Wòl tès jenetik nan travay dyagnostik pasyan pedyat ki gen maladi ren: Eksperyans yon sèl enstitisyon Ⅱ

CES ak etid segregasyon fanmi pèmèt idantifikasyon varyant kozatif nan yon pwopòsyon enpòtan nan pasyan yo

Tout pasyan yo te sibi CES epi yo te analize pou priyorite Variant ak anotasyon apre kritè ki dekri pi wo a (Fig. 1). An jeneral, variants yo te detekte nan 154 pasyan (80.6%) ak 37 pasyan (19.4%) pa prezante okenn variants. Validasyon Sanger nan varyant yo idantifye (yo) ak etid segregasyon fanmi yo te fèt jiskaprezan nan 90 sou 154 pasyan yo (58.4%). Apwòch sa a te pèmèt nou (i) konfime variants yo idantifye pa CES nan tout ka yo, (ii) konfime segregasyon yo ak fenotip la, epi (iii) idantifye variants de novo. Pami gwoup pasyan ki CES idantifye varyasyon yo, yo te jwenn yon rapò jenetik konklizyon nan 71 (46.1%; nan 49 pasyan yo, variants yo te valide pa Sanger sekans ak etid segregasyon fanmi), pandan y ap 22 (14.3%) ak 61 ( 39.6%) pasyan yo te rete ak yon dyagnostik jenetik ensèten oswa yo te klase kòm enkonklizyon, respektivman (Fig. 3).

An jeneral, aplikasyon CES ki te swiv pa, chak fwa sa posib, etid segregasyon fanmi pèmèt nou rive jwenn yon dyagnostik jenetik nan yon pwopòsyon enpòtan nan ka yo. Sede dyagnostik la se eterojèn lè yo konsidere diferan makro-kategori maladi ak siliopati ki montre to dyagnostik ki pi wo (74.4% nan pasyan yo dyagnostike), ki te swiv pa nefrolitiyaz ak tubulopathies (45.5% ak 45%, respektivman), glomerulopathies ak CAKUT (24.2 ak 20.6). %). Makro-kategori "lòt" yo te youn ki pi etewojèn epi li te prezante pi ba pwodiksyon dyagnostik la, ak sèlman 1 pasyan ki gen yon dyagnostik jenetik sou 14 (7.1%; Tablo 1). Se pa etonan, lè yo konsidere yon istwa fanmi pozitif kont yon istwa negatif, ansyen gwoup pasyan yo te montre yon pousantaj dyagnostik ki pi wo ak 59.5% nan pasyan yo dyagnostike (Tablo 1).

KLIKE LA POU JWENN SISTANCHE MWO KALITE POUMALADI GLOMERILÈ

Distribisyon varyant ak karakteristik nan kòwòt la dyagnostike nan pasyan yo

Gade nan pasyan yo ak yon rapò jenetik konklizyon, 96 varyant nan 32 jèn yo te idantifye ak ki nan lis nan rapò jenetik pasyan yo (Fig. 4a ak dosye adisyonèl 1: Tablo S1-S6). Yon kèk konsiderasyon ka trase nan analize done yo: (i) Plizyè pasyan prezante ak plis pase yon variant swa nan menm jèn oswa nan diferan jèn, pa konsidere varyant konpoze yo eterozigòt nan jèn resesif (egzanp, #41, #43, # 109; Fig. 4a ak dosye adisyonèl 1: Tablo S2, S3). Yon pwopòsyon siyifikatif nan ka sa yo fè pati siliopati makro-kategori ak espesyalman nanmaladi ren polikistik, poze kesyon an si wi ou non varyant adisyonèl nan jèn PKD1 la ka gen yon enpak klinik, ki mennen nan yon dyagnostik pi bonè (maniskri an preparasyon). (ii) Jèn ki pi souvan mitasyon nan kòwòt la se te COL4A5 ak PKD1, ann akò ak frekans maladi Alport ak maladi ren polikistik otosomal-dominan (ADPKD). (iii) Pifò nan varyant idantifye yo se mitasyon missense (n=53; 55.2%), ki te swiv pa frameshift (n=15; 15.6%), istwa san sans (n=14; 145.6%) , ak varyant splising (n=9; 9.4%). Anplis, 5 CNV diferan yo te rapòte ki enplike jèn ki lakòz CAKUT oswa maladi glomerulèr (5.2%; Fig. 4a ak lòt fle 1: Tablo S1-S6). (iv) Nefrolitiyaz ak tubulopati te prezante pi gwo kantite varyant C5 (n=6 ak n=4, respektivman) ak pi ba kantite mitasyon C3 (n=1 chak), ki te sou okontrè trè reprezante nan siliopati (n=20). Variant C4 reprezante mitasyon ki pi pami tout makro-kategori maladi (Fig. 4b).

