Rezon ak konsepsyon Pwojè Medsin Precision ren.
Apr 21, 2023
Résumé
Maladi ren kwonik (CKD) ak blesi nan ren egi (AKI) se maladi komen, eterojèn, ak morbid. Karakterizasyon mekanik nan CKD ak AKI nan pasyan yo ka fasilite yon apwòch medikaman presizyon nan prevansyon, dyagnostik, ak tretman. Pwojè Medikaman Precision ren an gen pou objaktif pou jwenn byopsi ren nan men patisipan ki gen CKD oswa AKI sou plan etik ak san danje, kreye yon atlas ren referans, epi karakterize sougwoup maladi yo pou stratifye pasyan yo ki baze sou karakteristik molekilè maladi a, karakteristik klinik yo, ak rezilta ki asosye yo. Yon lòt objektif se idantifye selil kritik, chemen, ak objektif pou terapi nouvo ak estrateji prevansyon. Pwojè sa a se yon etid kowòt potansyèl miltisant pou granmoun ki gen CKD oswa AKI ki sibi yon byopsi ren pwotokòl pou rezon rechèch.
Envestigasyon sa a konsantre sou maladi ren ki pi répandus e se poutèt sa anpil chay sante piblik, tankou CKD atribiye a dyabèt oswa tansyon wo ak AKI atribiye a blesi iskemik ak toksik. Yo pral evalye tou tisi ren referans (pa egzanp, byopsi donatè ren vivan). Patoloji tradisyonèl ak dijital yo pral konbine avèk analiz transcriptomic, proteomik, ak metabolomik nan tisi ren yo ansanm ak fenotip klinik pwofon pou analiz sougwoup sipèvize ak san sipèvizyon ak analiz byoloji sistèm. Patisipan yo pral swiv potentiels pandan dis ane pou rann kont rezilta klinik yo. Kalite selil yo, kote yo, ak fonksyon yo pral karakterize nan sante ak maladi nan yon atlas tisi ren ouvè, rechèch sou entènèt. Tout done ki soti nan Kidney Precision Medicine Project yo pral disponib fasilman pou syantifik, klinisyen, ak pasyan yo itilize yo.
Agi blesi nan ren se deteryorasyon toudenkou nan fonksyon ren akòz divès faktè. Sa a ka koze pa faktè tankou enfeksyon, medikaman, bloke ren, reyaksyon transfizyon, chòk, iskemi ren, elatriye. Avèk tretman rapid, fonksyon ren anjeneral retounen, men si ren yo domaje grav, sentòm maladi ren kwonik ka devlope. Nan dekouvèt nou an, Cistanche afekte blesi nan ren egi, Cistanche gen tou yon varyete de konpoze natirèl ak asid amine, ki ka pwoteje estrikti ak fonksyon selil tubulaires ren yo, epi ankouraje reparasyon ak rejenerasyon selil tubulaires ren yo, kidonk ankouraje rekiperasyon an ak reparasyon nan ren an.
Klike sou benefis cistanche tubulosa
Ekspozisyon Piblikatè a:
Sa a se yon dosye PDF nan yon atik ki te sibi amelyorasyon apre akseptasyon, tankou ajoute nan yon paj kouvèti ak metadata, ak fòma pou lizibilite, men li poko vèsyon definitif nan dosye a. Vèsyon sa a pral sibi plis korije, maketing, ak revizyon anvan li pibliye nan fòm final li, men nou ap bay vèsyon sa a bay vizibilite byen bonè nan atik la. Tanpri sonje ke, pandan pwosesis pwodiksyon an, yo ka dekouvri erè ki ka afekte kontni an, ak tout egzijans legal ki aplike nan jounal la konsène.
Divilgasyon
IHdB rapò konsiltasyon pou Boehringer-Ingelheim, Cyclerion Therapeutics, George Clinical, Goldfinch Bio, ak Ironwood. JK rapòte konsiltasyon pou Aethlon; AM Pharma; Astute Medical/bioMérieux; Astellas; Balmes Transplantasyon; Baxter; Sitosorban; GE; Hepa Lave; Indalo Therapeutics; Jafwon; Lowell Therapeutics; Mallinckrodt; MDSG; Nxstage; Onkogna; Oxford PG; PhotoPhage; Potrero; RenalSense; TES Pharma ak aksyon ekite nan PhotoPhage. Komisyon Konsèy Rapò KK pou Goldfinch Bio, Boston. Komisyon Konsèy Rapò SR pou Bayer. JS rapòte yon relasyon ak Maze ak Goldfinch Bio. KS rapòte ekite nan SygnaMap. Rapò KT konsiltasyon pou Eli Lilly, Boehringer-Ingelheim, AstraZeneca, Goldfinch Bio, Gilead, Novo Nordisk, ak Bayer. SW rapò rapò ak Harvard Clinical Research Institute/Baim, Cerus, Strataca, Venbio, Taekda, CVS, JNJ, Mass Medical International, GSK, Allena, Wolters Kluewer, Oxidien, Kantum, BioMarin. JH (Himmelfarb) rapò konsiltasyon pou Pfizer, konsèy konsiltatif pou RenalytixAI, Maze Therapeutics, Akebia, Chinook Therapeutics, ak fondatè AKTIV-X.
Mo kle
maladi ren kwonik; blesi egi nan ren; medikaman presizyon; dyabèt; tansyon wo.
