Spike ak Nsp6 se detèminan kle SARS-CoV-2 Omicron BA.1 atenuasyon

Variant Omicron SARS-CoV-2 la pi evazib iminitè ak mwens virulan pase lòt gwo varyant viral ki te rekonèt jiskaprezan1–12. Pwoteyin Omicron Spike (S), ki gen yon gwo kantite mitasyon, konsidere kòm prensipal chofè fenotip sa yo. Isit la nou te pwodwi chimerik rekombinan SARS-CoV-2 ki kode jèn S nan Omicron (liniyaj BA.1) nan zo rèldo yon izole SARS-CoV-2 zansèt, epi nou te konpare viris sa a ak Omicron ki sikile natirèlman. variant. Viris Omicron S-bearing la byen chape anba iminite umoral vaksen an te pwovoke, sitou akòz mitasyon nan motif reseptè-obligatwa a; sepandan, kontrèman ak Omicron ki fèt natirèlman, li efikasman repwodui nan liy selil yo ak selil prensipal nan poumon distal ki sanble. Menm jan an tou, nan sourit K{18-hACE2, byenke Omicron S ki gen viris la te lakòz maladi mwens grav pase viris zansèt la, virilans li pa te diminye nan nivo Omicron. Pli lwen envestigasyon te montre ke mutation pwoteyin ki pa estriktirèl 6 (nsp6) anplis pwoteyin S la te ase pou refè fenotip atenue Omicron. Sa a endike ke byenke chape nan vaksen nan Omicron kondwi pa mitasyon nan S, patojèn nan Omicron detèmine pa mitasyon tou de nan ak deyò nan pwoteyin S la.

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

Apati Desanm 2022, senk gwo varyasyon SARS-CoV-2, ke yo rekonèt kòm varyant enkyetid (VOC): Alpha (B.1.1.7). , Beta (B.1.351), Gamma (P.1), Delta (B.1.617.2 ak AY liyaj) ak Omicron (liniaj BA)13. Omicron se VOC ki pi resanman rekonèt, e li te dokimante an premye nan Lafrik di sid, Botswana, ak yon vwayajè soti nan Lafrik di sid nan Hong Kong nan Novanm 2021 (ID GISAID: EPI_ISL{_7605742)14, 15. Li te byen vit gaye atravè mond lan, li te deplase Variant Delta ki te dominan anvan an nan kèk semèn epi li te konte pou pifò nouvo enfeksyon SARS-CoV-2 nan mwa janvye 2022 (ref. 16–18). Omwen senk liy Omicron yo te idantifye jiskaprezan: BA.1, BA.2, BA.3, BA.4, ak BA.5. BA.1 (ki refere yo kòm Omicron) montre yon chape remakab nan enfeksyon- ak vaksen-induit iminite umoral3,19. Anplis de sa, li mwens virulan pase lòt VOC nan imen ak modèl in vivo nan enfeksyon4,5,7,11,12,20. Omicron diferan de pwototip SARS-CoV-2 izole, Wuhan-Hu-1, pa 59 asid amine; 37 nan chanjman sa yo nan pwoteyin S la, ki ogmante posiblite pou S se nan kè konpòtman patojèn ak antijenik Omicron.

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

S mitasyon afekte replikasyon Omicron nan kilti selil

Pwoteyin Omicron S la gen 30 sibstitisyon asid amine, 6 sipresyon, ak yon ensèsyon 3 asid amine nan longè, konpare ak Wuhan-Hu-1 (Done Pwolonje Fig. 1). Vennsenk nan chanjman sa yo inik nan Omicron parapò ak lòt VOC, byenke kèk nan yo te rapòte nan dlo ize ak ti varyant SARS-CoV-221,22. Pou teste wòl pwoteyin S la nan fenotip Omicron, nou te jenere yon viris recombinant chimerik ki genyen jèn S Omicron (USA-lh01/2021) ak tout lòt jèn yon zansèt SARS-CoV-2 (GISAID EPI{ {16}}ISL_2732373)23 (Done pwolonje Fig. 2a). Viris chimerik sa a, yo te rele Omi-S, te fèt lè l sèvi avèk yon fòm modifye reyaksyon sikilè ekstansyon polymerase (CPER)24 (Done pwolonje Fig. 2b) ki te bay yon viris ki trè konsantre, ki gen 0.5 × 106 –5 × 106 plak ki fòme. inite (PFU) pou chak ml, ki soti nan selil transfekte nan de jou apre transfèksyon (Done Pwolonje Fig. 2c, d), evite bezwen an pou plis anplifikasyon viral.

Figi 1|Efè S sou sinetik kwasans in vitro nan Omicron. yon Chema viris yo. S, spike; N, nukleokapsid. b–e, selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2 (b,d) ak selil Vero E6 (c,e) yo te enfekte nan yon MOI 0.01, epi a pousantaj selil N-pozitif (n=6 repitasyon) (b,c) ak liberasyon patikil enfektye yo (n=3 replike) (d,e) te detèmine pa sikometri koule ak tès plak, respektivman. f, selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2 yo te enfekte ak melanj viris nan yon rapò 1:1 pou jwenn MOI final 0.005 pou chak viris . Selil yo te fiks nan moman ki endike yo epi yo te sibi sikometri koule. Agòch, reprezantatif pwen plot; adwat, pousantaj selil ki pa enfekte, Omi-S/mCherry-enfekte, Omicron/mNeoGreen (Omicron/mNG)-enfekte ak doubl enfekte. Selil ki enfekte yon sèl yo te itilize pou konpansasyon. Ba erè, vle di ± sd (n {{20}} replike). g, Plak gwosè. Agòch, imaj reprezantatif plak yo sou selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2. Dwa, dyamèt plak yo trase kòm mwayèn ± sd nan 20 plak pou chak viris. h, Selil epitelyal iAT2 imen yo te enfekte nan yon MOI 2.5 pou 48 èdtan oswa 96 èdtan. Yo te lave bò apikal selil yo ak 1 × saline ki gen tanpon fosfat (PBS) epi yo te mezire nivo patikil viris enfektye yo pa tès plak. Ba erè, vle di ± sd (n=4 replike). Eksperyans yo te repete de fwa, ak chak repete eksperimantal ki gen 3 (b-g) oswa 4 (h) replike. Valè P yo te kalkile pa yon tès t ki pa pè ak de ke ak koreksyon Welch la. *P <0.05, **P <0.01, ***P <0.001 ak ****P <0.0001; NS, pa enpòtan. Estrateji gating pou sikometri koule yo montre nan Figi Siplemantè 1.

