SARS-CoV-2-Repons iminitè espesifik ak patojèn COVID-19 Pati 2
Apr 26, 2023
4. Faktè patojèn SARS-CoV-2 Simonte repons IFN nan premye etap envazyon viral yo.
Repons selil la nan enfeksyon inisye pa viral PAMPs, ki rekonèt pa PRR, ki te swiv pa aktivasyon nan molekil siyal en tankou pwoteyin adaptè MAVS ak MyD88, kinas TBK1, IKK, faktè transkripsyon IRF3, NF-κB, pwoteyin activator 1 (AP). -1), ak lòt moun, ki lakòz gwo pwodiksyon IFN-I-III ak estrès selilè pro-enflamatwa an jeneral.
Yo refere yo kòm pwodiksyon IFN prensipal. Rezilta premye eksitasyon PRR a nan selil yo se yon bouk fidbak pozitif nan fòm repons entèferon an. IFN-I-III aktive chemen siyal ki enplike kinas Tyk2 (tyrosine kinase 2) ak Jak1 (Janus kinase 1), ki lye dirèkteman ak domèn intraselilè de IFN-I (IFNAR1/IFNAR2) ak IFN-III (IL{). {10}}R2/IFNLR1) chenn. Konplèks faktè transkripsyon ISGF3 (STAT1-STAT{2-IRF9) se konsa aktive epi antre nan nwayo selil la, aktive jèn ISG yo [148]. Yon etid resan te demontre prezans STAT1-mekanis endepandan deklanchman pwomotè ISG (atravè lyezon ak ISRE—eleman entèferon-stimile repons), atravè konplèks faktè transkripsyon STAT2-IRF9 ak STAT{{22} } STAT2-IRF9, ki lye tou ak fonksyon reseptè IFN yo (IFN-R) [149].
Nan sistèm iminitè imen an, tirozin kinas yo patisipe nan plizyè pwosesis fizyolojik ki gen rapò ak iminitè. Pou egzanp, nan pwosesis aktivasyon selil B ak selil T, deklanchman tirozin kinaz nesesè; nan iminite timè, tirozin kinaz tou jwe yon wòl enpòtan. Anplis de sa, tirozin kinaz yo patisipe tou nan aktivite iminitè lòt selil, tankou makrofaj, selil asasen natirèl, selil dendritik, elatriye. Se poutèt sa, tirozin kinaz jwe yon wòl enpòtan anpil nan sistèm iminitè imen an epi li jwe yon wòl iranplasabl nan kenbe la sante nan kò a ak anpeche maladi. Se pa sèlman sa, men nou ta dwe tou peye atansyon sou amelyore iminite nan lavi chak jou nou an. Sa a enpòtan menm jan li ye. Cistanche ka amelyore iminite, paske Cistanche gen yon varyete de konpozan biyolojik aktif, tankou polisakarid, de dyondyon, ak Huang Li. elatriye engredyan sa yo ka ankouraje selil divès kalite nan sistèm iminitè a epi ogmante aktivite iminitè yo.
Klike sou sipleman cistanche deserticola
Anplis de sa, pwodwi ekspresyon ISG (OAS, IFITM, ak lòt moun) pwoteje selil yo kont enfeksyon coronavirus nan degrade RNA viral ak diminye pénétration viris [150]. Anplis, IFN-IR yo eksprime prèske tout kote, men IFN-III-R sèlman yo jwenn nan selil ki liy baryè epitelyal la [151].
An jeneral, tou de pwodiksyon an nan IFN-I-III ak transmisyon ki vin apre nan siyal segondè pa yo pou devlopman nan estrès selilè antiviral yo enpòtan anpil pou kontwole devlopman nan etap bonè nan enfeksyon coronavirus. Simonte pwosesis iminite natirèl ki depann de IFN yo se yon estrateji envazyon viral komen, epi COVID-19 pa gen okenn eksepsyon. Anpèchman nan pwosesis sa yo, nan vire, se yon avantou pou envazyon viral. Pwen prensipal yo nan anpèchman yo enkli:
(1) Anpèchman fòmasyon ak fonksyon PRR ki rekonèt SARS-CoV-2 RNA.
