the="" r="" package"consensus="" cluster="" plus".="" the="" cluster="" count="" (k)="" was="" set="" from="" 1="" to="" 9,="" and="" the="" best="" optimal="" k="" value="" was="" selected="" for="" further="">

Estimasyon mikwo-anviwònman iminitè timè

CIBERSORT, yon zouti analiz ki baze sou siyati jèn iminitè LM22, te itilize pou evalye nivo enfiltrasyon iminitè timè ccRCC. Algorithm la te kouri pou 1000 pèmitasyon ak echantiyon ccRCC ak yon pwodiksyon P<0.05 were="" selected="" for="" further="" analysis.="" the="" "estimate"="" package="" in="" r="" was="" used="" to="" evaluate="" the="" immune="" score="" and="" the="" stromal="" score.="" moreover,="" 8="" com-mon="" immune="" checkpoint="" genes,="" including="" pd-1,="" pd-l1,="" pd-l2,="" ctla4,="" siglec15,="" tigit,="" tim3,="" and="" lad3,="" were="" extracted="" and="" evaluated="" for="" their="" correlations="" with="" pyroptosis="" regulators="" in="">

Analiz anrichisman fonksyonèl

Gene Ontology(GO) analiz ak Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analiz chemen siyal yo te fèt lè l sèvi avèk "cluster Profiler" pake a nan R.Anplis de sa, Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) te fèt pou idantifye diferans ki genyen nan seri a. jèn yo eksprime ant de grap yo nan anrichisman chemen KEGG la. Nimewo a nan pèmitasyon te fèt 1000 fwa pou

chak analiz, ak chemen yo ak p-valè ajiste<0.05 and="" q="" values=""><0.05 were="" considered="" statistically="">

Prediksyon repons dwòg

Dapre enfòmasyon yo te jwenn nan baz done Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC) (https://www.cancerrxgene.org/), yo te kalkile sansiblite chimyoterapi pou ccRCC. Twa dwòg klinik komen yo te chwazi pou predi repons chimyoterapi a, epi yo te itilize pake R "pRRophetic" pou estime repons chimyoterapi detèmine pa konsantrasyon inhibitor mwatye maksimòm (IC50).

Liy selilè ak analiz RT-qPCR

Liy selil ccRCC imen yo, 786-O ak Caki-1, se Haixiang Shen ki te bay, e Yanhong Ma.RPMI te bay liy selil epitelyal nòmal korèks ren imen an, HK-2. Yo te itilize 1640 mwayen (Gibco) ak 10 pousan serom fetal bovine (FBS, Gibco) pou kiltive selil yo. Ak tout selil yo te kiltive nan 37 degre ak 5 pousan gaz kabonik. RNAs total yo te ekstrè nan selil yo ak Trizol Twous (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) dapre enstriksyon manifakti a. Premye strand (cDNA) te ranvèse transkri e yo te itilize kòm modèl pou analiz qPCR jan sa te dekri anvan [10]. Nivo ekspresyon regilatè piroptoz yo (AIM2, NOD2, GZMB, ak CASP5) yo te mezire lè l sèvi avèk yon Twous SYBR Green qPCR (Takara, Japon). Non jèn yo ak sekans primè yo bay lis nan dosye adisyonèl 5: Tablo S2. Nivo mRNA tout jèn yo te nòmalize nan GAPDH (yon referans nòmalizasyon andojèn).

Analiz estatistik

Analiz estatistik yo te fèt lè l sèvi avèk lojisyèl R (http://www.R-project.org, vèsyon 4.0.3), langaj pwogram PERL (vèsyon 5.32.1.1, https://www.perl.org /), ak GraphPad Prism 8.0. Koefisyan korelasyon yo te kalkile pa Spearmen ak analiz korelasyon distans. Yo te trase koub Kaplan-Meier, epi yo te itilize yon tès log-rank pou kalkile diferans enpòtan siviv. Yo te itilize tès Wilcoxon siyen-ran pou analize varyab kontinyèl, tandiske tès chi-kare yo te itilize pou analize done kategori yo. Rezilta RT-qPCR yo te eksprime kòm mwayen ± SEM. Diferans ki genyen ant gwoup yo te evalye pa yon sèl-fason ANOVA ki te swiv pa ad hoc tès Dunnett nan konparezon miltip pou konpare ak selil ren nòmal. Yon p-valè mwens pase 0.05 te konsidere kòm estatistik enpòtan pou tout analiz.