Premye nou te konpare efikasite enfeksyon Omi-S ak yon viris zansèt D614G ki genyen (GISAID EPI_ISL_2732373; ki te pwodwi pa CPER; aprè sa yo rele kalite sovaj (WT)) ak yon izole Omicron. (USA-lh01/2021) nan kilti selil (Fig. 1a). Pou sa, nou te enfekte ACE2- ak TMPRSS2-eksprime Caco-2 (apwe sa, ACE2/TMPRSS2/Caco-2) ak selil Vero E6 ak Omi-S, WT ak Omicron nan yon miltiplisite enfeksyon (MOI) nan 0.01, ak kontwole pwopagasyon viral pa sikometri koule ak tès fòmasyon plak. Viris WT a ak Omi-S gaye rapidman nan selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2, ki bay 89% ak 80% selil ki enfekte, respektivman, nan 24 èdtan apre enfeksyon (HPI) (Fig. 1b). Kontrèman, Omicron repwodui pi dousman, ki mennen nan 48% selil ki enfekte nan 24 hpi. Yon modèl menm jan an te wè nan selil Vero E6, nan ki 60% ak 41% nan selil yo te pozitif pou WT ak Omi-S, respektivman, nan 48 hpi, kòm opoze a 10% pou Omicron (Fig. 1c). Egzamen plak la te montre ke byenke tou de Omi-S ak Omicron pwodui nivo pi ba nan patikil viris enfektye yo konpare ak WT, tit viral Omi-S te siyifikativman pi wo pase sa yo ki nan Omicron. Nan selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2, Omi-S pwodui 5.1-pliye (P=0.0006) ak 5.5-pliye (P {{49} }.0312) plis patikil enfektye pase Omicron nan 12 hpi ak 24 hpi, respektivman (figi 1d). Menm jan an tou, nan selil Vero E6, tit viris enfektye Omi-S yo te 17-pliye (P=0.0080) ak 11-pliye (P=0.0078) pi wo. pase sa yo ki nan Omicron nan 24 hpi ak 48 hpi, respektivman (Fig. 1e). Diferans ki genyen ant viris yo te vin mwens evidan nan pwen tan pita akòz pi gwo sitotoksisite ki te koze pa Omi-S konpare ak Omicron (Done pwolonje Fig. 3a). Te ogmante efikasite replikasyon Omi-S parapò ak Omicron lè yo teste nan diferan MOI (Done pwolonje Fig. 3b). Nou te konfime plis avantaj fizik Omi-S sou Omicron pa yon tès konpetisyon dirèk. Pou sa, nou te premye pwodwi recombinant Omicron (mikwon), ki, nan analiz kilti selil nou an, imite sinetik replikasyon nan Omicron natirèl (Done pwolonje Fig. 4). Apre sa, nou te kreye mCherry ki gen Omi-S ak mNeonGreen ki gen Omicron, epi nou te vaksinen selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2 ak viris sa yo melanje nan yon rapò 1:1. Flow cytometric analiz de selil enfekte nan plizyè fwa nan enfeksyon te montre ke Omi-S / mCherry te klèman siperyè Omicron / mNeonGreen an tèm de replikasyon (Fig. 1f). Finalman, pi wo efikasite enfeksyon Omi-S te reflete tou nan gwosè plak la; byenke WT viris pwodui pi gwo plak yo (alantou 4.1 mm), gwosè a nan plak Omi-S (anviwon 2.2 mm) te double (P <0.0001) pi gwo pase sa yo ki nan plak Omicron (alantou 1.1 mm) (figi 1g). Rezilta sa yo endike ke byenke mitasyon nan pwoteyin S enfliyanse efikasite enfeksyon nan Omicron, yo pa konplètman eksplike fenotip Omicron an.

Plizyè liy prèv endike ke pwoteyin S ki enkòpore nan Omi-S te konpòte menm jan ak nan Omicron natirèl. Pou egzanp, jan sa dekri deja20,25, Omicron S te mal fennen konpare ak WT S; Lè nou konsidere ke 71% nan S nan WT viriyon te nan fòm nan cleaved, sèlman 45% ak 47% te cleaved nan Omi-S ak Omicron, respektivman (Done pwolonje Fig. 5a). Menm modèl klivaj S la te evidan nan selil ki enfekte ak viris (WT, 63% clivage; Omi-S, 33% clivage; Omicron, 42% clivage) (Done pwolonje Fig. 5b). Eksperyans sa yo te revele tou ke Omicron S te enkòpore nan patikil viris yo konpare ak WT S (S to nucleocapsid (N) rapò: 3.40 pou viris WT, 1.91 pou Omi-S ak 2.04 pou Omicron) (Done pwolonje Fig. 5a). Menm jan an tou, tou de Omi-S ak Omicron te pwodwi pi piti syncytia konpare ak viris WT a, yon obsèvasyon ki te deja rapòte pou Omicron20,26 (Done pwolonje Fig. 5c). Finalman, ki konsistan avèk literati a pibliye25, Omi-S ak Omicron te montre yon preferans pou antre kathepsinmediated, jan yo reflete pa pi wo sansiblite yo nan inhibiteur cathepsin E64d (Done pwolonje Fig. 6). Apre sa, nou te konpare sinetik replikasyon WT, Omi-S ak Omicron nan selil epitelyal nan poumon, ki fòme yon gwo sit replikasyon viral nan pasyan ki gen COVID-19 (ref. 27,28). An konsekans, nou te itilize selil tij pluripotent (iPS) ki sòti nan poumon alveolè tip 2 (iAT2) selil epitelyal (iAT2). Selil AT2 reprezante yon popilasyon selil esansyèl nan poumon distal la epi yo konstitye youn nan sib prensipal enfeksyon SARS-CoV-228,29. Nou enfekte selil iAT2, ki grandi kòm yon kilti koòdone lè-likid (ALI), nan yon MOI nan 2.5 epi kontwole sekresyon an nan pitit viral sou bò apical nan selil nan 48 hpi ak 96 hp. Nan kongriyans ak rezilta yo jwenn nan liy selil yo, viris WT a pwodui nivo ki pi wo nan patikil viris enfektye (Fig. 1h). Pami Omi-S ak Omicron, ansyen an te bay anviwon senk fwa (P=0.0008) pi wo tit viral enfektye nan 48 hp. Tit viral yo pou WT ak Omi-S diminye nan 96 dpi konpare ak 48 hp akòz efè a sitopatik (CPE) nan enfeksyon. Sepandan, pa gen okenn CPE te wè pou Omicron, ki mennen nan pwodiksyon soutni nan viriyon enfektye. An jeneral, rezilta sa yo konfime konklizyon ke mitasyon nan S pa totalman kont pou kapasite replikasyon atenue Omicron nan kilti selil.