(A) Pwoteyin ki pa estriktirèl nsp14 (N-7-methyltransferase) ak nsp16 (2-O{0 -methyl transferase) -CoV ka modifye RNA viral pou anpeche PRR ak IFIT1 rekonèt li. (pwoteyin entèferon pwovoke ak repete tetratricopeptide 1, ki anpeche replikasyon viral ak inisyasyon tradiksyon) [152,153]. Faktè nsp16 a, ansanm ak nsp10, methylate 50 pwen mRNA viral la pou imite mRNA lame a [154,155].
(B) Faktè nsp1 bloke plizyè pwoteyin selil, ki gen ladan PRR antiviral, pou yo te sentetize sou ribosome, pandan y ap pwoteyin N ak M mare ak anpeche RIG-I. (Tablo 2).
(2) Anpèchman deklanchman IRF3 ak translokasyon nan nwayo selil oswa klivaj, ki inisye pwodiksyon IFN-I-III. Anpil nan pwoteyin SARS-CoV-2 (nsp1, nsp3, nsp5, nsp6, nsp9, nsp13, nsp14, nsp15, orf3b, orf6, orf9b, N, ak M) ka bloke yon varyete chemen siyal, tankou RLR. /MAVS/TRAF3/(IKK ak TBK1)/(IRF3, NF-κB)/ (Figi 3).
(3) Anpèchman sentèz IFN sou ribosomes (nsp1, Tablo 2).
(4) Anpèchman transpò transmembran IFN yo (nsp8, nsp9) (Tablo 2, Figi 3).
(5) Anpèchman chèn IFNAR1-IFN-IR (orf3a), anpèchman Tyk2 kinaz ki asosye ak IFN-R (nsp1) (Tablo 2, Figi 4) [156-220].
(6) Anpèchman dirèk ekspresyon ISG pa bloke aktivasyon an ak translokasyon nan nwayo konplèks ISGF3 a, ki inisye transkripsyon ISG. Pou egzanp, nsp1, nsp3, nsp6, nsp13, orf3a, orf6, orf7a, orf7b, orf8, ak M (Tablo 2) gen kapasite patojèn pou bloke plizyè chemen siyal, ki gen ladan IFN-I-III/IFN-R (Tyk2, Jak1). )/ISGF3 (STAT1, STAT2, IRF9)/ISG/antiviral repons, estrès selilè (Figi 4).
Figi 4. Anpèchman kle siyal IFN-I-III pa SARS-CoV-2. Orf8 bloke atachman konplèks ISGF3 a nan sit ISRE sou pwomotè jèn repons antiviral yo—ISG. Anplis de sa, Figi 3 montre efè inhibition posib nan otoantikò ki mare IFN yo. Se poutèt sa, prezans otoantikò netralize nan IFN-I se yon prediktè nan nemoni COVID--19 kritik [216-219]. Reseptè IFN ak wout siyal pou aktivasyon jèn ISG yo gen koulè wouj, reseptè IFN ak chemen siyal pou aktivasyon jèn ISG yo gen koulè ble ak cyan, ak pwodwi jèn ISG yo gen koulè vèt. Flèch yo montre nan direksyon enpak aksyon estrikti molekilè respektif yo.
An jeneral, faktè patojèn SARS-CoV-2 ka anpeche tout etap prensipal yo nan pwoteksyon IFN ak yon wo degre de redondance akòz tou de gwo kantite faktè ki enplike nan anpèchman sa a ak milti-fonksyonalite yo. Sentèz entèferon (IFN) pandan enfeksyon viral se tankou lavalas. Kòm yon rezilta, deranje tout faz devlopman nan repons IFN an menm tan an se yon mekanis miltilateral efikas ki siprime repons antiviral lame a sinèrji [176]. Pami 27-28 pwoteyin viral yo te jwenn nan SARS-CoV-2, yo te panse nsp1 [155] ak orf6 [150] te gen pi gwo enpak sou pwodiksyon prensipal IFN-I-III ak siyal ISG. Sepandan, nan enfeksyon SARS-CoV-2, nsp13, nsp14, nsp15, ak orf6 yo te demontre tou yo se antagonis entèferon pwisan [150]. Kidonk, li posib ke repètwa inibitè IFN dominan yo varye selon kalite selil la ak eta fonksyon an. Pwosesis sa yo travay ansanm pou pèmèt SARS-CoV-2 repwodui nan divès kalite selil pandan y ap simonte kapasite antiviral iminite natirèl ak adaptasyon yo.