Entwodiksyon
Maladi ren kwonik (CKD) ak blesi nan ren egi (AKI) se maladi morbid komen ki lakòz gwo chay sou pasyan yo, fanmi yo ak sosyete a. Pami adilt Ozetazini, prévalence de CKD se 14 pousan (37 milyon moun), ak yon prévalence de 25 pousan oswa plis pou moun ki gen dyabèt oswa tansyon wo.1,2 AKI afekte 10-15 pousan nan tout moun ki entène lopital. pasyan, ak to ensidans patikilyèman wo nan mitan pasyan ki gen sepsis ak lòt kondisyon ki mande admisyon nan inite swen entansif.3,4 CKD ak AKI ka tou de pwogrese nan echèk ren, ak moun ki gen CKD ak AKI fè eksperyans gwo pousantaj nan evènman kadyovaskilè, enfeksyon, ak mòtalite.4–7 Globalman, kòm yon rezilta, CKD ak AKI asosye ak morbidite fòmidab.6
Yo te fè pwogrè remakab nan konpreyansyon nou sou CKD ak AKI fizyopatoloji. Pa egzanp, anpil wout yo te enplike nan devlopman CKD akòz dyabèt, genotip APOL1 te idantifye kòm yon detèminan fò nan CKD nan Afriken Ameriken yo, ak chemen molekilè medyatè domaj ren ischemik yo te delimite.8–11
Sepandan, kèk terapi yo te pwouve yo anpeche CKD oswa pwogresyon li yo, epi kounye a pa gen okenn apwòch jesyon pwouve yo anpeche oswa amelyore kou a nan AKI. , ak entèvansyon efikas nan modèl sa yo pa nesesèman pwolonje nan imen.12,13 Nan imen, eta maladi endividyèl ak chemen ki afekte yo raman li te ye, an pati paske tisi ren yo pa regilyèman jwenn pou analiz nan swen klinik. Ansanm, obstak sa yo fè li difisil pou bay priyorite sib pou devlopman dwòg, aplike esè klinik efikas nan nouvo ajan terapetik, epi tradui konesans nan sante ren moun.14–17
Raison pou medikaman presizyon ren
CKD ak AKI yo dyagnostike ak klasifye bridman, ki baze sitou sou estimasyon to filtraj glomerulèr (eGFR) ak eskresyon pwoteyin pipi pou CKD ak chanjman kout tèm nan kreyatinin serik ak pwodiksyon pipi pou AKI.4,18,19 Pandan ke yo itil pou staging ak epidemyoloji. , evalyasyon klinik sa yo manke insight granulaire nan mekanis molekilè ki kache oswa aksidan estriktirèl ki kontribye nan eterojenite nan CKD ak AKI, ki gen ladan diferans ki ka kontribye nan li te ye diferans rasyal ak etnik nan risk maladi ren.
Mank yon baz mekanistik nan taksonomi maladi ren aktyèl la gen konsekans enpòtan pou idantifikasyon nouvo mekanis maladi, devlopman objektif terapetik, ak swen klinik woutin. Pou egzanp, mekanis molekilè enpòtan nan maladi ren imen ka difisil pou dekouvri lè yo prezan nan yon ti gwoup pasyan yo. Anplis, si yon terapi vize efektivman yon mekanis molekilè ki enpòtan, benefis tretman sa a nan yon esè klinik oswa pratik klinik ka dilye pami pasyan ki gen diferan chemen maladi ki pa vize pa entèvansyon an.20 Enigm sa a bay yon rezon pou devlopman nouvo. definisyon maladi ki baze sou mekanis molekilè, ki pèmèt terapi ki vize a pwosesis molekilè espesifik ki responsab pou aksidan ren ak pwogresyon li nan yon pasyan oswa yon sougwoup pasyan ki gen fenotip maladi molekilè ki sanble.
Medikaman Precision refere a estrateji prevansyon ak tretman ki pran an konsiderasyon varyasyon endividyèl yo.21 Lè ansyen Prezidan Barack Obama te anonse Inisyativ Medikaman Precision la an 2015, li te refere a medikaman presizyon kòm "li bay bon tretman, nan bon moman, chak fwa nan medikaman an. moun dwat.22" Apwòch sa a mande pou yon konpreyansyon detaye sou baz molekilè sante ak maladi. Avans nan teknoloji kounye a ofri yon opòtinite san parèy pou entèwoje selil kritik ak chemen lè l sèvi avèk fenotip molekilè pwofon, ki gen ladan analiz ADN, RNA, pwoteyin, ak metabolit.
An 2016, Enstiti Nasyonal Dyabèt ak Maladi dijestif ak ren (NIDDK) te konvoke yon atelye pou eksplore si ak kijan medikaman presizyon ta ka itilize pou amelyore dyagnostik ak jesyon CKD ak AKI. Nan atelye a, pasyan yo, klinisyen yo, chèchè akademik yo, bioetikisyen, ak reprezantan endistri yo te diskite sou opòtinite, resous, ak baryè pou jwenn ak entèwogasyon tisi ren imen pou avanse medikaman presizyon ren. Nan menm ane a, NIDDK te pibliye yon seri Demann pou Aplikasyon pou Pwojè Medikaman Precision ren (KPMP), ki te kòmanse nan sezon otòn 2017 la.
Objektif jeneral
KPMP ap chèche redefini CKD ak AKI nan entegre fenotip molekilè pwofon ak karakteristik klinik, patoloji dijital, ak rezilta klinik yo. Espesyalman, objektif jeneral KPMP a se pou (1) etikman ak san danje jwenn byopsi ren nan men patisipan ki gen CKD oswa AKI, (2) kreye yon atlas ren referans, (3) karakterize sougwoup maladi pou stratifye pasyan yo ki baze sou mekanis molekilè maladi. ak rezilta ki asosye yo, epi (4) idantifye selil kritik, chemen, ak objektif pou terapi nouvo. Finalman, apwòch sa a ka pèmèt dyagnostik chemen kle maladi yo sou nivo endividyèl la, idantifye sib pwomèt pou entèvansyon, fasilite evalyasyon nouvo entèvansyon atravè esè klinik vize, ede valide byomarkè pou dyagnostik ak tretman, epi ankouraje aplikasyon medikaman presizyon nan pasyan ki gen CKD ak AKI.