Rezilta yo

Idantifikasyon ak klasifikasyon diferan regilatè ki asosye ak piroptoz

Ekspresyon 37 jèn ki asosye ak piroptoz yo te konpare nan kòwòt TCGA-KIRC, epi yo te idantifye 11 jèn kòm jèn ki eksprime diferan (Fig. 1A). Apre de (2) done endepandan ki soti nan baz done GEO yo te itilize pou ilistre ekspresyon 11 jèn sa yo nan ccRCC, sis regilatè ki asosye ak piroptoz (AIM2, CASP5, NLRP3, NOD2, GZMA, ak GZMB) te demontre yo trè eksprime nan ccRCC (figi). .1B). Konbine ak enfòmasyon pronostik pasyan telechaje soti nan TCGA datasets, regression Cox univariate te Lè sa a, aplike nan ekran jèn nan 6 regilatè sa yo, ak kat nan yo (AIM2, CASP5, NOD2, ak GZMB) te siyifikativman ki gen rapò ak pronostik pasyan ccRCC (Fig. 1C). . Pou plis envestige relasyon ki genyen ant ekspresyon de 4 regilatè sa yo ak subtip ccRCC, yo te fè analiz konsansis gwoupman ak pasyan kòwòt TCGA-KIRC. Yo te fè analiz konsansis gwoupman ak pasyan ccRCC ki baze sou kat regilatè piroptoz sa yo, e rezilta a te montre ke varyab clustering (k) =2 te idantifye kòm pi gwo estabilite gwoupman soti nan k =1 rive 9, sa ki endike. ke pasyan ccRCC yo ta ka divize an de grap ki gen pi gwo korelasyon entragroup yo ak korelasyon ki pi ba yo entègwoup (figi 1D). Anplis, pasyan ki nan Cluster 1 te gen siviv favorab an jeneral (OS) konpare ak sa yo ki nan Cluster 2 (Fig.1E).

Analiz TIME nan grap yo dapre regilatè yo piroptoz

Pou mennen ankèt sou ki chemen ki rich nan grap yo, yo te fè analiz GSEA pou idantifye chemen KEGG enpòtan ki asosye ak de grap yo. Rezilta yo te montre ke entèraksyon reseptè cytokine, chemen siyal reseptè T selil yo, pwosesis anti-gen ak prezantasyon, chemen siyal chemokine, cytotoxicity asasen natirèl, cytotoxisite ki gen rapò ak reseptè a, chemen siyal reseptè B selil, ak siyal JAK-STAT. chemen yo te siyifikativman ki gen rapò ak Cluster 2 (Fisye adisyonèl 1: Figi S1), ki endike ke grap yo ki gen regilatè piroptoz yo te asosye ak timè iminitè mikro-anviwònman. Se poutèt sa, yo eksplore diferans ki genyen nan fonksyon iminitè ant de grap yo, nòt ESTIMATE yo te kalkile ak demontre ke Cluster 2 te gen siyifikativman pi wo ESTIMATE, stromal, ak nòt iminitè konpare ak Cluster 1 (Fig. 2A), ak kat regilatè yo piroptoz yo te pozitivman. ki gen rapò ak nòt sa yo (Fig. 2B). Anplis de sa, de grap yo revele diferans enpòtan nan enfiltrasyon selil iminitè (Fig. 2C). Gwoup 1 te gen plis nivo enfiltre nan selil B nayif, selil T CD4 repoze, selil NK repoze, monosit, makrofaj M0, makrofaj M2, selil dendritik aktive, ak selil mast repoze, pandan y ap gwoup 2 te pi wo. ki gen rapò ak selil plasma, selil T CD8, selil T aktive memwa, selil T asistan folikulèr, selil T regilasyon (Tregs), selil T gamma delta, ak selil NK aktive. Analiz de korelasyon ant kat regilatè yo ak kalite selil iminitè yo te montre ke kat regilatè yo te gen yon korelasyon pozitif oswa negatif ak pifò kalite selil iminitè (Fig.2D). Enteresan, plis envestigasyon sou ekspresyon diferans nan jèn iminitè ant de grap revele ke yon mas nan jèn iminitè te moute-reglemante nan Cluster 2 pandan y ap sèlman 5 jèn yo te desann-reglemante (Fisye adisyonèl 2: Figi S2A). Yo te chwazi 10 jèn ki pi upregulated ak downregulated pou analize korelasyon an epi rezilta yo montre nan dosye adisyonèl 2:Figi S2B. Analiz GO nan pwosesis byolojik te montre ke ekspresyon diferans nan jèn iminitè ant grap yo te rich nan aktive wout siyal reseptè sifas selil yo ak transdiksyon siyal nan.repons iminitè. Analiz eleman selilè endike ke jèn iminitè yo eksprime diferan yo te abondan nan konplèks imunoglobulin lan. Analiz fonksyon molekilè te endike ke jèn iminitè ki eksprime diferansye yo enplike lyezon antijèn. Analiz KEGG te montre ke jèn iminitè ki eksprime diferan yo te rich nan entèraksyon reseptè cytokine-cytokine (Fisye adisyonèl 2: Figi S2C, D). Rezilta sa yo endike ke Cluster 2 ak kat regilatè yo enplike nan mikro-anviwònman iminitè timè a.