Kontinwe, konplèks faktè patojèn SARS-CoV-2 vize pou anpeche aktivite antiviral IFN-I-III yo fòme ak aplike [221]. Kòm yon rezilta, defo jenetik nan jenerasyon IFN oswa prezans otoantikò ki deranje fonksyon IFN yo se faktè risk evidan pou kou grav nan COVID -19 [222]. Sipresyon aktivite IFN-I-III nan kòmansman maladi a enpòtan anpil pou envazyon viral, paske IFN-I-III gen pi gwo efikasite antiviral pandan tan sa a. Pwodiksyon twòp nan IFN yo ka jwe tou yon efè danjere nan dènye etap yo ak pi grav nan COVID-19, paske li enplike nan fizyopatoloji fenomèn tanpèt cytokine ak enflamasyon sistemik ki asosye [4].
Kòm yon rezilta, yon fòm grav nan COVID-19 ak devlopman nan ARDS ak yon nivo ogmante nan sitokin pro-enflamatwa nan plasma, tankou IL-1, IL-6, TNF-, chemokines—CXCL10 (IP-10), CCL2 (MCP-1), ak CCL3 (MIP{-1), karakterize pa nivo IFN-I ki ba nan san an nan yon etap bonè epi ogmante. Nivo IFN-I nan yon etap byen ta nan COVID-19 [197]. Li enpòtan pou sonje ke IFN-λ1, ki pwodui akòz aktivasyon RIGMDA-5, reseptè TLR3, ak RIG-I gen wòl pwoteksyon ki pi enpòtan nan enfeksyon selil epitelyal respiratwa ak SARS-CoV{ {21}} [223]. Li enpòtan pou sonje ke IFN-λ1, ki pwodui akòz aktivasyon RIG-I, MDA-5, ak reseptè TLR3, gen wòl pwoteksyon ki pi enpòtan nan kòmansman SARS-CoV{{29. }} enfeksyon nan selil epitelyal respiratwa [223]. Lè yo konpare ak pasyan ki gen yon fòm ki pi modere nan COVID-19, ekspresyon IFN-I, ak IFN-λ2 parèt pi wo (patikilyèman nan aparèy respiratwa ki pi ba yo) nan pasyan ki gen yon kou grav nan maladi a [223] .
Konklizyon sa yo apiye teyori ke IFN yo gen yon wòl Limit nan pasaj yo. Inisyasyon efikas nan pwodiksyon IFN nan aparèy respiratwa anwo a ka mennen nan clearance viris pi vit epi pètèt limite transmisyon viris nan aparèy respiratwa ki pi ba yo. Lè viris la chape anba kontwòl iminitè nan sistèm respiratwa siperyè a, sepandan, jenerasyon IFN yo, ki ogmante konsiderableman nan poumon yo, gen anpil chans pou kontribiye nan tanpèt cytokine ak domaj tisi ki fèt pandan pwogresyon COVID-19 la. etap kritik. IFN te pwodwi repons ISG ki pi ba (pi fèb) nan egzanp ki anwo a, men li te ogmante siyifikativman ekspresyon sifas ACE2, ki enpòtan anpil pou pénétration SARS-CoV-2 [224]. IFN-, ki sekrete sitou pa tip 1 T-helper selil (Th1), se yon activator kle nan makwofaj tip 1 proinflammatory (M1). Repons iminitè antiviral selil sa yo lye ak risk pou sibstans fotojenik domaje tisi yo [4].