v) Nan rapò jenetik konklizyon yo, CES te lakòz idantifikasyon varyant patojèn C5 nan 17 pasyan (24%), ki gen anpil chans patojèn varyant C4 nan 34 (47.9%), variants nan siyifikasyon enkoni-VUS C3 nan 16 matyè (22.5%). ak nan 4 ka variants klase kòm C3/C4 (5.6%). Lè w ap gade ki kalite varyant/frekans nan pasyan yo ak mòd eritaj, majorite varyant C5 yo te mitasyon eterozigòt (n=8), ki te swiv pa omozigòt (n{=6) ak eterozigòt konpoze (n). =2) variants. Yon C5 CNV te fè pati kategori sa a. Yon modèl distribisyon menm jan an te parèt pou variants C4 ak C3, ak mitasyon eterozigòt ki pi reprezante (n=23 ak n=9, respektivman; Fig. 4c).

(vi) Pa gen diferans siyifikatif nan pousantaj dyagnostik la te make lè w ap konsidere sijè Ewopeyen yo kont sijè ki pa Ewopeyen yo, menm si li dwe pran nan tèt ou ke ansyen gwoup la reprezante gwo majorite kòwòt la. Finalman, (vii) poukont yo konsidere kategori maladi a, pi fò nan varyant yo idantifye yo te deja pibliye ak asosye ak fenotip klinik espesifik (Fig. 4d). Ciliopathies, ak an patikilye maladi ren polikistik, se te sèl sispèk prezante yon kantite siyifikatif nan varyant ki pa pibliye (13 sou 46), pwobableman paske nan pi gwo kantite varyant idantifye konpare ak lòt kategori maladi yo. Tout varyant yo idantifye yo detaye nan dosye adisyonèl 1: Tablo S1–S6.

Diskisyon

Difisil ra nan timoun yo,ZÈKgen yon enpak pwofondman negatif sou kwasans nòmal ak devlopman, konpwomèt kantite ak kalite lavi. Analiz ki pi resan yo sou pasyan adilt ak pasyan pedyatrik yo, ki te resevwa yon transplantasyon ren oswa ki enkli nan lis datant transplantasyon an oswa ki prezan nan rejis Ewopeyen Renal Association-Ewopeyen dyaliz ak Transplant Association (ERA-EDTA) endike ke jiska 27% nan yo pa dyagnostike nan moman transplantasyon an [7]. Nan liy ak done sa yo, lè nou analize Rejis Transplantasyon nan Sant Transplantasyon Nasyonal Italyen an, nou fèk rapòte ke apeprè 17.2% nan kòwòt pedyatrik la te san yon dyagnostik klinik klè [6]. Anplis de sa, lè yo konsidere diferan kategori maladi yo, gwo majorite a te afekte pa kondisyon ki ra ak jiska 50% pa yon maladi monojenik [6]. Rezilta sa yo sijere ke tès depistaj jenetik ka yon adisyon valab pou ogmante pousantaj dyagnostik la. Li reprezante tou yon zouti ki pisan pou konfime dyagnostik klinik la, ansanm ak konprann jenetik ki souliye maladi ki pi konplèks oswa sendwomik, finalman afekte pronostik, jesyon ak tretman pasyan yo.