benefis cistanche pou gason-ranfòse sistèm iminitè

Klike la a pou w wè pwodwi Cistanche Enhance Immunity

【Mande plis】 Imèl:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

Minim wòl S nan patojèn Omicron nan sourit

Pou egzamine si Omi-S montre si Omi-S montre pi wo kapasite nan vivo konpare ak Omicron, nou te envestige rezilta enfeksyon Omi-S parapò ak WT SARS-CoV-2 ak Omicron nan sourit K{18-hACE2. An akò ak literati ki te pibliye a4,5, vaksinasyon nan nen nan sourit (ki gen laj 12-20 semèn) ak Omicron (104 PFU pou chak sourit) pa te lakòz okenn pèdi pwa enpòtan, tandiske vaksinasyon ak viris WT deklanche yon diminisyon rapid nan pwa kò, ak tout sourit. pèdi plis pase 20% nan premye pwa kò yo nan 8 jou apre enfeksyon (dpi) (Fig. 2a). Miyò, 80% nan sourit ki enfekte ak Omi-S tou pèdi plis pase 20% nan pwa kò yo pa 9 dpi (Fig. 2a ak Done Pwolonje Fig. 7a). Evalyasyon nòt klinik yo (yon mezi kimilatif nan pèdi pwa, respirasyon nòmal, aparans aberan, reyaksyon redwi ak konpòtman chanje) te revele tou yon modèl menm jan an; Lè nou konsidere ke sourit ki enfekte ak Omicron te montre kèk siy maladi klinik, sante moun ki enfekte ak WT ak Omi-S rapidman deteryore, ak viris WT a ki te lakòz yon maladi ki pi grav (P=0.0102) (Fig. 2b ak done pwolonje Fig. 7b). Paske SARS-CoV-2 lakòz enfeksyon fatal nan sourit K18-hACE24 , nou konpare siviv sourit apre enfeksyon viral. Dakò ak rezilta yo nan kò-pèt pwa ak nòt klinik, WT, ak Omi-S te lakòz pousantaj mòtalite nan 100% (6/6) ak 80% (8/10), respektivman. Kontrèman, tout sourit ki enfekte ak Omicron te siviv (Fig. 2c). Rezilta sa yo, ki konsistan avèk yon piblikasyon resan30, endike ke pwoteyin S la se pa detèminan eksklizif patojèn Omicron nan sourit K18-hACE2.

Apre sa, nou te konpare pwopagasyon Omi-S ak Omicron ak WT SARS-CoV-2 nan poumon yo ak turbinates nen sourit K18-hACE2. Sourit yo (12-20 semèn fin vye granmoun) yo te defye intranazal ak 104 PFU (sèt sourit pou chak viris), ak tit viral nan poumon sourit yo te mezire nan 2 ak 4 dpi. Konfòm ak rezilta nan vitro, tit viris enfektye nan poumon sourit ki enfekte WT yo te pi wo pase sa yo detekte nan sourit ki enfekte ak de lòt viris yo (figi 2d). Miyò, sepandan, sourit ki enfekte Omi-S te pwodwi 30-pliye (P=0.0286) plis patikil viris enfektye konpare ak sourit ki enfekte Omicron a 2 dpi. Titer la diminye nan 4 dpi pou sourit ki enfekte WT- ak Omi-S, men li te montre yon tandans ogmante pou sourit ki enfekte Omicron, lonje dwèt sou posibilite pou Omicron enfeksyon modere men pèsistan nan sourit K18-hACE2. Tout twa varyant refè nan poumon yo nan sourit kenbe fenotip nan menm gwosè plak ak inoculum orijinal la, ki endike ke replikasyon nan sourit pa te gen okenn efè detekte sou jenotip nan viris sa yo (done yo pa montre).

Pou evalye patojèn viral nan poumon ak turbinates nen sourit K18-hACE2, nou te fè yon analiz istopatolojik tisi sa yo a 2 dpi. Jan nou te rapòte deja4,31, yo te detekte yon gwo iminoreaktivite tou pre-difize nan SARS-CoV -2 N pwoteyin nan alveoli nan poumon sourit ki enfekte ak viris WT (Fig. 2e). Kontrèman, enfeksyon Omi-S ak Omicron te pwodui fokis lokalize nan tach alveolatè ak mwens fokis pou Omicron konpare ak Omi-S. Fenotip ki pi make la te wè nan epithelium bwonchiolè, kote Omi-S te lakòz enfeksyon sikonferansyèl pwononse regilyèman, ak anviwon 10-15% nan bwonchiol yo te pozitif pou pwoteyin viral N nan 2 dpi, tandiske sèlman 3-5% nan bwonchiol yo te N. -pozitif pou Omicron (figi 2f). WT viris enfekte alantou 1% nan bronchioles ak nan tout ka sèlman enkli yon sèl selil epitelyal izole pou chak bronchiole. Anplis de sa, enfeksyon bronchiolè te asosye ak necrosis epitelyal nan sourit ki enfekte Omi-S, jan yo detèmine nan analiz seri ematoksilin ak eosin (H&E), alòske pa gen okenn prèv istolojik nan blesi nan Airway yo te obsève nan sourit ki enfekte Omicron oswa WT (Done pwolonje). Figi 8a,b). Turbinates nan nen sourit yo te vaksinen ak viris WT ak Omi-S tou de te genyen abondan SARS-CoV-2-selil pozitif, ki te asosye ak efè sitopatik aklè, tandiske Omicron te pwodwi ra, selil pozitif sporadik, ki pa gen okenn siy aparan nan epitelyal. blesi (Done pwolonje Fig. 8c). An jeneral, rezilta sa yo sijere ke replikasyon Omicron nan aparèy respiratwa sourit yo anpil diminye konpare ak Omi-S, sipòte konklizyon nou an ke mitasyon nan S yo se sèlman pasyèlman responsab pou patojèn atenue nan Omicron.