An menm tan an, IFN-I-III prensipalman pwodui pa selil ki enfekte ak viris, tandiske IFN- se sitou pwodwi pa lenfosit aktive pa faktè iminitè segondè men pa enfekte pa viris la. Se poutèt sa, move balans ki genyen ant deklanchman ak limite mekanis estrès selilè nan iminosit ki pwovoke pa SARS-CoV -2 kontribye nan dezòd la nan tou de repons yo natirèl ak adaptasyon antiviral.
5. Malfonksyònman repons Adaptive Antiviral la. Swadizan Wòl Pwosesis Otoiminitè a nan Patojèn COVID-19
5.1. Karakteristik prensipal devlopman repons iminitè ak disfonksyon li yo nan COVID-19
Variant posib nan estrateji viris yo anplwaye pou evade faktè repons iminitè yo se tès depistaj pou estrikti antijenik, endiksyon deklanchman lenfosit poliklonal, endiksyon repons otoiminitè, bloke entèraksyon ki genyen ant gwo pwoteyin konplèks istokonpatibilite (MHC) sou selil ki prezante antijèn (APC) ak T-selil reseptè (TCR), dezekilib rezo cytokine, yon move balans ant vektè endividyèl repons iminitè a: i1 (Th1, macrophages-M1, selil asasen nòmal-NK, cytotoksik T-lymphocytes-CTL), i2 (Th2). , M2a, eozinofil, selil mast), i3 (Th17, M2b, netrofil), i-reg (Treg, M2c) [225-227]. Aplikasyon estrateji sa yo ka mennen pa sèlman nan yon ogmantasyon nan envazyon viral la, men tou nan devlopman nan enfeksyon segondè (bakteri ak chanpiyon), ak domaj lokal ak sistemik nan tisi pa varyant nan reyaksyon otoenflamatwa ak otoiminitè.
Yo te jwenn senk SARS-CoV-2 nbsp (nsp7, nsp8, nsp9, nsp12, ak nsp13) ak pwoteyin estriktirèl (S, E, M, ak N) ki gen ladan peptides konsève ki gen iminojenisite detèmine pa kapasite yo pou mare. nan pwoteyin MHC-I/II [228].
Yo montre antikò RBD-espesifik yo idantifye nan moun ki rekipere apre COVID-19 yo pwoteje kont re-enfeksyon ak SARS-CoV-2 [229]. Pasyan ki enfekte ak SARSCoV-2, nan lòt men an, montre yon konvèsyon byen bonè nan antitelojenèz soti nan imunoglobulin nan klas IgM nan IgG ak, nan yon pi piti, IgA (7-14 jou apre aparisyon sentòm yo) [225,229 ].
Yo montre tou imunoglobulin anti-S-pwoteyin ki pwodui pou vaksen yo jwe yon wòl pwoteksyon nan prevansyon ak rediksyon konsekans kritik COVID-19 [230,231]. Egzistans antikò IgG nan pwoteyin S oswa N te gen rapò ak yon rediksyon konsiderab nan risk pou SARS-CoV-2 re-enfeksyon nan 6 pwochen mwa yo [232]. An jeneral, se sèlman kèk ka reinfeksyon yo te rapòte atravè mond lan, sa ki vle di iminite pwoteksyon alontèm [233].
Nan Katar, sèlman 243 moun (0.18 pousan) sou 133,266 ka SARS-CoV ki te konfime nan laboratwa-2 te gen omwen yon rezilta pozitif apre yo te detekte viris RNA 45-129 jou apre a. premye verifikasyon COVID-19, ak prèv klinik reinfeksyon te etabli sèlman nan 54 ka (22.2 pousan) [234]. Pandan se tan, plizyè etid te montre ke SARS-CoV-2 ka siviv pou yon peryòd tan nan mank de antiviral IgG e ke rekiperasyon nan COVID{-19 ka rive nan absans la nan antikò antiviral [235].
Antikò-depandan amelyorasyon (ADE) se yon fenomèn kote yon atachman ak antikò pa detwi viris la, men pito fasilite antre li nan selil la, ankouraje repwodiksyon viral ak virulans [225]. Apre atachman ak viris la, antikò kont S-pwoteyin nan medyatè ADE atravè lyezon ak FcR sou selil diferan nan ka MERS-CoV ak SARS-CoV -1 [236,237]. Sa te di kèk chèchè sijere ke ADE ka rive nan enfeksyon SARS-CoV-2 [238–240].
