Otomatik mezi volim total ren nan pre-klinik Imaging sonorite mayetik pou resous done Imaging, Anotasyon, ak Kòd Sous

Kontakte:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Marie E.Edwards, Sigapriya Periyanan, Deema Anaam², Adriana V. Gregory ak Timothy L. Kline 'Divizyon Nefroloji ak Tansyon wo, Mayo Clinic, Rochester, Minnesota, USA; ak 2Depatman Radyoloji, Mayo Clinic, Rochester, Minnesota, USA

Cistanchetubulosaanpecherenmaladi, klike isit la pou jwenn echantiyon an

Objektif etid sa a se te valide yon total totalman otomatizerenmetòd mezi volim pou esè pre-klinik wonjè ki rapid, egzat, repwodiktif, epi bay resous sa yo bay kominote rechèch la. Etid wonjè ki enplike D yo enpòtan anpil pou kontwole efikasite tretman nan maladi tankou polikistik.renmaladi. Etid anvan yo itilize segmantasyon manyèl oswa semi-otomatik, ki pran tan ak potansyèlman partial. Pou devlope sistèm otomatik nou an, yon total de 150 imaj axial sonorite mayetik (MRI) ki soti nan yon varyete modèl sourit yo te manyèlman segmantasyon epi yo te itilize pou antrene / valide yon algorithm otomatik. Pou teste aplikasyon an longitudinal nan modèl la, kat mutan ak kat sourit sovaj yo te imajine sekans sou twa a douz semèn atravè MRI. Segmantasyon nan ren yo (eksepte basen ren) yo te pwodwi pa metòd la otomatik ak de lektè diferan, ak yon lektè ki repete la.

mezi. Paramèt resanblans ak analiz longitudinal yo te kalkile pou evalye pèfòmans otomatik la konpare ak metòd manyèl yo. Apwòch otomatik la pa mande okenn opinyon itilizatè, san konte yon etap final kontwòl kalite vizyèl. Paramèt resanblans nan metòd otomatik la kont segmantasyon manyèl yo te egal ak konparezon ant ak entra-lektè. Kidonk, apwòch totalman otomatize nou an ki dekri isit la ka itilize san danje nan esè longitudinal, pre-klinik ki enplike segmentasyon wonjè yo.rennan T2-MRI pondéré.

Deklarasyon tradiksyon

Etid sa a devlope yon metòd totalman otomatik pou mezire totalrenvolim pou imaj preklinik nan yon modèl sourit mutan nan polikistikmaladi renosi byen ke sourit sovaj. Etid sa a tou te etabli tou de interreader ak intrareader variability nan mezi a nan volim total ren pou D preklinik. Etid ki sanble ak apwòch algoritmik yo ka itilize pou etabli metòd pou done klinik D 'epi yo bezwen pou pronostik maladi egzat ak pran desizyon klinik. N ap bay kominote rechèch la done imaj, anons, ak kòd sous.

Yo te montre mezi volim ògàn yo korelasyon ak manifestasyon klinik ak morbidite maladi tankou totalrenvolim (TKV) nan polikistik otozomal dominanrenmaladi (PKD) l,2 epi yo itilize pou rann kont efikasite nan entèvansyon tretman. Rechèch, esè klinik, ak de pli zan pli klinik nefroloji itilize mezi sa yo pou kontwole pwogresyon maladi nan tou de modèl bèt ak pasyan yo, evalye efikasite terapi yo," epi predi rezilta yo.

Kounye a, etid preklinik ap fèt nan yon vitès san parèy pou chèche nouvo tretman pou ralanti pwogresyon PKD. Yon avantaj kle nan imaj sonorite mayetik (MRI) nan modèl bèt nan PKD se kapasite nan itilize nan D 'vivo, ki pèmèt pou etid volim longitudinal ki itilize menm bèt la. Anpil etid ki enplike 2semiotomatize,'3,14ak manyèl ki baze sou anrejistreman,9-12 segmantasyon otomatik56 sourit.renyo te fèt deja.

Anpil nan metòd yo jije kòm otomatize toujou mande itilizatè opinyon. Yon majorite syans preklinik sa yo sèvi ak segmantasyon manyèl yo, ki pran anpil tan ak koute chè epi tou prezante patipri obsèvatè yo. Se poutèt sa, laboratwa nou an te evalye varyasyon nan mezi TKV ak devlope yon pwogram analiz otomatik pou mezire TKV nan analiz sonorite mayetik nan modèl murin nan maladi a.