Asosyasyon regilatè pyroptosis ak inibitè pòs iminitè yo ak sansiblite dwòg vize Terapi iminitè pòs iminitè (ICI) yo te etabli kòm yon opsyon tretman ki pisan pou plizyè kalite timè, pandan y ap sèlman yon fraksyon nan pasyan benefisye de terapi sa yo. Se poutèt sa, ekspresyon diferansye ICI yo nan diferan subtip yo te eksplore plis. Uit jèn iminitè cho (SIGLEC15, TIGIT, PD-L1, TIM3, PD-1, CTLA4, LAG3, ak PD-L2) te gen rapò pozitivman ak Cluster 2 (Fig.3A, B). Enteresan, kat regilatè yo te byen sere ki gen rapò ak pi ICI yo, pandan ke pa te gen okenn relasyon enpòtan ant GZMB ak SIGLEC15 (Fig.3C). Anplis de sa, konsidere valè tretman klinik la nan sansiblite dwòg yo sib, Sunitinib ak Temsirolimus te montre plis sansiblite nan Cluster 1, pandan y ap Axitinib te pre relasyon ak Cluster 2 (Fig. 3D-F). Rezilta sa yo endike ke klasifikasyon sa a ka bay yon sèten valè referans pou medikaman klinik diferan pasyan ccRCC.

Analiz stratifikasyon nan sèvis piblik gwoup la Pou plis eksplore valè klinik la nan relasyon ki genyen ant klasifikasyon sa a ak diferan karakteristik klinik, pasyan ccRCC yo te divize an diferan gwoup dapre laj pasyan, sèks, klas, ak etap maladi. Li se vo anyen ki pi wo etap maladi a te plis asosye ak pasyan yo nan Cluster 2, osi byen ke klas la patolojik (Tablo 1; Fig.4B). Pli lwen analiz de relasyon ki genyen ant regilatè pyroptosis ak karakteristik klinik yo te demontre ke nivo ekspresyon kat regilatè yo te ogmante ak ogmantasyon nan etap maladi ak klas patolojik, pandan y ap sèlman AIM2 te plis eksprime nan gason pase nan fi yo. Pa te gen okenn diferans enpòtan ant ekspresyon kat regilatè yo ak laj pasyan yo (Fig.4A).

Verifikasyon eksperimantal nan ekspresyon kat regilatè yo Baze sou analiz bioenfòmatik ekspresyon kat regilatè sa yo, nou analize nivo ekspresyon mRNA ak pwoteyin. Konpare ak selil nòmal yo, nivo ekspresyon 4 jèn sa yo te kontwole nan diferan degre nan de liy selil ccRCC yo (figi 5A). An korespondan, modèl ekspresyon pwoteyin AIM2, NOD2, ak GZMB ki soti nan baz done HPA te revele ke regilatè yo te twò eksprime nan tisi ccRCC konpare ak tisi nòmal (figi 5B).