Anpil SARS-CoV-2 pwoteyin, tankou naps, S, M, N, ak orf3a, ka sèvi kòm yon sous Ag pou prezantasyon CTL espesifik antijèn (MHC-I plis Ag) [241]. Anplis de sa, enfeksyon SARS-CoV-2 deklanche devlopman Th1 atravè enplike MHC-II nan APC [242,243], ki akonpaye pa yon akimilasyon i1-pwodwi repons nan san an, tankou IFN- (pwodiktè prensipal-Th1), TNF-, ak neopterin (pwodwi M1) [244]. SARS-CoV-2 enfekte makrofaj alveolè nan poumon yo, sa ki pouse yo pwodui chemoattractants pou Th1. Lè sa a, selil Th1 yo lage IFN-, ki pi plis aktive aktivite antiviral ak pro-enflamatwa rezidan ak monosit-rekrite makrofaj yo [245]. Kòm yon rezilta, yon bouk fidbak pozitif devlope, sa ki lakòz enflamasyon alveolatè pwolonje.
Aktivasyon M1 ki pa byen wo ka lakòz chanjman nan zòn enflamasyon COVID-19 nan poumon ak trip [246]. Twòp repwesyon pwodiksyon Th1 ak IFN- gen rapò, yon lòt bò, ak yon ogmantasyon ensifizan nan i2-repons nan ka grav nan COVID-19, ak lòt kòz IL-6 epi yo ka detekte twòp pwodiksyon IL-10 [247,248]. Nan sikonstans sa yo, nivo ki ba IFN- nan san an lye ak gravite kou COVID-19 [249].
Lenfopeni, ki gen rapò ak diminye kantite CD8 plis selil T, osi byen ke CD4 plis Th ak Treg selil nan san an, menm si nan yon pi piti diminisyon nan selil B ak selil NK, se yon lòt siy malfonksyònman iminolojik nan COVID{{ {2}} [225,250,251]. Anplis de sa, gravite kondisyon pasyan an gen rapò ak degre lenfopeni [250,252]. Kantite netrofil nan COVID-19, nan lòt men an, souvan ogmante [253]. Kòm maladi a vin pi grav, rapò netrofil/lenfosit, ki se karakteristik COVID-19, ogmante [254,255]. Anpil enfeksyon viral egi lakòz lenfopeni pasajè, men anjeneral li rezoud byen vit [256,257]. Lenfopeni nan COVID-19, nan lòt men an, ka pi grav oswa ki dire lontan pase nan anpil lòt enfeksyon viral [248]. Sa ki annapre yo se kòz ki gen plis chans pou lenfopeni [251,258-260]:
• Migrasyon selil yo nan konsantre nan enflamasyon;
• Enfeksyon dirèk nan lenfosit ki eksprime ACE2 ak lòt reseptè SARS-CoV-2, ki te swiv pa apoptoz oswa sitoliz yo;
• Apoptoz ak piroptoz selil ipèaktive ki pa enfekte ak SARS-CoV-2;
• Chanjman metabolik ak neroendokrin ki te koze pa yon enfeksyon viral mennen nan rediksyon ak andikap rejenerasyon selil lenfoyid.
Men, dire lenfopeni nan COVID-19 (jiska plizyè mwa apre rekiperasyon an) mete dout sou wòl esansyèl migrasyon lenfosit la nan konsantre enflamatwa ak enfeksyon lenfosit kòm kòz prensipal lenfosit.
Yon ogmantasyon konbine nan nivo IFN- ak TNF- jwe yon wòl inik nan apoptoz lenfosit nan sendwòm tanpèt cytokine [261]. Tou de cytokin pro-enflamatwa sa yo lye ak vektè antiviral prensipal repons iminitè a, i1, ak TNF-, osi byen ke i3 [5]. Konsantrasyon segondè nan sitokin sa yo, nan lòt men an, ka lakòz ensifizan deklanchman selil iminitè, malfonksyònman, ak apoptoz. Pasyan ki gen gwo COVID-19 gen yon pi ba rapò Treg/Th17, ki asosye ak wo nivo cytokin pro-enflamatwa ak netrofili nan san an [262]. Nivo IL-17 ak GM-CSF ogmante nan pasyan ki gen COVID-19 grav (pwodwi i3). Anplis de sa, yo te montre rekritman netrofil, ki se medyatè pa selil Th17, eksplike destriksyon tisi nan poumon [263].