Atenn objektif KPMP mande pou tisi ren moun ki gen fòm komen CKD ak AKI. Pasyan ki gen CKD atribiye a dyabèt oswa tansyon wo oswa AKI atribiye a aksidan ischemik oswa toksik raman sibi byopsi ren, oswa fè sa sèlman lè prezantasyon klinik yo pa nòmal. Kòm yon rezilta, etid nan byopsi ren ki endike nan klinik yo ka twò reprezante kòz etranj maladi oswa pa idantifye mekanis maladi ki pi komen yo. Efektivman evalye eterojenite nan prezantasyon CKD ak AKI, kidonk, mande pou enskri yon nouvo kòwòt moun ki vle sèvi kòm volontè pou bay tisi ren ki otreman ta gen anpil chans pa sibi byopsi ren kòm yon pati nan swen nòmal nan klinik. An konsekans, premye objektif KPMP a se etikman ak san danje jwenn tisi nan patisipan etid sa yo.
Yon livrable kle nan KPMP a se yon atlas ren ki prezante kalite selil ak fonksyon nan sante ak maladi. Atlas la pral yon zouti entèaktif ki entegre done molekilè ak prezantasyon klinik, done imaj, ak rezilta klinik yo. Y ap devlope yon nomenklati ren estanda ak machin entèprete (ontoloji) pou sipòte pataje done ak entegrasyon ak konstriksyon nouvo zouti pou analiz done. Done molekilè ki te pwodwi pa nouvo tès ke envestigatè KPMP devlope, optimize ak aplike yo pral entegre ak patoloji dijital ak fenotip klinik lè l sèvi avèk yon apwòch byoloji sistèm pou jenere nouvo subtip maladi ak sib pou terapi (Figi 1).23,24.
Òganizasyon etid
KPMP a se lajman enklizif nan pasyan, nefrologist, radyològ, patolojis, founisè swen prensipal, entansis, kowòdonatè rechèch, manadjè pwojè, etikisyen, enfòmatik, syantis rechèch ki soti nan diferan disiplin, ak lòt moun ki envesti nan amelyore sante pou moun ki gen maladi ren. Sit rekritman ak sit entèwogasyon tisi yo konekte ak òganize pa yon sant santral ki gen yon sant administratif, sant kowòdinasyon done, ak sant vizyalizasyon done (https://kpmp.org/consortium-members/). Se twa kò endepandan ki sipèvize etid la, ki gen ladan yon Komisyon Konsèy Siveyans Sekirite Done, yon Komisyon Konsèy Revizyon Enstitisyonèl santral (Washington University, St. Louis), ak yon Panel Ekspè Ekstèn NIDDK te konvoke.
Pasyan yo kondwi KPMP la
Yon karakteristik defini nan KPMP a se etablisman an nan yon patenarya ekitab ak pasyan ki gen maladi ren. Pasyan yo te patisipe entegralman nan KPMP a pandan tout dire ak nan tout nivo pwosesis konsepsyon an.25 Pasyan ki gen maladi ren yo te enkli nan atelye 2016 NIDDK sou medikaman presizyon ren pou gide yon apwòch etik ak posib nan byopsi ren ki konsantre sou rechèch. . Pasyan ki soti nan tout sit KPMP yo te envite tou pou yo patisipe nan premye reyinyon Komite Direktè KPMP a, epi premye pasyan yo te travay ak envestigatè yo pou yo rekrite lòt reprezantan pou montre divèsite popilasyon sib KPMP yo.
Pandan pwotokòl rechèch la te devlope, pasyan yo te enfòme etid la sou pi bon pratik pou angajman epi yo te patisipe nan redaksyon fòm konsantman enfòme KPMP (Tablo 1). Devlopman pwotokòl te enfliyanse pa pèspektiv pasyan yo sou baz byenfonde ak chay nan pwosedi etid yo. Pasyan yo te defann fòtman pou enskri yon popilasyon etid divès ak reprezantatif, angaje patisipan etid ki enskri kòm patnè rechèch, epi retounen rezilta etid yo nan yon fason totalman transparan ak alè. Pasyan yo reprezante nan chak Komite KPMP, enkli Komite Direktè a, kote yo patisipe aktivman epi dirije kòm kamarad. Kontribisyon sa yo te ede fè pwotokòl rechèch la apwopriye pou patisipan potansyèl yo epi asire ke pwodwi final yo nan KPMP yo pral pi bon oryante nan direksyon valè pasyan ak preferans.
Etidye konsepsyon
KPMP a se yon etid kowòt pwospè multisant sou moun ki gen CKD oswa AKI ki sibi yon byopsi ren pwotokòl lè yo antre nan etid la. Pwotokòl etid konplè a ak manyèl detay sou pwosedi yo disponib gratis sou kpmp.org/researcher-resources. KPMP a konsantre sou maladi ren ki pi répandus e se poutèt sa anpil chay sante piblik. Pou CKD, sa yo se prezantasyon atribiye klinikman nan dyabèt, tansyon wo, oswa toude. Pou AKI, sa yo se prezantasyon atribiye a sepsis, ischemik, oswa aksidan toksik. Gen kèk pasyan ki te ofri yon byopsi ren pou endikasyon klinik yo ka chwazi pou yo patisipe nan pwotokòl rechèch KPMP olye pou yo yon byopsi klinik estanda epi bay tisi adisyonèl pou rezon rechèch. Sepandan, yo prevwa ke pifò patisipan ki sèvi kòm volontè pou patisipe nan KPMP a pa t ap sibi yon byopsi ren.
Estrateji enskripsyon yo enkli rekritman nan rankont swen klinik (egzanp klinik, sal ijans, oswa sejou lopital), resous enfòmasyon sante elektwonik (egzanp rejis ki egziste deja ak dosye sante elektwonik), ak rezo kominotè ak kontak. Apwòch espesifik nan sit yo optimize estrateji rekritman dapre anviwònman swen sante lokal yo ak popilasyon etid sib yo. Sant kowòdinasyon done KPMP la siveye karakteristik demografik ak maladi patisipan ki enskri yo, konpare karakteristik sa yo ak popilasyon sib ki kache yo, epi voye done sa yo nan sit rekritman yo pou bay priyorite efò rekritman yo jan sa nesesè. Pou sa ka fèt, konsèy kominotè nan chak sit rekritman fasilite angajman popilasyon pasyan lokal yo ak gwoup defansè yo.