Kat modèl ekspresyon regilatè piroptoz nan plizyè kansè

Plis envestigasyon sou modèl ekspresyon kat regilatè piroptoz sa yo nan pan-kansè te montre ke kat regilatè piroptoz yo te eksprime diferan nan plizyè kansè (Fig.6A). , poumon, lestomak, ak andometri, osi byen ke CASP5, NOD2, ak GZMB (Fig.6A). Pli lwen analiz te jwenn ke AIM2 te pi pozitif ki gen rapò ak HNSC, pandan y ap CASP5 te negatif ki gen rapò ak COAD (Fig.6B). Ak AIM2 ak GZMB te de jèn yo ak asosyasyon pozitif ki pi enpòtan (Koefisyan koreksyon =0.59, Fig.6C).

Pandan pwogresyon kansè, selil timè yo ka piti piti pèdi yon fenotip diferansye epi jwenn karakteristik ki sanble ak progenitor ak selil souch [11]. Anjeneral, RNAss ak DNAss yo ka itilize pou evalye tij selil souch kansè yo [12]. Se poutèt sa, yo te eksplore korelasyon ki genyen ant regilatè piroptoz ak tij timè ki mezire pa RNAss ak DNAss. Kat regilatè yo te siyifikativman pozitif oswa negatif korelasyon ak RNAss ak DNAss nan pi fò nan pan-kansè yo (Fig.6D). Miyò, nan KIRC, AIM2 ak GZMB te asosye pozitivman oswa negatif ak RNAs, respektivman, pandan y ap NOD2 te asosye negatif ak DNAss (Fisye adisyonèl 3: Figi S3).

Asosyasyon nan kat regilatè yo piroptoz ak timè iminitè mikro-anviwònman nan pan-kansè

Ki baze sou efè a regilasyon enpòtan nan jèn piroptoz sou diferan kalite selil iminitè, kat regilatè yo te plis envestige nan pan-kansè mikwo-anviwònman an. Enteresan, eksepte AIM2 te asosye negatif ak DLBC ak CASP5 te negatif asosye ak COAD ak READ nan nòt ESTIMATE ak nòt stromal, lòt moun te asosye pozitivman ak kansè nan nòt iminitè a, nòt stromal, ak nòt ESTI-MATE (Fig.7A). ). Pou eksplore ekspresyon kat regilatè pyroptosis yo nan diferan subtip iminitè nan pan-kansè, enfiltre iminitè yo te divize an sis kalite pou analiz ki koresponn soti nan timè-pwomosyon nan timè suppressive, respektivman, ki gen ladan gerizon blesi, IFN-y dominan, enflamatwa, lenfosit. apovri, iminolojik trankil, ak TGF-dominan. Enteresan, kat regilatè yo piroptoz yo te tout siyifikativman ki gen rapò ak subtip iminitè, ak kat regilatè yo piroptoz yo te pi eksprime nan IFN-y dominan, ki te swiv pa TGF-dominan (Fig.7B). Nan KIRC, sepandan, ekspresyon kat regilatè piroptoz yo te pi wo nan C2 menm jan ak analiz pan-kansè. AIM2, ki te gen dezyèm ekspresyon ki pi wo nan subtip iminitè, te gen rapò ak Cl, pandan y ap NOD2, CASP5, ak GZMB te gen rapò ak C6 (Fig. 2E).

Diskisyon

Reseksyon chirijikal se premye tretman pou kansè selil ren nan pratik klinik nou an. Sepandan, li toujou difisil pou retire metastaz kansè nan selil ren. Kansinom selil ren metastatik rezistan a radyoterapi ak terapi sistemik, ki gen ladan terapi òmòn, ak chimyoterapi [13]. Yon esè klinik nivolumab, yon inibitè pòs iminitè anti-PD-L1, pou tretman metastatik ccRCC (CheckMate-025) te demontre ke nivolumab gen yon OS siyifikativman siperyè, rapò danje, ORR, ak to repons jeneral [ 14]. Etid sa yo endike ke aplikasyon an nan imunoterapi nan tretman an nan ccRCC gen gwo kandida. Yon analiz apwofondi de eterojenite nan ccRCC TIME a ka ede bay jesyon imunoterapi egzak ak endividyalize pou amelyore efè tretman an ak bon jan kalite siviv pronostik pasyan an. Isit la, pasyan ccRCC yo te separe an de subtip molekilè endepandan ki gen diferan karakteristik klinik, ekspresyon jèn iminitè, ak TIME atravè gwoup konsansis pou kat regilatè piroptoz prensipal yo. Dapre etid aktyèl la, Cluster 2 te gen yon pi mal pronostik pase Cluster 1, men Cluster 2 te pi sansib a imunoterapi.