Mitasyon nan S ak nsp6 defini atenuasyon Omicron

Anplis pwoteyin S la, Omicron gen chanjman asid amine nan pwoteyin ki pa estriktirèl 3 (nsp3), nsp4, nsp5, nsp6, nsp14, anvlòp (E), manbràn (M), ak N pwoteyin, lè yo konpare ak viris WT la. (Done pwolonje Fig. 9a). Pou idantifye pwoteyin ki pa Spike ki enplike nan atenuasyon Omicron, nou te jenere yon gwo panèl viris chimerik ki gen etikèt fluorescent, yo chak genyen Omicron S an konbinezon ak yon pwoteyin Omicron ki pa Spike, ak rès pwoteyin ki soti nan viris WT (Extended Data). Figi 9b). Lè nou konbine Omicron S ak Omicron nsp6 (Omi-S/nsp6), nou te obsève yon gwo diminisyon nan replikasyon viral, ak sinetik enfeksyon imite sa yo ki nan Omicron nan kilti selil (Fig. 3a-d); pa gen okenn diminisyon sa yo te wè pou lòt viris chimerik. Move efikasite replikasyon nan Omi-S/nsp6 te tou kowopere pa konklizyon nou an ke tou de Omi-S/nsp6 ak Omicron te pran prèske senk a sis jou refè pa CPER, tandiske tout lòt varyant yo te refè nan de jou (done yo pa montre). Finalman, tankou Omicron, Omi-S/nsp6 te byen klè devan Omi-S nan yon tès konpetisyon dirèk (Fig. 3e).

Figi 2|Wòl S nan patojèn Omicron. a–c, sourit gason ak fi K18-hACE2 (ki gen laj 12-20 semèn) yo te resevwa vaksinasyon nan nasal ak 1 × 104 PFU nan WT (n=6 sourit), Omi-S (n=10 sourit) oswa Omicron (n {{1{{40}}}} viris). De aksyon viris ki te pwodwi endepandan yo te itilize nan eksperyans sa a. Pwa kò (a), nòt klinik (b), ak siviv (c) yo te kontwole chak jou pou 14 jou. Sourit ki te pèdi 20% nan premye pwa kò yo te euthanized. d,e, sourit K18-hACE2 yo te vaksinen nan nasal ak 1 × 104 PFU nan WT (n=14 sourit), Omi-S (n=14 sourit) ak Omicron (n {{ 20}} sourit). Yo te kolekte echantiyon nan poumon sourit ki enfekte yo nan 2 oswa 4 dpi pou detèmine tit viral (n=4 sourit) (d) oswa pou deteksyon imunohistochimik (IHC) nan pwoteyin N (n=3 sourit) (e). Nan e, imaj reprezantan IHC ki montre SARS-CoV-2 N (koulè mawon) nan alveoli (flèch) ak bronchioles (tèt flèch) nan poumon sourit nan 2 dpi yo prezante. Ba echèl, 100 µm. f, Pousantaj bronchiol N-pozitif nan poumon sourit ki enfekte (n=3 sourit) nan 2 dpi. Chak pwen reprezante yon sourit ki enfekte. Siyifikasyon estatistik yo te detèmine lè l sèvi avèk yon tès t ki pa pè ak de ke ak koreksyon Welch a (a,b,d,f) ak tès log-rank (Mantel-Cox) (c). *P <0.05, **P <0.01, ***P <0.001 ak ****P <0.0001; NS, pa enpòtan.

Nan poumon sourit K18-hACE2, tandiske Omi-S te lakòz gwo enfeksyon bronchiolè ak blesi, tou de Omicron ak Omi-S/nsp6 te montre enfeksyon diminye san okenn prèv domaj epitelyal (Fig. 3f). Konfòm ak rezilta sa yo, poumon sourit ki enfekte Omi-S/nsp6-pwodwi tit viral ki ekivalan ak sa yo wè pou rOmicron ak Omicron izole (figi 3g). Finalman, 71% nan sourit ki enfekte ak Omi-S/nsp6 siviv (Fig. 3h)-kontrèman ak pousantaj yo siviv nan sèlman 20% ki te obsève nan sourit ki enfekte ak Omi-S (Fig. 2c). An jeneral, rezilta sa yo endike ke mitasyon nan S ak nsp6 yo ase pou defini virulans atenue Omicron a. Obsèvasyon sa yo sipòte ak plis pwolonje konklizyon yo nan yon etid anvan ki montre ke mitasyon nan rejyon an 5′-UTR-nsp12, kote nsp6 abite, kontribye nan atenuasyon Omicron nan sourit K18-hACE230.

Figi 3|Mitasyon nan S ak nsp6 kondwi patogenisite Omicron.a–d, Sinetik replikasyon nan viris repòtè mNeonGreen ki endike nan selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2 (MOI=0.01) detèmine pa koule. sitometri (n=3 replike) (a,c) ak tès plak (n=3 replike) (b,d). Eksperyans yo te repete de fwa. e, selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2 yo te enfekte ak melanj viris nan yon rapò 1:1 pou jwenn MOI final 0.005 pou chak viris. . Selil yo te fikse nan moman ki endike yo epi analize pa sikometri koule. Yo montre pousantaj selil ki pa enfekte, ki pa enfekte yon sèl, ak ki enfekte doub. Selil ki enfekte yon sèl yo te itilize pou konpansasyon. Pwen done endividyèl yo trase ansanm ak mwayèn ± sd (n=3 replike). Eksperyans lan te repete de fwa. f–h, sourit K18-hACE2 yo te vaksinen nan nasal ak 1 × 104 PFU nan viris. Echantiyon nan poumon sourit ki enfekte yo te kolekte nan 2 dpi pou deteksyon IHC nan pwoteyin N (n=3 sourit) (f) oswa pou detèminasyon tit viral (n=4 sourit) (g). Nan f, imaj reprezantan H&E tach nan bronchiol N-pozitif yo montre nan ensèk. Necrosis epitelyal bronchiolè endike ak flèch. Pa gen okenn prèv nan nekwoz te wè nan bronchioles yo nan sourit ki enfekte ak Omicron oswa Omi-S/nsp6. Ba echèl, 100 µm. Graf dwat la nan f montre pousantaj bronchiol N-pozitif nan poumon sourit ki enfekte yo. Chak pwen reprezante yon sourit ki enfekte. h, Siviv sourit ki enfekte kontwole chak jou pou 14 jou. Sourit ki te pèdi 20% nan premye pwa kò yo te euthanized. Siyifikasyon estatistik yo te detèmine lè l sèvi avèk yon tès t ki pa pè ak de ke ak koreksyon Welch a (a–g) ak tès log-rank (Mantel-Cox) (h). *P <0.05, **P <0.01, ***P <0.001 ak ****P <0.0001; NS, pa enpòtan.