Konsantman enfòme yo konsidere kòm yon pwosesis longitudinal ki gen ladan pasyan yo, konseye pasyan yo fè konfyans, founisè klinik yo, ak anplwaye KPMP ki resevwa fòmasyon epi li dire plizyè jou (pou AKI) jiska semèn (pou CKD), tou depann de prezantasyon klinik la. Pwosesis la gen ladann bay aksè a anpil materyèl edikatif anplis konsantman eklere alekri epi li fèt pou asire patisipan yo byen konprann sijè ki abòde etid la ak risk posib li yo.
Kritè enklizyon yo te fèt pou enskri yon popilasyon ki reprezante lajman nan kondisyon klinik sa yo, ki gen ladan prezantasyon klinik bonè (Tablo 2). Pou CKD, patisipan yo limite a sa sèlman moun ki estime GFR ki pi gran pase oswa egal a 30 mL/min/1.73m2 pou ogmante chans pou yo idantifye anomali ki kòmanse ak pwopaje maladi relativman bonè, bay pi gwo opòtinite pou entèvansyon.
Pou AKI, kritè elijiblite yo fèt pou chwazi patisipan ki gen yon CKD minimòm ki kache, ki ta ka konfonn idantifikasyon mekanis espesifik pou AKI. Pasyan ki sibi byopsi ren perkutane yo oblije gen plis kreyatinin serik ki swa soutni oswa akonpaye pa prèv blesi parenchymal,26 pandan pasyan ki sibi byopsi ren laparotomi (anjeneral nan anviwònman depatman ijans egi) gen yon seri kritè enklizyon ki pi laj. enkli AKI bonè oswa gwo risk pou AKI iminan. Popilasyon espesyal yo tou enskri. Pou CKD, moun ki gen dyabèt tip 1 depi lontan ki pa gen prèv CKD ("rezistans" maladi ren dyabetik) yo evalye pou chèche chemen ki asosye ak pwoteksyon kont CKD. Pou AKI, moun ki sibi laparotomi eksploratwa ki gen prèv byen bonè malfonksyònman ren oswa ki gen gwo risk pou yo devlope AKI apre operasyon sibi yon byopsi louvri nan moman operasyon an.
Kritè eksklizyon yo te fèt sitou pou pwoteje sekirite patisipan yo. Kritè esklizyon sa yo te baze sou literati pibliye ak eksperyans klinik epi yo te konsantre lajman sou diminye risk pou yo senyen (Tablo 2). Lòt kritè yo ekskli moun ki gen maladi ren ki deja anba envestigasyon pa lòt etid kòwòt gwo (egzanp moun ki gen maladi glomerulaire ak maladi ren polikistik) ak moun ki gen senaryo klinik etranj pou ki anomali inik yo ka kache maladi men pou yo ta rekrite yon kantite patisipan ensifizan. tire konklizyon siyifikatif konsènan patojèn.
Patisipan yo swiv pandan 10 ane apati moman byopsi ren yo atravè yon konbinezon vizit chak ane etid an pèsòn ak vizit entèval aleka pou dokimante evènman enpòtan klinikman, tankou pèt fonksyon ren, ensifizans ren, entèval entèval entèval, evènman kadyovaskilè, ak mòtalite. Tablo 3). Patisipan ki enskri pou AKI gen yon lòt vizit etid an pèsòn twa mwa apre byopsi ren pou etabli yon klinik debaz postAKI. Siveyans dosye sante elektwonik ak baz done nasyonal tankou Sistèm Done Renal Etazini ak National Death Index pral konplete apwòch sa yo, espesyalman pou swivi alontèm. Yon gwo depo serom, plasma, ak leukosit sikile konsève pou analiz ADN ak RNA, echantiyon pipi kwonometre ak tach, ak echantiyon poupou yo kolekte nan moman byopsi ren ak vizit etid an pèsòn. Echantiyon biorepository yo estoke pou pwojè nan lavni ki vize plis konprann patojèn maladi a epi devlope ak valide byomarkè ki reflete eterojenite maladi a. Kounye a pa gen plan pou repete byopsi ren nan KPMP a, men sa ka konsidere alavni.
Biopsi ren
Pyès prensipal pwotokòl rechèch KPMP la se byopsi ren, ki itilize pou jenere yon dyagnostik tradisyonèl ki baze sou istoloji ansanm ak nouvo fenotip molekilè. Konduit etik nan byopsi ren se yon egzijans absoli nan KPMP a e li te yon konsantre nan diskisyon pandan tout planifikasyon ak devlopman. An jeneral, pandan pwosesis planifikasyon an, doktè ak syantis yo te panse ke pandan ke byopsi ren nan popilasyon planifye yo ka detanzantan bay enfòmasyon itil pou dyagnostik oswa pronostik, pifò patisipan endividyèl yo te fasil pou benefisye dirèkteman nan byopsi yo.
Reprezantan pasyan yo te eksprime yon konsèp pi laj nan benefis potansyèl yo, yo bay valè konesans nan pwosesis maladi yo menm si li pa chanje terapi medikal osi byen ke opòtinite pou kontribye altrèlman nan kominote yo atravè dekouvèt. Kèlkeswa benefis potansyèl yo, byopsi ren vini ak risk nannan, ki gen ladan risk pou konplikasyon grav tankou nesesite pou transfizyon san, entène lopital, pèt ren, ak lanmò.27,28 KPMP te fè yon revizyon sistematik nan konplikasyon byopsi ren pou quantifier sa yo. risk pou patisipan potansyèl yo ak founisè yo.29 Anplis, KPMP a gen pou objaktif pou minimize risk sa yo ak divilge yo atravè yon pwosesis konsantman enfòme konplè ki transparan epi ki respekte otonomi endividyèl yo. Anplis de sa, KPMP a pral kolekte done sou tou de benefis (pou patisipan yo ak founisè klinik yo) ak risk yo rafine konsantman enfòme sou tan ak pi byen quantifier rezilta byopsi pou pi laj kominote a.