REZILTA

Entra-ak varyab entè obsèvatè nan segmentasyon ren manyèl

Figi 1 montre rezilta analiz Bland-Altman de TKV jan yo mezire manyèlman pa 2 lektè (interobsèvatè divèjans) ak repete mezi pa lektè 2 (intraobsèvatè divèjans). Lè yo te konpare lektè 1 ak lektè 2, te gen yon diferans mwayèn pousantaj 7.7 pousan ak yon entèval konfyans 95 pousan ± 4.5 pousan. Lè lektè 2 te fè repete mezi menm imaj la, te gen yon diferans mwayèn pousantaj -0.5 pousan ak yon entèval konfyans 95 pousan ±3.9 pousan. Analiz regresyon endike ke gen yon gwo akò nan TKV nan mitan tout metòd, ak yon valè R² ki pi gran pase oswa egal a 0.99.

Validasyon algorithm nan segmentasyon otomatik Metòd otomatik konpare ak chak lektè an relasyon ak diferans pousantaj TKV te sanble ak sa ki nan divèjans entè-ak intraobsèvatè jan yo sijere pa simityè Bland-Altman yo nan Figi 1. Lè lektè 1 yo te konpare ak metòd otomatik la, te gen yon diferans mwayèn pousantaj de 5.2 pousan ak yon entèval 95 pousan konfyans nan ± 5.8 pousan Lè lektè 2 te konpare ak metòd la otomatik, te gen yon diferans pousantaj mwayèn nan -2.5 pousan ak yon 95 pousan entèval konfyans nan ± 6.5 pousan.

Distenksyon ki genyen ant sourit sovaj ak sourit mutan

Mwayèn ak SD TKV yo te trase nan chak pwen tan pou chak metòd epi separe pa jenotip (mutant vs sovaj-tip). Jan yo wè nan Figi 2, TKV an vle di toujou pi piti nan sourit sovaj nan chak pwen tan pase nan sourit mutan. Tout 3 metòd (otomatik, lektè 1, ak lektè 2) demontre yon separasyon enpòtan nan kalite sourit nan laj 9 ak 12 semèn.

DISKISYON

Analiz volim ren nan PKD se youn nan paramèt ki pi enpòtan yo itilize kounye a pou karakterize sitiyasyon maladi a. Anvan travay nou an, pa te gen okenn altènativ a manyèlman trase ren nan sistèm modèl nan PKD. Akòz tan yo pran pou trase estrikti sa yo, ansanm ak tan ki nesesè pou fòme yon moun pou fè mezi sa yo, ak potansyèl pou varyab entè-operatè, nan etid sa a nou devlope ak valide yon metòd segmantasyon totalman otomatize pou TKV. Segmantasyon otomatik yo kalkile nan yon kesyon de minit (depann sou pouvwa informatique), tandiske segmentasyon manyèl pran 20 a 40 minit. Kontrèman ak metòd segmantasyon manyèl oswa menm semi-otomatik, metòd otomatik sa a pral pwodwi menm rezilta egzak chak fwa li aplike nan menm imaj la.

Esè preklinik souvan gen ladan tou de yon gwoup kontwòl ak gwoup tretman (yo); Se poutèt sa, li esansyèl pou metòd oto-mated la sansib ase pou detekte diferans volim ant gwoup yo kòmsadwa.7 Figi 2 montre ke segmantasyon manyèl ak segmentasyon otomatik tou de montre yon separasyon enpòtan nan kalite sovaj ak gwoup mutan nan laj 9 semèn. . Malgre ke akò a an jeneral te ekselan, konparezon vizyèl sijere dezakò minè sou si wi ou non yo enkli oswa eskli basen ren an nan yon ti pati nan tranch. Malgre ke li se pratik komen yo eskli la

Figi 1|Bland-Altman ak analiz regresyon (a,e) entè-obsèvatè ak (b,f) intra-obsèvatè volim total ren (TKV)

mezi (mezire an milimèt) anplis metòd otomatik (oto) konpare ak (c,g) lektè 1 ak (d,h) lektè 2. Trase Bland-Altman montre diferans mwayèn (liy solid) ak entèval konfyans 95 pousan. (liy pwentiye yo). Analiz regresion montre korelasyon ki genyen ant metòd konpare yo.