Isit la, nou rapòte rezilta yo nan itilizasyon sistematik nan yon tès jenetik pwisan, tankou CES nan travay dyagnostik fow nan pasyan pedyatrik ki afekte nan nefropati. An jeneral, yon tès jenetik konklizyon, ki baze sou CES ki te swiv pa etid segregasyon ki baze sou Sanger, te jwenn nan 37.1% nan pasyan yo, ak yon sèten degre nan eterojenite lè yo konsidere diferan maladi makro-kategori yo. Kòm espere, ki baze sou prezantasyon klinik, pousantaj deteksyon ki pi wo yo te jwenn pou siliopati (74.4%), ki te swiv pa nefrolitiyaz (45.5%) ak maladi tubulaires (45%), pandan y ap pi fò maladi glomerulèr ak CAKUT rete pa dyagnostike. Nan ka maladi glomerulèr, yon tès jenetik negatif enpòtan poukont li paske li regle yon kòz estriktirèl pou maladi a, ak enplikasyon enpòtan pou jesyon klinik ak rezilta transplantasyon.

Done sa yo an liy ak rezilta pibliye deja, menmsi gen kèk diferans ki ka anrejistre selon gwoup pasyan yo konsidere, espesyalman pou kowòt trè omojèn sitou ki baze sou menm gwoup etnik la (Tablo 2). Li dwe remake ke anpil nan fanmi yo kote yo te idantifye yon VUS yo kounye a anba envestigasyon pou segregasyon variant, gen plis chans amelyore pèfòmans sa yo.

Rezilta sa yo souliye enpòtans yon tès jenetik ki baze sou NGS ansanm ak etid segregasyon fanmi ak/oswa tès konplemantè (egzanp, MLPA, etalaj-CGH) kòm yon pati nan workflows dyagnostik woutin yo. Anplis de sa nan enpòtans pou fè yon dyagnostik, tès sa yo pèmèt nou idantifye lòt manm fanmi ki ka pote menm varyant patojèn yo epi tou estime risk pou yo repete maladi a. Anplis, konsidere ke yon pousantaj significatif nan sa yopasyan yo bezwen transplantasyon rennan kèk pwen, disponiblite a nan yon tès jenetik tès manm fanmi yo pote enplikasyon enpòtan nan seleksyon an nan yon donatè vivan nan fanmi an.

Yon dezyèm pwen yo dwe diskite se enpòtans ki genyen nan distenge ant kòz jenetik ak ki pa jenetik pou kèk maladi. Kòm yon egzanp, nan prezans yon timoun ki gen sendwòm nefrotik ki reziste esteroyid (SRNS), li esansyèl pou eskli kondisyon ki te koze pa mitasyon nan jèn ki kode pwoteyin estriktirèl nan podosit la. Sa a ka ede rafine terapi, paske timoun ki pote varyant patojèn nan jèn podosit jeneralman pa benefisye de terapi imunosuppressive oswa predi pronostik, kòm "iminolojik" SRNS gen plis chans pou yo repete apre transplantasyon. Dyagnostik jenetik ka lakòz tou mwensbyopsi ren, patikilyèman pou pasyan ki gen glomerulopathy.

Yon twazyèm konsiderasyon enpòtan an favè tès jenetik nan workflow dyagnostik klinik pasyan pedyatrik yo se enpak tradiksyon idantifikasyon varyant jenetik yo. Vreman vre, gen jèn aksyon ki vle di ke kondisyon maladi ki koresponn yo ka trete baze sou prezans nan varyant patojèn, tankou nan ka a nan blokaj renin-angiotensin pou pasyan ki pote varyant patojèn nan COL4A3 / COL4A4 / COL4A5 jèn. Sou menm liy lan, gen yon rapò jenetik ka evite tretman initil oswa menm danjere, tankou terapi imunosuppressive pou pasyan ki pote mitasyon nan jèn kolagen-kode [5]. Anplis, li kapab itil pou pasyan yo stratifikasyon ak evalye potansyèl risk pou yo repete apre yon transplantasyon ren. Kòm yon egzanp, pasyan yo dyagnostike ak Sendwòm Uremik emolitik atipik ak yon rapò jenetik pozitif idantifye varyant patojèn nan CFH, C3 oswa CFB jèn, yo gen modere ak gwo risk pou yo repete apre transplantasyon [28]. Pou yo, administrasyon an nan eculizumab te montre rezilta siyifikatif pozitif ki pa gen okenn rplonje oswa rplonje nan yon minorite nan ka, pandan ke administrasyon li yo ka evite pou pasyan sa yo ki ba risk [28-30].