Pami mekanis lanmò intrinsèques selil yo, piroptoz te resevwa yon atansyon ogmante. Piroptoz se yon kalite lanmò selil enflamatwa pwograme ki fèk rekonèt ki aktive atravè chemen medyatè pa kaspas-1 inflammasomes klasik oswa kaspas ki pa klasik-4, kaspas-5, ak kaspas{{4}. } [15]. Dènyèman, prèv émergentes te rapòte wòl enpòtan nan piroptoz nan tumorigenesis nan malign imen [16,17]. Piroptoz anpeche kwasans timè nan kansè kolorektal, kansè nan fwa, ak kansè po, men li gen yon efè nan de-fason sou kansè nan tete [18-20]. Nan ccRCC, li rete enkoni ki jan jèn ki gen rapò ak piroptoz kominike ak si yo gen rapò ak tan siviv pasyan yo. Ekspresyon pifò jèn regilasyon piroptoz gen yon relasyon pozitif epi li jwe yon wòl pronostik enpòtan nan ccRCC. Konklizyon sa yo sijere ke regilatè piroptoz yo ka jwe yon wòl kle nan reglemante tumorigenesis ak devlopman ccRCC. Nan etid la prezan, yo te idantifye kat regilatè piroptoz ki trè eksprime nan kansè nan ren epi ki lakòz move pronostik. AIM2 se yon reseptè iminitè cytosolic natirèl ki rekonèt doub-blon ADN (dsDNA) lage pandan twoub selilè ak atak patojèn. Aktive AIM2 aktive chemen klasik piroptoz atravè kaspase -1 [21]. AIM2 ka jwe yon wòl inik nan diferan kalite kansè [22-25], ak etid prezan an te montre ke AIM2 jwe yon wòl pwomosyon kansè nan ccRCC. Kaspaz-5(CASP5), menm jan ak kaspas-4 ak kaspas-1l, se yon pwoteyin egzekitif nan kaspas-1-piroptoz endepandan [26]. GZMB itilize pa lenfosit sitotoksik kòm yon zam molekilè pou defans kont viris ki enfekte ak malfezan transfòme selil lame [27]. Ekspresyon ki ba nan GZMB gen rapò ak metastaz bonè nan kansè kolorektal, sijere enfiltrasyon nan veso sangen ak nè [28]. Enteresan, analiz nou an te jwenn ke GZMB se yon jèn ki gen rapò pozitif nan kansè nan ren. NOD2 se yon reseptè rekonesans modèl ki ka kontwole repons iminitè natirèl lame a epi anpeche enflamasyon, steatoz, ak obezite [29]. H3 H3 ekstra-selilè pwovoke pa LPS ka lakòz piroptoz pandan sepsis atravè chemen NOD2 ak VSIG4 / NLRP3 [30]. Li rete enkoni ki jan jèn sa yo kominike youn ak lòt pandan piroptoz selil nan ccRCC.

Nan pratik klinik nou an, vaskilè endothelial kwasans faktè reseptè tirozin kinaz inhibiteurs (VEGFR-TKIs) te vin estanda nan swen pou mRCC [31]. Sunitinib, yon inibitè gwo spectre nan reseptè tirozin kinaz, te lajman itilize kòm estanda nan tretman pou terapi premye liy nan ccRCC avanse [32]. Sepandan, se pa tout pasyan RCC yo sansib nan tretman sunitinib, epi pifò pasyan yo pral devlope rezistans nan sunitinib apre kèk mwa nan tretman an. Se poutèt sa, kle nan chwazi sunitinib pou tretman se chwazi pasyan ki sansib a sunitinib. Etid la te demontre ke Cluster 1 pi sansib a sunitinib, pandan y ap Cluster 2 pi sansib a axitinib.