Pwoteyin S RBM la kondwi vaksen Omicron an

Yon gwo kantite literati te bay prèv ki montre anpil chape Omicron nan iminite umoral vaksen an pwovoke14,19. Pou defini rejyon S ki asosye ak fenotip iminitè-chape Omicron, nou te premye konpare aktivite netralizasyon en vitro nan sera de moun ki pran vaksen kont WT SARS-CoV-2 (USA-WA1/20 20), Omi-S, ak Omicron. Sera yo te kolekte nan de mwa apre dezyèm dòz mRNA-1273 (Vaksen mRNA modèn; n=12) oswa BNT162b2 (vaksen mRNA Pfizer-BioNTech; n=12) te enkli (Done pwolonje). Tablo 1). Nou te fè yon tès netralizasyon multisik lè l sèvi avèk yon anviwònman kote viris la ak sera netralize yo te prezan tout tan, imite sitiyasyon an nan yon moun seropozitif. Tout sera mal netralize Omicron, ak yon 11.1-pliye (ranje: 4.4-pliye a 81.{2-pliye; P <0.0001) pi ba mwatye-maksimòm dilution neutralizing (ND50) pou Omicron konpare ak WA1 (Fig. 4a, b). An reyalite, alantou 80% nan echantiyon pa t 'konplètman netralize Omicron nan konsantrasyon ki pi wo a teste (Done pwolonje Fig. 10). Miyò, Omi-S te montre valè ND50 ki idantik ak Omicron (11.5-pliye pi ba pase WA1; P <0.0001) (Fig. 4a, b), sijere ke pwoteyin Omicron S la, lè yo enkòpore nan yon WT. viris, konpòte menm jan li fè nan Omicron.

Figi 4|Wòl S nan rezistans iminitè Omicron. Valè ND50 pou WA1, Omi-S, ak Omicron nan sera nan men moun ki te resevwa de vaksen vaksen Moderna (donatè 1–12) oswa Pfizer (donatè 13–24) (yo bay plis detay sou sera nan Pwolonje). Done Tablo 1; koub endividyèl yo montre nan Done Pwolonje Fig. 1 0). b, Trajèktè nan valè ND50 kont WA1, Omi-S ak Omicron (done yo ki soti nan yon trase). Chanjman pliye nan valè ND50 yo endike (n=24 echantiyon serom). c–f, Chema viris chimerik (gòch; c,d) ak viris mutan (gòch; e,f). Nimero asid amine pou mutan WA1 nan e baze sou sekans WA1 S, tandiske nimero pou mutan Omicron nan f baze sou sekans Omicron S la. Sis nan 24 sera yo (3 soti nan Moderna ak 3 soti nan Pfizer) yo te teste. Chak echantiyon serom reprezante pa yon pwen nan yon koulè espesifik. Done yo trase kòm chanjman pliye viris paran an. Siyifikasyon estatistik yo te detèmine lè l sèvi avèk yon tès t ki pa pè ak de ke ak koreksyon Welch la. *P <0.05, **P <0.01, ***P <0.001 ak ****P <0.0001; NS, pa enpòtan.

Pwoteyin SARS-CoV-2 S la gen de domèn: domèn S1, ki reyaji ak reseptè ACE2, ak domèn S2, ki responsab fizyon manbràn32. Nan domèn S1 la, gen yon domèn N-tèminal (NTD) ak yon domèn reseptè-obligatwa (RBD), ki gen motif reseptè-obligatwa (RBM) ki fè kontak dirèk ak reseptè ACE233. NTD nan Omicron S gen 11 chanjman asid amine, ki gen ladan 6 sipresyon ak yon sèl 3-ensèsyon asid amine-long, tandiske RBD a gen 15 mitasyon, 10 nan yo ki konsantre nan RBM la (Pwolonje). Done Fig. 1). Tou de NTD ak RBD lame netralize epitopes34–37, men RBD la se iminodominan epi li reprezante sib prensipal aktivite netralize ki prezan nan SARS-CoV-2 sera iminitè37,38. Pou detèmine si fenotip rezistans netralizasyon Omicron ki te koze pa mitasyon nan yon domèn patikilye nan pwoteyin S la, nou te pwodwi de gwoup viris chimerik. Premye gwoup la te gen viris WA1 ki te pote NTD, RBD oswa RBM nan Omicron (Fig. 4c), ak dezyèm gwoup la te konpoze de viris Omi-S ki te pote NTD, RBD oswa RBM nan WA1 (Fig. 4d). Egzamen netralizasyon an te montre ke mitasyon nan RBM a te kòz prensipal rezistans Omicron nan iminite umoral ki te pwovoke vaksen an: ranplase RBM nan WA1 ak sa ki nan Omicron diminye ND50 a pa 5. 4-pliye (P <0.0001), epi, kontrèman, ranplase RBM nan Omi-S ak sa ki nan WA1 ogmante ND50 a pa 5. 6- pliye (P=0.0003) (Fig. 4c, d). Lefèt ke okenn nan viris RBM-swap yo te reyalize diferans anviwon 11-pli ki te wè ant WA1 ak Omi-S sijere ke mitasyon nan lòt pati nan S yo kontribye tou nan rezistans vaksen an.

Pou mennen ankèt sou si wi ou non mitasyon espesifik nan Omicron RBM kondwi vaksen chape, nou te pwodwi de panno adisyonèl nan viris recombinant, youn ak WA1 S pote mitasyon Omicron RBM, swa poukont oswa nan konbinezon (Fig. 4e), ak lòt la ak Omicron S manke menm bagay la. seri mitasyon (figi 4f). De mutan WA1 - mutan 3 (ak yon sibstitisyon E484A) ak mutan 4 (ki gen yon gwoup senk sibstitisyon Q493R, G496S, Q498R, N501Y ak Y505H) - te montre yon diminisyon modere men estatistik siyifikatif 1.4-pliye ( P=0.0002) ak 1.8- pliye (P=0.0003) nan valè ND50, respektivman, konpare ak WA1 (Fig. 4e). Opoze a te obsève lè mitasyon sa yo te retire nan Omicron S; mutan Omicron 3 (ki manke sibstitisyon an E484A) ak mutan 4 (ki manke Q493R, G496S, Q498R, N501Y ak Y505H) te gen 1.9-pliye (P=0.0082) ak 3.{{38 }} pliye (P=0.0025) pi wo valè ND50 konpare ak Omicron (Fig. 4f). Kòm okenn nan mutan yo te kaptire fenotip Omicron an jeneral, nou sipoze ke chape vaksen an se yon efè kimilatif nan mitasyon distribye sou longè pwoteyin S la. Li posib ke mitasyon chanje konfòmasyon Omicron S nan yon fason ke pi fò nan epitop netralize iminodominan yo detounen epi yo vin pa disponib pou netralizasyon.