En katriyenm pwen i konsern planifikasyon familyal, akoz nou pe fer fas avek en popilasyon pedyatrik avek bann paran ki kapab anvi ganny zanfan adisyonnel. Disponibilite yon dyagnostik jenetik ka trè itil pou konsèy jenetik pwopoze koup la tout opsyon ki disponib pou yon gwosès nan lavni. Nan liy ak pwen sa a, konsidere kòwòt aktyèl la, nan 2 ka diferan yo te fè yon dyagnostik prenatal atravè sekans Sanger, tès depistaj fetis la pou varyant espesifik CES te jwenn orijinal la nan pwoband la.

Yon katriyèm pwen ki ta dwe ensiste konsènan kantite C3-VUS varyant NGS idantifye, toujou poze yon gwo dilèm sou wòl yo nan aparisyon ak pwogresyon maladi a ak fason yo ka kominike pandan konsèy jenetik. Nan dènye ane yo, yo te adrese sijè sa a lè yo mete ak konsepsyon nouvo metodoloji enfòmatik ki pran an konsiderasyon non sèlman konsèvasyon nukleotid, ak enpak pwoteyin, men tou rezo asosyasyon jèn ak koneksyon chemen. Sijesyon adisyonèl nan dechifre siyifikasyon reyèl nan varyant C3 ka soti nan analiz transcriptomic atravè deteksyon an nan ekspresyon aberan oswa mekanis splicing aberan, osi byen ke etid validasyon fonksyonèl [31, 32]. Anfen, li enpòtan pou mete aksan sou enpòtans re-analiz peryodik rapò jenetik negatif oswa enkonklizyon ak re-evalyasyon peryodik varyant C3. Kalite apwòch sa a depann sou (i) dekouvèt nouvo asosyasyon jèn-maladi/variante-maladi, (ii) mizajou enfòmasyon ki soti nan baz done ki disponib piblikman, (iii) klasifikasyon varyant jenetik ki baze sou prèv fonksyonèl, (iv) amelyorasyon nan nan zouti silico yo itilize pou aliyman done ak anotasyon variants [33]. Jiska kounye a, pa gen okenn endikasyon klè sou entèval tan an apre ki ka negatif/enkonklizyon oswa varyant C3 yo dwe re-analize pa Sosyete Italyen an Jenetik Imèn (SIGU) oswa pa direktiv Kolèj Ameriken an Jenetik Medikal ak Genomics. Sepandan, tou de enstitisyon sa yo sijere revize ka negatif oswa klasifikasyon varyant swa dapre nouvo rezilta pa laboratwa a oswa pa sous ekstèn (pa egzanp, literati oswa baz done) oswa swiv demann klinisyen yo [34–36]. Nan liy ak pwen final sa a nan diskisyon, li merite sonje ke nan kèk ka, yo te jwenn yon sèl variant nan jèn resesif trè konpatib ak fenotip klinik la. Pandan ke per se, varyant sa yo pa ka eksplike prezantasyon klinik, li enpòtan pou re-analize epi pètèt re-aliyen done sekans orijinal yo pou detèmine si yo ka jwenn yon dezyèm varyant kozatif.

Yon pwen final yo dwe diskite se enpak finansye tès sa yo sou sistèm Swen Sante Nasyonal la. Nan sistèm Italyen an, CES ki te swiv pa analiz de yon kantite limite nan jèn (<8) is in the range of 1200 euros, all included, while larger panels are approximately double the amount. While these costs may seem elevated, a timely diagnosis may avoid unnecessary additional tests, including biopsies and may lead to optimized patient care and to early identification of family members with the same disease or at risk of developing the same disease. Family segregation studies are in the range of 150 euros per variant tested per person. In our view, to make this diagnostic work efficient and sustainable, it is necessary to identify local/ regional "reference hubs" that can centralize these analyses, reducing costs and accumulating essential experience in variant calling and interpretation.