Nan ka grav, gwo valè cytokinemia nan fòm lan nan yon fenomèn tanpèt cytokine se yon siy enflamasyon sistemik, ki se kritik pou lavi a nan pasyan yo, ak nan kèk ka, sendwòm MAS ki tankou (sendwòm aktivasyon makrofaj) [4]. Anplis de sa, kòm mansyone deja, ogmante deklanchman Th1 ak M1 ta ka mal tisi nan fokis yo enflamatwa. Kòm yon rezilta, prèv sou wòl patojèn IFN- nan COVID-19 se konfli. Gen kèk piblikasyon ki montre wòl pwoteksyon IFN- a nan pwoteksyon antiviral ak efikasite preparasyon IFN- nan tretman maladi sa a [264].
Lòt etid lye nivo IFN ki wo nan san an ak gravite sentòm pasyan COVID-19 [265], osi byen ke inefikas IFN nan pwoteksyon antiviral nan selil epitelyal Airway yo ak potansyèl li pou pwovoke ekspresyon ACE2 sou epitelyal entesten. selil [266]. Faktè i1 yo ankouraje itilizasyon selil epitelyal ki deja enfekte yo men sèlman yon ti kras anpeche enfeksyon yo ak SARS-CoV-2, ki sanble ap limite benefis antiviral repons i1 nan COVID-19.
Sa ki anba la yo se kèk nan mekanis yo atravè ki SARS-CoV-2 pwovoke malfonksyònman iminolojik:
• Anpèchman MHC-I nan selil ki enfekte, ki fè li difisil pou CTL rekonèt yo (orf8, Tablo 2);
• Depistaj detèminan antijenik pwoteyin S la pa sik pou anpeche antikò yo rekonèt sit antijenik li yo [75,76];
• Liaison orf8 ak reseptè IL-17 ak aktivasyon li sou selil imunokonpetan, ki ka kontribye nan dezekilib iminitè [201];
• Disfonksyon APC posib ki asosye ak aksyon SARS-CoV-2 S-pwoteyin sou PRR, SR, ak lòt reseptè sou selil sa yo (Tablo 1);
• Twoub nan selil imunokonpetan nan balans ki genyen ant divès chemen siyal ak mekanis estrès selilè pa anpil faktè patojèn SARS-CoV-2.
Yo te jwenn selil T antijèn ki espesifik nan COVID-19 yo montre fenotip memwa efèktè diferansye byen bonè nan faz rekiperasyon an [267]. Pasyan ki gen gwo COVID-19 te gen yon frekans konsiderableman pi wo, lajè (divèsite sou-populasyon), ak grandè nan repons selil T memwa pase pasyan ki gen yon kou modere nan maladi a, ak repons ki pi enpòtan yo te pwovoke pa pwoteyin S, M, N, ak orf3a [268,269]. Disèt ane apre epidemi SARS 2003 la, moun ki te retabli de SARS (yon maladi ki te koze pa SARS-CoV-1) gen selil T memwa ki dire lontan ki reponn a SARS-CoV-1 N pwoteyin. Selil T sa yo te montre reyaktivite kwa ki pèsistan ak N-pwoteyin SARS-CoV2 [269]. Sepandan, wòl selil T memwa yo nan anpeche envazyon SARS-CoV-2 ak konplikasyon COVID-19 kounye a pa fin konprann.
Yon lòt pwoblèm nan devlopman yon repons iminitè adaptatif nan COVID-19 se potansyèl pou devlopman repons otoiminitè.