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

Diskisyon

Etid sa a bay enfòmasyon kle sou pwoteyin viral ki kontribye nan patojèn SARS-CoV-2. Nou montre ke S, pwoteyin ki pi mitasyon nan Omicron, gen yon wòl enkonplè nan atenuasyon Omicron. Nan tès enfeksyon selil ki baze sou, viris Omi-S montre yon efikasite replikasyon entèmedyè ant viris zansèt la ak Omicron. Menm jan an tou, nan sourit K18-hACE2, Omi-S diferansye ak Omicron ki pa fatal epi mennen nan 80% mòtalite; viris zansèt la lakòz 100% mòtalite nan sourit sa yo. Miyò, lè nou konbine mitasyon S ak mitasyon nan nsp6, viris la te montre yon fenotip atenue ki sanble anpil ak Omicron, ki endike ke de pwoteyin sa yo se gwo detèminan patojèn Omicron. Etid nan lavni yo pral dechifre mekanis (yo) pa ki mitasyon nsp6 afekte replikasyon viral.

Youn nan limit potansyèl etid nou an se itilizasyon sourit K18-hACE2 pou etid patojèn olye de modèl primat ki gen plis resanblans ak moun39. Sepandan, li ta dwe remake ke sourit K18-hACE2 yo se yon modèl ki byen etabli pou mennen ankèt sou fenotip letal SARS-CoV-24,31. Malgre ke sourit sa yo devlope patoloji nan poumon apre enfeksyon SARS-CoV-2, mòtalite yo te asosye ak patisipasyon nan sistèm nève santral la akòz neroenvazyon viral ak difizyon31,40. Lefèt ke enfeksyon nan sourit K18-hACE2 ak Omi-S, men se pa ak Omicron, lakòz siy newolojik (pa egzanp, pwèstans koube ak yon mank de repons) sijere ke pwopriyete a neroinvazyon konsève nan Omi-S, pwobableman kòm yon rezilta nan pi wo efikasite replikasyon li yo, e ke detèminan yo nan pwopriyete sa a kouche deyò nan pwoteyin S la. Konklizyon sa yo ki konsistan avèk yon etid anvan ki montre ke hamster ki enfekte ak Omi-S koule siyifikativman plis viris ak pèdi plis pwa pase sa yo ki enfekte ak Omicron, sijere ke mitasyon deyò nan S kontribye nan patojèn nan atenue nan Omicron41.

Nou te jwenn ke byenke viris zansèt la sitou repwodui nan alveoli nan poumon epi li lakòz sèlman enfeksyon ra nan bronchioles nan sourit K18-hACE2, tou de Omi-S ak Omicron montre yon tandans ogmante repwodui nan epitelyal bronchiolè a, ki endike ke S la. pwoteyin se responsab pou twopim nan chanje. Mekanis dèyè switch sa a se enkoni, men li posib ke Omicron S pi efikas pase WT S lè l sèvi avèk cathepsin B oswa cathepsin L (ref. 25,42,43), ki fòme yon chemen antre viral aktif nan bronchioles ak lòt chemen pou respire. selil41. Kontrèman, antre SARS-CoV-2 nan selil epitelyal alveyòl yo se sitou kondwi pa TMPRSS2 (ref. 28,44), ki Omicron S ensufizant nan itilize25,45, ki mennen nan enfeksyon pòv nan selil sa yo4,5. ,25,43. Konklizyon sa yo ka eksplike patoloji nan poumon atenue ki te koze pa Omicron.

benefis cistanche-ranfòse sistèm iminitè

Omicron nsp6 gen de sit ki chanje parapò ak pwototip SARS CoV-2 Wuhan-Hu{-1 izole: yon sipresyon twa-amino-asid (LSG, pozisyon 105-107) ak yon sibstitisyon I189V (Done pwolonje Fig. . 9). Yo dekri plizyè fonksyon nsp6 nan replikasyon coronavirus; chèf pami yo se byogenesis nan vesik doub manbràn (DMVs), ki reprezante sit la nan sentèz RNA viral46-50. Yon etid anvan te montre ke SARS-CoV-2 DMV yo sitou pwodwi pa aksyon konsète twa pwoteyin viral: nsp3, nsp4, ak nsp6; byenke nsp3 ak nsp4 yo ase pou fòmasyon DMV yo, nsp6 konekte DMV sa yo ak retikul andoplasmik la epi kanalize kominikasyon esansyèl ant estrikti sa yo46. Kit konstelasyon mitasyon nan Omicron nsp6 afekte fòmasyon oswa fonksyon DMV bezwen plis envestigasyon. Nsp6 aktive tou NLR3-pwodiksyon cytokine depandan ak piroptoz nan poumon pasyan ki gen COVID-19, ki sèvi kòm yon faktè virulans kle47. Men, yon varyant nsp6 ki asosye ak COVID asymptomatik-19 te montre yon kapasite redwi pou pwovoke piroptoz47, sa ki fè espekilasyon ke mitasyon nan Omicron nsp6 ka enfliyanse tou piroptoz. Etid mekanistik detaye yo pral oblije diseke efè a nan mitasyon Omicron sou fonksyon yo nan nsp6.

Li se kounye a enkoni si mitasyon nan S ak nsp6 travay an konsè youn ak lòt pou kondwi atenuasyon Omicron. Etandone ke Omicron S te montre yon pi gwo predileksyon pou bronchioles, li posib ke S ki responsab pou twopism viral ki chanje, tandiske mitasyon ki pa Spike-ki gen ladan sa yo nan nsp6-se sèlman adaptasyon nan anviwònman an tisi chanje. Li vo mansyone ke byenke nsp6 sanble pi gwo pwoteyin ki pa Spike dèyè Omicron atenuasyon, kontribisyon an nan lòt pwoteyin viral pa ka konplètman regle. Eksperyans vitro ki egzamine wòl mitasyon ki pa Spike yo te fèt nan selil ACE2/TMPRSS2/Caco-2. Sèvi ak lòt kalite selil ki pi iminitè-konpetan ta ka revele efè lòt mitasyon ki pa Spike tou. Anplis de sa, viris chimerik nou yo te genyen Omicron S ansanm ak yon sèl pwoteyin ki pa Spike nan yon moman, ki limite entèraksyon epistatik alontèm ant mitasyon nan plizyè pwoteyin viral.