Prensip ki gide nan fè byopsi ren an se optimize sekirite pasyan an. Yo te mete aksan sou sekirite atravè KPMP a lè yo devlope yon kilti sekirite, pwotokòl espesifik ki oryante sou sekirite, ak pwosedi pou kontwole ak adapte pwotokòl la jan sa nesesè (Tablo 4). Anpil eleman nan pwotokòl byopsi ren KPMP yo estanda, pandan ke kèk eleman fleksib pou matche ak ekspètiz pwosedi nan sit rekritman KPMP endividyèl yo.
Tout byopsi ren perkutan yo fèt pa operatè ki gen eksperyans, ki sètifye KPMP ki sèvi ak 16-zegwi kalib ak konsèy imaj an tan reyèl. Operatè ki sètifye KPMP yo dwe demontre ke yo te konplete 35 byopsi pandan de ane ki sot pase yo ak yon to konplikasyon pi gwo ki mwens pase 10 pousan, epi 85 pousan nan byopsi yo dwe adekwa pou dyagnostik. Yo pèmèt yon maksimòm senk pas pou atenn yon objektif twa nwayo byopsi. Operatè yo ka nefrologist oswa radyològ. Pou patisipan yo k ap sibi laparotomi ouvè, chirijyen yo pral fè byopsi lè l sèvi avèk 16-zegwi kalib ak vizyalizasyon dirèk nan ren an. Yo itilize lis verifikasyon pou asire ke tout byopsi yo fèt sèlman nan kondisyon ki apwopriye, tankou asire ke siy vital ak paramèt laboratwa yo nan limit sekirite yo. Yon Komite Sekirite ak Jijman KPMP entèn yo detèmine e siveye evènman negatif yo, ansanm ak yon Konsèy Siveyans Sekirite Done ekstèn ak yon sèl Komisyon Revizyon Enstitisyonèl.
Pwosesis ak analiz tisi ren
Youn nan pi gwo defi pou KPMP se maksimize itilizasyon tisi ren limite ki disponib pou dyagnostik patolojik tradisyonèl yo ak plizyè evalyasyon molekilè. Pou sa ka fèt, patolojis, chèchè, ak nefrolog ki kouvri tout sit KPMP te antreprann yon efò kolaborasyon pou desine yon pwotokòl konsansis pou trete tisi byopsi ren (Figi 2). Pwotokòl la te enfòme pa yon seri de etid pilòt ak enkòpore kontwòl kalite solid nan chak etap. Tisi byopsi ren yo triye pa yon patolojis nan suite byopsi a, epi yo chwazi nwayo byopsi ki pi optimal pou evalyasyon histolojik tradisyonèl yo lè l sèvi avèk algoritm ki disponib sou kpmp.org/researcher-resources/. Nwayo dyagnostik sa a trete lokalman nan sit rekritman an pou mikwoskòp limyè, imunofluoresans, ak mikwoskòp elèktron, epi yo pwodui yon rapò patoloji klinik ki baze sou nwayo sa a epi retounen bay patisipan an ak ekip swen klinik la. Lè sa a, nenpòt tisi ki rete nan nwayo sa a voye nan yon biorepository santral pou itilize rechèch yo dwe disponib nan sit entèwogasyon tisi pou etid D 'multiplexed. De lòt nwayo yo trete rapidman pou fenotip molekilè pwofon epi yo jele pou transpòte nan yon depo santral nan University of Michigan.
Tout sit yo montre fòmèlman yo pare pou byopsi ren ak prezèvasyon tisi, ki gen ladan sètifikasyon pou kenbe konpetans yo. Tout reyaktif ak founiti yo anbake kòm twous estandadize, prelabeled soti nan biorepository santral la. Diapozitif ki pwodui nan sit rekritman yo analize santralman pou gade ak analiz dijital, epi yo voye tisi yo prevwa pou etid rechèch yo nan depo santral la epi yo distribye nan sit entèwogasyon tisi yo.
Teknoloji aplike nan imaj span tisi ren, transcriptomics, proteomik, ak metabolomik espasyal (Figi 2). Teknoloji sa yo espere evolye, epi yo pral ajoute lòt teknoloji. Yo mete aksan sou kontwòl kalite pandan tout pwosesis ak analiz, ki gen ladan anpil atansyon sou kondisyon pre-analitik tankou manyen tisi ak depo, fyab tès, konparezon atravè teknoloji, ak chanjman ak derive nan tès sou tan.
Referans tisi ren yo
Tisi ren referans yo entèwoje lè l sèvi avèk teknoloji KPMP yo bezwen peple yon atlas ren nan sante ak bay kontèks pou maladi ren. Nefrektomi ak tisi ren donatè ki mouri yo te itilize nan etid pilòt KPMP pou optimize pwotokòl ak devlope yon premye vèsyon yon atlas referans.30,31 Sepandan, metòd akizisyon sa yo sijè a zafè ki gen ladan ischemi ki ka chanje anpil ekspresyon jèn ak pwoteyin ak metabolit. kontni nan tisi yo. Se poutèt sa, KPMP a ap devlope patenarya ak pwotokòl pou jwenn pi bon sous tisi ren referans ki an sante nan men donatè ren ki vivan ansanm ak moun ki pa gen maladi ren nan klinik ki evidan ki sibi pwosedi ren pwogrese, pou egzanp, nefrolitotomi perkutane pou nefrolitiaz izole. Tisi referans sa yo pral trete ak entèwoje lè l sèvi avèk pwotokòl KPMP epi enkli nan atlas tisi KPMP la.
Rezilta etid yo
KPMP a rann kont yon seri rezilta ki konsistan avèk objektif jeneral li yo (Tablo 3). Sa yo kòmanse ak evalyasyon risk ak benefis nan byopsi ren nan tèt li paske eksperyans ak byopsi ren nan popilasyon sib yo limite. Rezilta byopsi ren yo detèmine atravè kesyonè potansyèl yo bay patisipan yo, klinisyen yo, ak envestigatè etid yo ansanm ak siveyans ak anpil atansyon nan evènman negatif yo. Anplis de sa, devlopman yon atlas tisi ren louvri-sous ak subtip maladi ki baze sou molekilè yo konsidere kòm rezilta eksplisit nan KPMP la.