5.2. Kòz posib nan pwosesis otoiminitè ak anti-enflamatwa nan COVID-19
Yon repons oto-enflamatwa ki soti nan deklanchman antijèn espesifik nan eleman iminite natirèl, oswa aksyon an nan selil T otoantijèn espesifik ak antikò, oswa yon fòm konbine [270] ka lakòz domaj nan tisi yo. Modèl patojèn komen sa yo nan anpil pwosesis enfektye ka manifeste tèt yo nan COVID-19 [243,271].
Yon repons otoiminitè ki dirije kont tisi se epe Damoklès pou espès vertebre ak imen ki trè òganize [272]. Òganis ki gen iminite adaptab gen baryè milti-etap nan inisyasyon ak devlopman nan repons otoiminitè ak yon pwosesis otoiminitè (enflamasyon otoiminitè). Sepandan, tout baryè sa yo ka simonte nan prezans yon predispozisyon jenetik nan aksyon an nan divès kalite deklanche ontojenetik ak anviwònman faktè otoiminite [273-275].
Faktè sa yo jwe yon wòl enpòtan nan agresyon otoiminitè pandan enfeksyon [276-278]:
(1) Imitasyon molekilè pwoteyin viral yo
(2) "Aktivasyon moun k ap gade" - liberasyon otoantijèn nan tisi ki domaje pa viris ak enflamasyon.
(3) Vyolasyon baryè byolojik nan ògàn iminitè privilejye yo (sistèm nève santral, je, tèstikul, plasenta), bay aksè pou iminite adaptasyon nan otoantijèn potansyèl yo.
(4) Aktivasyon poliklonal lenfosit kòm rezilta aksyon superantigens (SAg) oswa pou lòt rezon (klon lenfosit T ak B kapab aktive tou).
(5) "Epitop gaye"–lè objektif repons otoiminitè yo pa rete fiks men yo ka elaji lè yo mete lòt epitop yo sou menm pwoteyin oswa nan lòt pwoteyin nan menm tisi a.
Li enpòtan sonje ke se pa tout pwosesis deklanchman lenfosit poliklonal ki mennen nan yon repons otoiminitè, epi se pa tout repons otoiminitè rezilta nan domaj tisi ak devlopman nan yon pwosesis otoiminitè pro-enflamatwa, ki pa toujou mennen nan devlopman nan yon fòmèl. (kanonik) maladi otoiminitè [279].
Akoz imite SARS-molekilè CoV-2, viris la ak pwoteyin imen yo gen sekans peptide analòg epi repons iminitè kont SARS-CoV-2 yo dirije sou pwoteyin imen. Kòm yon rezilta, pwoteyin estriktirèl S ak E gen plizyè zòn omològ ak pwoteyin imen [280]. Se poutèt sa, E-pwoteyin nan ka jwe yon wòl nan aktivasyon an nan yon repons otoiminitè (apre patikil viral la te degrade). Orf3a, orf7a, orf7b, orf8, ak orf9b, pwoteyin ki pa estriktirèl nan SARS-CoV-2, ka patisipe tou nan pwosesis sa a [280]. An patikilye, yo te revele mime molekilè ant SARS-CoV -2 imen ak HSP pwoteyin (60 ak 90), ki te lye ak sendwòm Guillain-Barré ak lòt maladi otoiminitè [281]. Li enpòtan pou remake repons iminolojik COVID-19 (a HSP) ka domaje pawa endothelial vaskilè [282].
Nan COVID-19, yo sipoze kounye a ke chemen disfonksyon iminitè ki depann de superantigen (Sag) yo enplike tou nan pwosesis otoiminitè ak oto-enflamatwa. Superantigens (Sags) se pwisan aktivatè lenfosit poliklonal ki rezistan a proteaz ak denaturasyon tèmik [283,284]. Aktivite patojèn prensipal la nan SAg se nonspecific obligatwa nan -chèn nan TCR a (mwens souvan nan -chèn nan) ak ansanm ak? MHC-II (mwens souvan MHC-I) sou APC a, sa ki lakòz deklanchman poliklonal selil T ak TCR, ki gen ladan klon potansyèlman otoreaktif [285] (Figi 5).