An jeneral, rezilta sa yo konfime enpòtans pou enkli tès jenetik woutin ak konsèy nan workflow dyagnostik pasyan pedyatrik ki afekte nan nefropati kote yo sispèk yon kondisyon monojenik oswa ki gen yon istwa fanmi pozitif. Pou pasyan sa yo, tès jenetik yo ta dwe konsidere nan kòmansman vwayaj dyagnostik yo, paske li ka amelyore jesyon klinik, rezèv tretman ki pa nesesè, oswa pwosedi dyagnostik, idantifye lòt manm fanmi ki kapab riske genyen menm varyant jenetik yo epi, nan ka yontransplantasyon ren, mennen nan seleksyon optimal vivan-donatè.

Referans

1. Singh P, Harris PC, Sas DJ, Lieske JC. Jenetik maladi pyè nan ren

2. ak nephrocalcinosis. Nat Rev Nephrol. 2022;18(4):224–40. Raina R, Vijayvargiya N, Khooblall A, Melachuri M, Deshpande S, Sharma D, Mathur K, Arora M, Sethi SK, Sandhu S. Pedyat atipik emolitik

3. uremic sendwòm pwogrè. Selil. 2021;10(12):3580. Kagan M, Pleniceanu O, Vivante A. Baz jenetik anomali konjenital nan ren ak aparèy urin. Pedyatr Nephrol. 2022;37:2231. 4. Torra R, Furlano M, Ortiz A, Ars E. Maladi ren jenetik kòm yon kòz anba-rekonèt maladi ren kwonik: wòl nan kle nan rapò rejis entènasyonal yo. Clin Kidney J. 2021;14(8):1879–85.

5. Patisipan KC. Jenetik nan maladi ren kwonik: konklizyon ki soti nan yon Maladi ren: Konferans pou amelyore rezilta mondyal yo (KDIGO). Kidney Int. 2022;101(6):1126–41.

6. Vaisitti T, Peritore D, Magistroni P, Ricci A, Lombardini L, Gringeri E, Catalano S, Spada M, Sciveres M, Di Giorgio A, et al. Frekans nan maladi ra ak monojenik nan moun k ap resevwa transplantasyon ògàn pedyat nan peyi Itali. Orphanet J Rare Dis. 2021;16(1):374.

7. Kramer A, Boenink R, Stel VS, Santiuste de Pablos C, Tomovic F, Golan E, Kerschbaum J, Seyahi N, Ioanou K, Beltran P, et al. Rapò Anyèl Rejis ERA-EDTA 2018 la: yon rezime. Clin Kidney J. 2021;14(1):107–23.

8. Domingo-Gallego A, Pybus M, Bullich G, Furlano M, Ejarque-Vila L, Lor ente-Grandoso L, Ruiz P, Fraga G, Lopez Gonzalez M, Pinero-Fernandez JA, et al. Itilite klinik tès jenetik nan maladi ren byen bonè: sèt jèn yo se jwè prensipal yo. Nephrol Dial Transpl. 2022;37(4):687–96.

9. Tullus K, Webb H, Bagga A. Jesyon sendwòm nefrotik ki reziste esteroyid nan timoun ak adolesan. Lancet Child Adolesc Health. 2018;2(12):880–90. 10. Kienzl-Wagner K, Waldegger S, Schneeberger S. Maladi repetisyon-epe damocles nan transplantasyon ren pou glomerulosclerosis segmantal fokal prensipal. Avant Immunol. 2019;10:1669

Sèvis sipò Wecistanche-Pi gwo ekspòtatè cistanche nan Lachin nan:

Imèl:wallence.suen@wecistanche.com

Whatsapp/Tel:+86 15292862950

Achte pou plis detay espesifikasyon:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop

KLIKE LA POU JWENN NATIRÈL ÒGANICY ÈKSTRÈ CISTANCHE AK 25% ECHINACOSIDE AK 9% ACTEOSIDE POU ENFEKSYON REN.