benefis cistanche pou gason-ranfòse sistèm iminitè

Etid nou an montre ke mitasyon nan RBM nan Omicron S yo se detèminan prensipal yo nan chape Omicron a soti nan antikò netralize, byenke mitasyon nan lòt rejyon nan S yo kontribye tou. Nan RBM a, nou idantifye de hotspots nan mitasyon, ki bay Omicron S kapasite nan reziste netralizasyon: youn pote sibstitisyon an E484A ak lòt la ki gen yon gwoup nan senk sibstitisyon-Q493R, G496S, Q498R, N501Y, ak Y505H. Yo montre sibstitisyon E484A a chape netralizasyon pa sera51 konvalesans. Anplis, modèl estriktirèl sijere ke kèk antikò monoklonal terapetik etabli pon sèl ki trè estab ak rezidi E484 la, totalman pèdi obligatwa yo lè rezidi sa a chanje nan A oswa apre chanjman Q493K ak Y505H52. Menm jan an tou, kat rezidi RBM ki dirèkteman kominike avèk 49 antikò netralize li te ye te revele N440, G446, S477, ak T478 kòm entèraktè frekans ba, N501, Y505, ak Q498 kòm entèraktè frekans mwayen, ak E484 ak Q493 kòm entèraktè frekans segondè53. , nan liy ak rezilta tès netralizasyon nou an. Miyò, byenke potansyèl antikò-obligatwa Omicron S la gen pwoblèm54, kapasite reseptè-obligatwa li yo se entak. An reyalite, Omicron RBD a gen yon pi gwo afinite pou ACE2 parapò ak Wuhan-Hu-1 ak Delta RBDs25. Sa a endike ke mitasyon nan Omicron S yo te evolye nan yon fason ke yo anpeche antikò obligatwa men prezève angajman reseptè yo. Sa a ouvè posiblite pou vize rejyon S yo ki konsève ak estriktirèl ki gen kontrent ki enplike nan rekonesans ACE2 pou konsepsyon vaksen gwo spectre pou kontwole pandemi COVID-19.

referans

1. Liu, L. et al. Levasyon antikò frapan manifeste pa variant Omicron SARS-CoV-2. Nature 602, 676–681 (2022).

2. Planas, D. et al. Konsiderab chape nan SARS-CoV-2 Omicron nan netralizasyon antikò. Nature 602, 671–675 (2022).

3. Schmidt, F. et al. Netralizasyon Plasma Variant Omicron SARS-CoV-2. N. Engl. J. Med. 386, 599–601 (2022).

4. Shuai, H. et al. Atenuasyon replikasyon ak patojèn SARS-CoV-2 B.1.1.529 Omicron. Nature 603, 693–699 (2022).

5. Halfmann, PJ et al. SARS-CoV-2 Omicron viris lakòz maladi atenue nan sourit ak hamster. Nature 603, 687–692 (2022).

6. Lewnard, JA et al. Rezilta klinik ki asosye ak SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) varyant ak BA.1/BA.1.1 oswa BA.2 enfeksyon subvariant nan Sid Kalifòni. Nat. Med. 28, 1933–1943 (2022).

7. Wolter, N. et al. Evalyasyon bonè nan severite klinik SARS-CoV-2 omicron variant nan Lafrik di sid: yon etid lyen done. Lancet 399, 437–446 (2022).

8. Ulloa, AC, Buchan, SA, Daneman, N. & Brown, KA Estimasyon severite SARS-CoV-2 Omicron varyant nan Ontario, Kanada. J. Am. Med. Asoc. 327, 1286–1288 (2022).

9. Uraki, R. et al. Karakterizasyon SARS-CoV-2 Omicron BA.4 ak BA.5 izole nan wonjè yo. Nature 612, 540–545 (2022).

10. Uraki, R. et al. Karakterizasyon ak sansiblite antiviral SARS-CoV-2 Omicron BA.2. Nature 607, 119–127 (2022).

11. Dyer, O. Covid-19: Omicron ap lakòz plis enfeksyon men mwens admisyon nan lopital pase Delta, done Sid Afriken yo montre. Br. Med. J. 375, n3104 (2021).

12. Sigal, A. Maladi pi modere ak Omicron: èske se viris la oswa iminite ki te deja egziste a? Nat. Rev Immunol. 22, 69–71 (2022).

13. KI MOUN. Tracking SARS-CoV-2 variants https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS CoV-2-variants/ (2022).

14. Cele, S. et al. Omicron anpil men enkonplètman chape Pfizer BNT162b2 netralizasyon. Nature 602, 654–656 (2022).

15. Gu, H. et al. Transmisyon pwobab SARS-CoV-2 omicron variant nan otèl karantèn, Hong Kong, Lachin, Novanm 2021. Emerg. Enfekte. Dis. 28, 460–462 (2022).

16. Iuliano, AD et al. Tandans nan severite maladi a ak itilizasyon swen sante pandan peryòd varyasyon Omicron byen bonè konpare ak peryòd transmisyon segondè SARS-CoV-2 anvan yo - Etazini, Desanm 2020–Janvye 2022. Morb. Mòtèl. Wkly Rep. 71, 146–152 (2022).

17. CDC. COVID Data Tracker https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions (2022).

18. Taylor, L. Covid-19: Omicron ogmante rekò chak semèn nan enfeksyon mondyal. Br. Med. J. 376, o66 (2022).

19. Dejnirattisai, W. et al. SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 mennen nan chape toupatou nan repons antikò netralize. Selil 185, 467–484 (2022).

20. Suzuki, R. et al. Fuzogenisite atenue ak patojèn nan SARS-CoV-2 Omicron variant. Nature 603, 700–705 (2022).

21. Smyth, DS et al. Swiv enskripsyon SARS-CoV-2 yo detekte nan dlo ize Vil Nouyòk. Nat. Komin. 13, 635 (2022).

22. Kirby, AE et al. Nòt ki soti nan jaden an: prèv bonè nan varyant SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) nan dlo ize kominotè-Etazini, Novanm–Desanm 2021. Morb. Mòtèl. Wkly Rep. 71, 103–105 (2022).

23. Herrmann, A. et al. Klonaj yon jenom SARS-CoV-2 san pasaj ak mutajenèz lè l sèvi avèk rekonbinasyon wouj. Ent. J. Mol. Sci. 22, 10188 (2021).

24. Liu, G. & Gack, MU Yon metòd optimize ki baze sou reyaksyon polymerase ekstansyon sikilè pou analiz fonksyonèl SARS-CoV -2. Pre-enprime nan https://doi.org/10.1101/2022.11.26.518005 (2022).

25. Meng, B. et al. Chanje itilizasyon TMPRSS2 pa SARS-CoV-2 Omicron afekte tropism ak fusogenicity. Nature 603, 706–714 (2022).