KPMP a swiv patisipan yo tou pou plis rezilta sante tradisyonèl yo, tankou pwogresyon CKD, rezilta AKI (pou patisipan AKI), ak lòt evènman sante, jan yo defini nan Tablo 4. Done pou rezilta sa yo jwenn atravè siveyans dosye sante elektwonik, USRDS la. rejis, ak endèks lanmò nasyonal la anplis vizit etid an pèsòn ak aleka. Yo fè efò konplè pou kenbe patisipan yo pou swivi klinik yo, avèk reprezantan pasyan yo nan tout KPMP yo ak konsèy kominotè sit rekritman yo jwe wòl kle nan devlope ak aplike plan konplè angajman ak retansyon.
Gwosè echantiyon
Kounye a, pa gen ase done pou kalkile estimasyon pouvwa serye oswa gwosè echantiyon ki nesesè pou reyalize objektif KPMP la. Se poutèt sa, KPMP a planifye pou enskri 200 patisipan yo, yon kantite yo jije ki an sekirite epi ki posib poutèt konpleksite pwotokòl klinik la, pandan premye faz li (jiska mitan -2022). Yo pral sèvi ak byopsi ki soti nan patisipan sa yo pou evalye sekirite, jenere premye vèsyon atlas ren referans (ansanm ak tisi referans), epi idantifye premye gwoup maladi ki baze sou mekanis. Anplis de sa, yo pral sèvi ak byopsi patisipan sa yo pou konprann varyasyon nan selil ren ki gen menm liy, ant diferan kalite selil, atravè echantiyon tisi ki soti nan menm moun nan, ant moun ki gen menm subtip maladi ren, ant subtip maladi, ak nan asosyasyon yo. soutip maladi ak rezilta klinik pou popilasyon yo etidye ak teknoloji k ap travay nan KPMP. Done sa yo pral gide kalkil gwosè echantiyon pou travay nan lavni.
Atlas ren
Yon atlas tisi ren nouvo ki karakterize kalite selil, kote, ak fonksyon nan sante ak maladi pral yon pwodwi santral nan efò KPMP. Atlas la pral entegre patoloji dijital, transcriptomics, proteomics, ak metabolomics ak done klinik, prezante yon seri kat jeyografik miltiskalè de ak twa dimansyon nan tisi ren, epi ofri zouti analiz ak vizyalizasyon pou itilizatè yo (Figi 3). Ontoloji yo pral devlope pou semantik entegre eleman sa yo epi konekte yo ak resous done konplemantè. Atlas la pral genyen done sou tisi referans klinik ki pa gen maladi pou ede konprann estrikti ak fonksyon ren yo ak nouvo detay ansanm ak seri done ki genyen rezilta patisipan KPMP ki enskri ak CKD oswa AKI, ki defini lè l sèvi avèk byopsi ren ak karakteristik klinik detaye. Yo pral itilize algorithm modèn yo pou wè istoloji dijital ak rechèch karakteristik estriktirèl an tan reyèl. Atlas ren an pral aksesib atravè kpmp.org epi li pral bay aksè a tout done trete ak anvan tout koreksyon (apre netwaye) ki te pwodwi pa KPMP a. Yo pral etabli pòtay antre pou kalite itilizatè yo prevwa souvan, tankou klinisyen, patolojis, syantis, ak pasyan yo.
Platfòm sous louvri
KPMP a te vin ansent kòm yon platfòm sous ouvè pou pataje done nouvo rapidman ak pasyan, klinisyen, ak syantis k ap mennen ankèt sou sante ak maladi ren oswa an jeneral envestige biyoloji imen. Kòm sa yo, envestigatè KPMP yo pran angajman pou fè done yo disponib le pli vit ke yo pase kontwòl kalite entèn yo, apati prentan 2020, pandan y ap pwoteje vi prive patisipan yo. Pou sa, done KPMP yo disponib pou telechaje, aksesib sou sitwèb KPMP, kpmp.org. Done ki gen risk pou yo idantifikasyon endividyèl mande pou yon akò itilizasyon done pou aksè ki endike ke yo pap fè tantativ pou re-idantifye patisipan yo. Règleman pataje done KPMP, pwotokòl, ak manyèl pwosedi yo disponib tou gratis sou sit entènèt etid la.
Pou maksimize entegrasyon, difizyon, ak kolaborasyon, KPMP a devlope epi itilize ontoloji pou klasifye tout done yo kolekte. Ontoloji yo se sistèm ki klase sentòm, siy, kondisyon, ak relasyon yo. Sèvi ak ontoloji komen yo ka fasilite konbine done atravè etid yo.32 KPMP a te pran yon wòl lidèchip nan devlope ak rafine ontoloji maladi ren. Pa egzanp, KPMP te òganize yon reyinyon ontoloji entènasyonal ki konsantre sou ren nan Seattle, WA pandan ete 2018 la.
Patenarya
KPMP ankouraje tou nouvo patenarya, tankou patenarya ak envestigatè akademik, sistèm swen sante, ak endistri. Yo mande patenarya sa yo aktivman atravè demann pou anons opòtinite finansman (https://kpmp.org/opportunitypool/) epi yo ka inisye tou atravè aplikasyon etid oksilyè pou jwenn aksè nan patisipan yo oswa echantiyon KPMP yo. Yo ofri sibvansyon vwayaj konpetitif pou prezante postè rechèch nan reyinyon Komite Dirijan KPMP, pou yo ankouraje jèn envestigatè yo pou yo aplike. Anplis de sa, KPMP fèt pou entegre ak sinèrji ak lòt efò atlas, tankou HuBMAP (https://commonfund.nih.gov/hubmap), GUDMAP (https://gudmap.org), ak Human Cell Atlas (https: //www.humancellatlas.org/). KPMP kolaborasyon ekstèn ak règleman etid oksilyè yo disponib sou kpmp.org.