Konprann ekspresyon regilatè piroptoz yo nan ccRCC anvan tretman an ka ede konsepsyon opsyon tretman vize ki pi optimize pou benefisye pasyan yo. Gen kèk etid ki montre ke efè pro-enflamatwa efikas nan piroptoz gen rapò ak règleman an nan mikro anviwònman iminitè timè [33]. Sepandan, wòl potansyèl pyroptosis nan mikwo-anviwònman iminitè ccRCC toujou flotant. Ki baze sou karakteristik ekspresyon regilatè piroptoz yo, etid prezan an endike ke pasyan ki nan gwoup diferan gen diferan korelasyon ak diferan enfiltrasyon iminitè. Pi wo nivo enfiltre nan selil B nayif, selil T CD4 memwa repoze, selil NK repoze, monosit, macrophages M0, ak macrophages M2 yo te obsève nan Cluster 1. Nan lòt men an, Cluster 2 te pi wo ki gen rapò ak CD8 plis. Selil T, Tregs, ak T follicular helper cellules. Tregs ka sekrete yon varyete cytokins imunosuppressive, ki mennen ale nan chape iminitè selil timè yo. Etid yo montre ke Tregs efektivman anpeche pwopagasyon selil T efèktè yo ak yon wo nivo enfiltrasyon CD8 + T selil se yon faktè pronostik favorab pou ccRCC [34,35]. Move pronostik Cluster 2 ak konklizyon de konklizyon sa yo mityèlman konsistan. Cluster 2 gen yon relasyon pozitif ak uit ICI cho (SIGLEC15, TIGIT, PD-L1, T IM3, PD-1, CTLA4, L AG3, ak PD-L2). Dapre rezilta sa yo, rezilta siviv pòv Cluster 2 yo ka koze pa nivo redwi iminite anti-timè, ak Cluster 2 ka pi benefik nan iminoterapi. Rezilta GSEA yo endike ke Cluster 2 gen rapò ak yon varyete de chemen siyal regilasyon iminitè yo. Sa ki enpòtan, chemen siyal JAK-STAT gen rapò ak kanserojèn ak enfiltrasyon iminitè ccRCC. Kidonk, nou te espekile ke piroptoz ka kontwole konpozisyon mikwo-anviwònman iminitè timè a. Etid nou an sijere ke ccRCC ak ekspresyon segondè nan 4 jèn sa yo ka pi sansib a imunoterapi.

Nivo ekspresyon kat regilatè yo ogmante ak ogmante etap maladi ak klas patolojik, e pa te gen okenn diferans enpòtan ant ekspresyon kat regilatè yo ak laj pasyan yo, ki te konsistan avèk pi mal pronostik Cluster 2 la.

Etandone ke piroptoz se lajman ki enplike nan divès pwosesis byolojik, nou te envestige si kat regilatè piroptoz sa yo nan Cluster 2 jwe yon wòl enpòtan tou nan lòt kalite kansè. Yo te fè yon analiz pan-kansè answit, ak rezilta yo te montre ke kat regilatè piroptoz sa yo te gen rapò ak nòt stromal, nòt iminitè, ak nòt ESTIMATE nan plizyè kalite kansè. Rezilta sa yo te endike ke kat regilatè piroptoz sa yo se sib potansyèl pou yon varyete imunoterapi kansè epi yo pa limite a ccRCC.

Nan lavni an, plis analiz verifikasyon serye ki nesesè nan yon kòwòt pi gwo. Anplis de sa, yo bezwen plis eksperyans in vitro ak in vivo pou klarifye mekanis regilasyon ant regilatè piroptoz ak mikro anviwònman iminitè timè yo.

Konklizyon

An rezime, etid sa a sistematik analize pwofil ekspresyon regilatè piroptoz nan ccRCC ak korelasyon li yo ak pòs iminitè yo ak wòl nan mikro anviwònman iminitè timè a. Ekspresyon regilatè pyroptosis siyifikativman gen rapò ak pòs iminitè tankou PD-L1 ak CTLA4. De subtip endepandan yo te etabli tou atravè gwoupman ki konsistan nan regilatè piroptoz yo. Eterojenite timè yo ak diferans ki genyen nan ekspresyon pòs iminitè yo ak mikro anviwònman iminitè timè yo te obsève ant de subtip yo, ki pral ede stratifikasyon risk ak tretman egzak pasyan ccRCC yo. Yon analiz pan-kansè nan yon sèl etap te montre ke regilatè piroptoz sa yo gen rapò ak nòt stromal, nòt iminitè, ak nòt ESTIMATE nan anpil kalite kansè. Sa ki enpòtan, esè klinik nan lavni ak rechèch debaz pral ede detèmine objektif pou amelyore efikasite imunoterapi kansè.