26. Willett, BJ et al. SARS-CoV-2 Omicron se yon variant iminitè ak yon chemen antre selil ki chanje. Nat. Microbiol. 7, 1161–1179 (2022).

27. Martines, RB et al. Patoloji ak patojèn SARS-CoV-2 ki asosye ak maladi coronavirus fatal, Etazini. Emerg. Enfekte. Dis. 26, 2005–2015 (2020).

28. Huang, J. et al. Enfeksyon SARS-CoV-2 nan selil souch pluripotent ki sòti nan selil alveolaire moun nan poumon tip 2 lakòz yon repons rapid enflamatwa epithelial-intrinsèk. Cell Stem Cell 27, 962–973 (2020).

29. Mulay, A. et al. Enfeksyon SARS-CoV-2 nan epitelyal prensipal nan poumon imen pou modèl COVID-19 ak dekouvèt dwòg. Rep. Selilè 35, 109055 (2021).

30. Liu, S., Selvaraj, P., Sangare, K., Luan, B. & Wang, TT Spike diminisyon endepandan pwoteyin nan SARS-CoV -2 Variant Omicron nan sourit laboratwa. Rep. Selilè 40, 111359 (2022).

31. Carossino, M. et al. Neurodiseminasyon fatal ak tropism SARS-CoV-2 nan sourit K{18-hACE2 depann sèlman pasyèlman sou ekspresyon hACE2. Viris 14, 535 (2022).

32. Huang, Y., Yang, C., Xu, XF, Xu, W. & Liu, SW Pwopriyete estriktirèl ak fonksyonèl nan SARS CoV-2 Spike pwoteyin: potansyèl devlopman dwòg antivirus pou COVID-19 . Acta Pharmacol. Sin. 41, 1141–1149 (2020).

33. Lan, J. et al. Estrikti domèn reseptè-obligatwa SARS-CoV-2 ki mare ak reseptè ACE2 la. Nature 581, 215–220 (2020).

34. Chi, X. et al. Yon antikò imen netralize mare nan domèn N-tèminal pwoteyin Spike SARS-CoV-2. Syans 369, 650–655 (2020).

35. Voss, WN et al. Rekonesans IgG prensipal, pwoteksyon ak konvèjan nan epitopes ki pa RBD SARS-CoV-2. Syans 372, 1108–1112 (2021).

36. Premkumar, L. et al. Domèn obligatwa reseptè a nan pwoteyin Spike viral la se yon sib iminodominan ak trè espesifik nan antikò nan pasyan SARS-CoV-2. Sci. Imunol. 5, eabc8413 (2020).

37. Ju, B. et al. Antikò netralize imen ki lakòz enfeksyon SARS-CoV-2. Nature 584, 115–119 (2020).

38. Piccoli, L. et al. Kat jeyografik netralize ak sit iminodominan sou domèn reseptè-obligatwa SARS-CoV-2 spike pa seroloji segondè rezolisyon ki gide estrikti. Selil 183, 1024–1042 (2020).

39. Chang, MC, Hild, S. & Grieder, F. Modèl primate nonhuman pou rechèch SARS-CoV-2: konsidere altènativ pou makak. Laboratwa Anim. 50, 113–114 (2021).

40. Kumari, P. et al. Neuroinvasion ak ansefalit apre inokulasyon nan nasal SARS CoV-2 nan sourit K{18-hACE2. Viris 13, 132 (2021).

41. Peacock, TP et al. Chemen antre ki chanje ak distans antijenik kat variant SARS-CoV-2 Omicron pou separe domèn pwoteyin Spike. Pre-enprime nan https://doi.org/ 10.1101/2021.12.31.474653 (2022).

42. Padmanabhan, P. & Dixit, NM Modélisation ki jan itilizasyon chanjman nan chemen antre selil pa SARS-CoV-2 Omicron variant la ka afekte efikasite ak sinèrji TMPRSS2 ak inhibiteurs cathepsin B/L. Pre-enprime nan https://doi.org/10.1101/2022.01.13.476267 (2022).

43. Hui, KPY et al. SARS-CoV-2 Omicron varyant replikasyon nan bronch imen ak nan poumon ex vivo. Nature 603, 715–720 (2022).

44. Grau-Exposito, J. et al. Evalyasyon SARS-CoV-2 antre, enflamasyon ak nouvo terapi nan selil tisi nan poumon imen. PLoS Pathog. 18, e1010171 (2022).

45. Zhao, H. et al. Variant Omicron SARS-CoV-2 la montre replikasyon ak aktivite fizyon mwens efikas lè yo konpare ak variant Delta nan selil TMPRSS2-eksprime yo. Emerg. Mikwòb Enfekte. 11, 277–283 (2022).

46. ​​Ricciardi, S. et al. Wòl NSP6 nan byogenesis òganèl replikasyon SARS-CoV-2. Nature 606, 761–768 (2022).

47. Solèy, X. et al. SARS-CoV-2 pwoteyin ki pa estriktirèl 6 deklanche NLRP3-piroptoz depandan nan vize ATP6AP1. Lanmò selil diferan. 29, 1240–1254 (2022).

48. Cottam, EM, Whelband, MC & Wileman, T. Coronavirus NSP6 mete restriksyon sou ekspansyon otophagosome. Autophagy 10, 1426–1441 (2014).

49. Benvenuto, D. et al. Analiz evolisyonè SARS-CoV-2: ki jan mitasyon nan pwoteyin ki pa estriktirèl 6 (NSP6) ka afekte otofaji viral. J. Enfekte. 81, e24–e27 (2020).

50. Gosert, R., Kanjanahaluethai, A., Egger, D., Bienz, K. & Baker, SC RNA replikasyon viris epatit sourit pran plas nan vesik doub manbràn. J. Virol 76, 3697–3708 (2002).

51. Liu, Z. et al. Idantifikasyon mitasyon pike SARS-CoV-2 ki diminye netralizasyon monoklonal ak antikò serik. Cell Host Microbe 29, 477–488 (2021).

52. Shah, M. & Woo, HG Omicron: yon varyant SARS-CoV-2 ki gen anpil mitasyon montre pi fò lyezon ak ACE2 epi li sove antikò terapetik COVID-19 ki apwouve yo. Devan. Imunol. 12, 830527 (2021).

53. Ye, G., Liu, B. & Li, F. Estrikti Cryo-EM nan yon ectodomain pwoteyin omicron Spike SARS-CoV-2. Nat. Komin. 13, 1214 (2022).

54. Carreno, JM et al. Aktivite konvalesans ak serom vaksen kont SARS-CoV-2 Omicron. Nature 602, 682–688 (2022).