Defi
Premye defi KPMP yo genyen ladan yo devlope yon nouvo pwotokòl ki an sekirite, etik, solid, posib, ak akseptab pou patisipan yo. Rapò sa a mete aksan sou aspè debaz yo nan pwotokòl sa a, ak lòt rapò pral bay plis detay konsènan angajman pasyan, pwosesis tisi ak patoloji, entèwogasyon molekilè, ak vizyalizasyon done. Anpil defi adisyonèl rete. Yo dwe kenbe kontwòl kalite pandan tout koleksyon ak analiz tisi ak done yo. Kantite fini nan tisi ren yo dwe divize pami plizyè teknoloji enfòmatif, ki gen ladan pwomèt nouvo teknoloji ki parèt pandan etid la. Yo dwe enskri sifizan kantite patisipan yo pou adrese tout sous varyasyon yo, dimansyon yo poko defini nèt. Estati tisi ren nan yon sèl snapshot nan tan dwe gen rapò ak maladi ki evolye sou tan ak rezilta klinik alontèm. Done fenotip klinik rich sou fonksyon ren pi wo pase eGFR ak albuminuria ka oblije kreye nouvo klasifikasyon maladi. Done yo pral disponib pou itilize piblik nan yon fason ki ankouraje entegrasyon ak resous konplemantè, konte sou metadata komen ak ontoloji ki mande plis devlopman.
Vizyon pou lavni
KPMP a se yon nouvo inisyativ ki ap chèche redefini ak reklasifye maladi ren komen nan konbine fenotip molekilè pwofon ak karakteristik klinik, patoloji dijital inovatè, ak rezilta klinik ki enpòtan. Done ki te pwodwi pa KPMP pral amelyore baz konesans pou yon pakèt rechèch nan nefroloji ak pi lwen, òganize nan yon atlas tisi ren epi gaye atravè yon platfòm sous louvri. Objektif tou pre tèm nan travay sa a gen ladan devlope nouvo sou-kalite maladi ren ki baze sou mekanis ki komen men eterojèn epi ede idantifye ak priyorite sib pou entèvansyon. Pwogrè sa yo ta sipòte esè klinik yo, pèmèt esè platfòm ak lòt metòd inovatè pou teste nouvo dyagnostik ak tretman.33
Nan pwosesis la, KPMP a gen pou objaktif pou redefini dyagnostik la ak konpreyansyon tou de CKD ak AKI. Li pral byen evalye wòl byopsi ren nan dyagnostik ak tretman maladi ren sa yo. Nouvo metòd analiz molekilè, patoloji dijital, teknik imaj, ak byoenfòmatik yo dwe vin estanda pou dyagnostik maladi ren yo, epi yo ka devlope nouvo pwotokòl pou diminye risk byopsi ren yo, fasilite seleksyon apwopriye pasyan yo, epi idantifye moun ki. ka benefisye pi plis nan pwosedi a. Kontribisyon sa yo ta dwe amelyore pwofil benefis-risk byopsi ren ak ogmante itilizasyon li nan pratik klinik. Pasyan tèt yo ka gen pouvwa pou mande opsyon pou yon byopsi ren nan men founisè yo. Anplis de sa, biomarqueurs ka devlope pou idantifye avèk presizyon patoloji ren. Medikaman presizyon ren ofri anpil opòtinite pou amelyore syans ak sante, epi KPMP ansanm ak inisyativ rechèch ki sanble ap ankouraje enterè nan nefroloji pou atire yon nouvo jenerasyon pou inove sou fondasyon KPMP.
Finalman, objektif KPMP a se amelyore sante pasyan ki gen ak risk pou maladi ren lè li pèmèt dyagnostik ak tretman nan nivo endividyèl. Pou reyalize objektif sa a, envestigatè KPMP yo gen entansyon fè avanse sante presizyon nan ren yo nan klasifye sougwoup maladi yo stratifye pasyan yo ki baze sou mekanis molekilè nan maladi ak idantifye selil kritik ak chemen kòm sib pou nouvo estrateji klinik. Done yo pral vizyalize ak difize atravè yon nouvo atlas tisi ren epi pataje ouvètman pou katalize nouvo apwòch dyagnostik ak terapetik pou CKD ak AKI.
Referans
1. Sant pou Kontwòl ak Prevansyon Maladi. Sit wèb sistèm siveyans maladi ren kwonik. https://nccd.cdc.gov/CKD (aksede 26 out 2019.
2. Afkarian M, Zelnick LR, Hall YN, et al. Manifestasyon klinik maladi ren pami adilt ameriken ki gen dyabèt, 1988–2014. JAMA 2016; 316(6): 602–10. [PubMed: 27532915]
3. Al-Jaghbeer M, Dealmeida D, Bilderback A, Ambrosino R, Kellum JA. Sipò pou desizyon klinik pou AKI nan lopital. J Am Soc Nephrol 2018; 29(2): 654–60. [PubMed: 29097621]
4. Kellum JA, Lameire N, Gwoup KAGW. Dyagnostik, evalyasyon, ak jesyon nan aksidan ren egi: yon rezime KDIGO (Pati 1). Crit Care 2013; 17(1): 204. [PubMed: 23394211]
5. Chawla LS, Eggers PW, Star RA, Kimmel PL. Agi blesi nan ren ak maladi ren kwonik kòm sendwòm konekte. N Engl J Med 2014; 371(1): 58–66. [PubMed: 24988558]
6. Levin A, Tonelli M, Bonventre J, et al. Global kidney health 2017 and Beyond a Roadmap for Closing laps in Care, research, and Policy. Lancet 2017; 390(10105): 1888–917. [PubMed: 28434650]
7. Fox CS, Matsushita K, Woodward M, et al. Asosyasyon mezi maladi ren ak mòtalite ak maladi ren nan fen etap nan moun ki gen ak san dyabèt: yon meta-analiz. Lancet 2012; 380(9854): 1662–73. [PubMed: 23013602]
8. Breyer MD, Susztak K. Pwochen jenerasyon terapetik pou maladi ren kwonik. Lanati Reviews Drug Discovery 2016; 15(8): 568–88. [PubMed: 27230798]
9. Genovese G, Friedman DJ, Ross MD, et al. Asosyasyon variants trypanolytic ApoL1 ak maladi ren nan Afriken Ameriken yo. Syans (New York, NY 2010; 329(5993): 841–5.
10. Bonventre JV, Yang L. Fizyopatoloji selilè nan aksidan ischemik egi nan ren. J Clin Invest 2011; 121(11): 4210–21. [PubMed: 22045571]
11. Ralto KM, Rhee EP, Parikh SM. NAD (plis) omeyostazi nan sante ren ak maladi. Revi nati Nefroloji 2020; 16(2): 99–111. [PubMed: 31673160]
12. Alpers CE, Hudkins KL. Modèl sourit nan nefropati dyabetik. Opinyon aktyèl nan nefroloji ak tansyon wo 2011; 20(3): 278–84. [PubMed: 21422926]
13. Brosius FC 3yèm, Alpers CE, Bottinger EP, et al. Modèl sourit nan nefropati dyabetik. J Am Soc Nephrol 2009; 20(12): 2503–12. [PubMed: 19729434]
14. Bonventre JV, Basile D, Liu KD, et al. AKI: yon chemen pou pi devan. Jounal klinik Sosyete Ameriken Nefroloji: CJASN 2013; 8(9): 1606–8. [PubMed: 23868899]
15. Breyer MD, Coffman TM, Flessner MF, et al. Nefropati dyabetik: yon dyalòg nasyonal. Jounal klinik Sosyete Ameriken Nefroloji: CJASN 2013; 8(9): 1603–5. [PubMed: 23788618]
16. Kaskel F, Batlle D, Beddhu S, et al. Amelyore terapi ak swen CKD: yon dyalòg nasyonal. Jounal klinik Sosyete Ameriken Nefroloji: CJASN 2014; 9(4): 815–7. [PubMed: 24509296]
17. Bonventre JV, Boulware LE, Dember LM, et al. Dyalòg nasyonal rechèch ren an: prepare pou avanse pou pi devan. Jounal klinik Sosyete Ameriken Nefroloji: CJASN 2014; 9(10): 1806–11. [PubMed: 25225184]
18. Gid pratik klinik KDIGO pou jesyon lipid nan maladi ren kwonik. Kidney Int Suppl 2013; 3(3): 259–305.
19. Hall YN, Himmelfarb J. Sistèm Klasifikasyon CKD nan epòk Medsin Precision. Clin J Am Soc Nephrol 2017; 12(2): 346–8. [PubMed: 27903598]
20. Lambers Heerspink HJ, Oberbauer R, Perco P, et al. Dwòg ki satisfè baz molekilè maladi ren dyabetik: Pont soti nan mekanis molekilè ak medikaman pèsonalize. Nephrol Dial Transplant 2015; 30 Suppl 4: iv105–12. [PubMed: 26209732]
21. Collins FS, Varmus H. Yon nouvo inisyativ sou medikaman presizyon. N Engl J Med 2015; 372(9): 793–5. [PubMed: 25635347]
22. Obama B. Remak Prezidan an sou Medsin Precision. 1 30, 2015. Disponib nan: https:// obamawhitehouse.archives.gov/the-press-office/2015/01/30/remarks-president-precision-medicine (aksede 20 novanm 2019).
23. Tavassoly I, Goldfarb J, Iyengar R. Systems byology primer: metòd debaz yo ak apwòch. Esè nan byochimik 2018; 62(4): 487–500. [PubMed: 30287586]
24. Mulder S, Hamidi H, Kretzler M, Ju W. Yon apwòch biyoloji sistèm entegre pou medikaman presizyon nan maladi ren dyabetik. Dyabèt, obezite & Metabolis 2018; 20 Siplemantè 3: 6–13.
25. Kimmel PL, Jefferson N, Norton JM, Star RA. Kijan Angajman Kominote a Amelyore Rechèch NIDDK. Clin J Am Soc Nephrol 2019; 14(5): 768–70. [PubMed: 30917992]
26. Perazella MA, Coca SG, Hall IE, Iyanam U, Koraishy M, Parikh CR. Mikwoskopi pipi asosye ak gravite ak vin pi grav nan blesi nan ren egi nan pasyan entène lopital. Clin J Am Soc Nephrol 2010; 5(3): 402–8. [PubMed: 20089493]
27. Corapi KM, Chen JL, Balk EM, Gordon CE. Konplikasyon senyen nan byopsi ren natif natal: yon revizyon sistematik ak meta-analiz. Am J Kidney Dis 2012; 60(1): 62–73. [PubMed: 22537423]
28. Moledina DG, Luciano RL, Kukova L, et al. Konplikasyon ki gen rapò ak byopsi ren nan pasyan ki entène lopital ak maladi ren egi. Jounal klinik Sosyete Ameriken Nefroloji: CJASN 2018; 13(11): 1633–40. [PubMed: 30348813]
29. Poggio ED, McClelland RL, Blank K, et al. Revizyon sistematik ak meta-analiz nan konplikasyon nan byopsi ren natif natal. CJASN [nan laprès] 2020.
30. Lake BB, Chen S, Hoshi M, et al. Yon sèl-nwayo RNA-sekans tiyo pou dechifre anatomi molekilè ak fizyopatoloji nan ren imen. Nat Komin 2019; 10(1): 2832. [PubMed: 31249312]
31. Menon R, Otto EA, Hoover P, et al. Transcriptomics sèl-selil idantifye fokal segmental glomerulosclerosis remisyon endothelial biomarkers. JCI insight 2020; 5(6).
32. Kohler S, Vasilevsky NA, Engelstad M, et al. Ontoloji fenotip imen an nan 2017. Rechèch asid nikleik 2017; 45(D1): D865–D76. [PubMed: 27899602]
33. Heerspink HJL, Perkovic V. Trial Design Innovations pou akselere pwogrè ki ka geri nan maladi ren kwonik: Deplase soti nan esè sèl nan yon platfòm kontinyèl. Clin J Am Soc Nephrol 2018; 13(6): 946–8. [PubMed: 29700075]
For more information:1950477648nn@gmail.com