Figi 5. Endiksyon an nan yon repons klon nan CD4 plis lenfosit T nan peptides antijenik patikilye an asosyasyon ak pwoteyin MHC-II nan APC (A) ak yon repons poliklonal (B) kòm yon rezilta nan aksyon an nan superantigens. Pwoteyin MHC-II yo parèt an ble, antijèn (Ag, SAg) yo montre an wouj, chenn reseptè selil T (TCR) yo montre an vèt limyè, sit TCR espesifik pou antijèn (ipèvaryab) yo endike an vèt fonse, epi koreseptè CD4 la montre an jòn. Flèch yo endike antijèn ak deziyasyon reseptè yo.
Superantigens ka aktive jiska 20-25 pousan nan selil T, konpare ak sèlman 0.01 pousan nan repons klasik la, ak nan konsantrasyon Ag siyifikativman pi gwo pase SAg [284,286]. Pifò SAg parèt yo gen yon sit komen MHC-II obligatwa (yo rele sit la jenerik) ki pa afekte pa lòt Ag. Anplis de sa, chak SAg gen yon preferans pou alèl MHC espesifik, ki sèvi kòm faktè risk jenetik posib pou maladi otoiminitè [286]. Efè aktive SAg sou selil T ak lenfosit B (eksprime MHC-II), osi byen ke selil iminitè natirèl yo, ka evantyèlman lakòz yon tanpèt cytokine ak chòk toksik [284,287].
Done yo te parèt dènyèman ki gen rapò aparisyon sendwòm enflamatwa multisistèm nan timoun (MIS-C) ak enpak pwobab SAg ak aparisyon yon pwosesis otoenflamatwa nan COVID-19. Anplis, MIS-C se yon konsekans grav ak reta nan enfeksyon SARS-CoV-2 ki afekte timoun ki te deja an sante [288,289]. Li imite sendwòm chòk toksik ak sèten sentòm maladi Kawasaki a. Adilt yo te dyagnostike ak yon kondisyon ki konparab (sendwòm enflamatwa miltisistèm nan granmoun, MIS-A) [290]. Ipotèz MIS-C ak MIS-A [288-291] gade nan fizyopatoloji maladi sa yo atravè lantiy otoenflamasyon ak otoiminite. Nan senaryo sa a, motif ki sanble ak SAg sitiye tou pre sit klivaj S1/S2 nan pwoteyin Spike SARS-CoV-2 [291]. Zòn ki gen motif sa a gen yon gwo afinite pou domèn V nan tou de chèn TCR a, epi li pataje resanblans estriktirèl ak enterotoksin Staphylococcal B (SEB), youn nan SAg ki pi pisan [292,293]. SEB mare pa sèlman MHC-II ak TCR pwoteyin, men tou kontakte reseptè entèraksyon CD28 (sou selil T) ak B7 (sou APC), ki jwe yon wòl kle nan aktivasyon an nan selil sa yo, ki gen ladan jenerasyon cytokin proinflammatory [294].
SARS-CoV-2 S-pwoteyin ka fòme yon konplèks ternary: S plis TCR plis MHC II, dapre modèl enfòmatik in silico [295]. Yon mitasyon ki ra nan pwoteyin S (D839Y/N/E) ki soti nan souch Ewopeyen SARS-CoV-2 [295] ka amelyore entèraksyon viris la ak selil T yo. Pwopagasyon polyclonal hyperinflammatory nan T-lenfosit nan MIS-C te lye tou ak MHC-I, oswa plis espesyalman, MHC-I alèl A02, B35, ak C04 [296]. Pasyan ki gen MIS-C te gen yon defòme TCR memwa T selil repètwa, otoiminitè IgG reyaktif nan andotelyòm ak lòt tisi, ak CD8 cytotoxik hyperactivated plis selil T ak selil NK [297-299]. An jeneral, MIS-C se yon konplikasyon COVID-19 grav men ki ra. Segondè lenfositositoz emofagositik se yon lòt konsekans grav COVID-19 ki lye ak aktivasyon poliklonal lenfosit ak aktivasyon aberan nan selil iminitè natirèl yo (HLH). Li souvan prezante kòm yon sendwòm tankou MAS, ki ka youn nan mekanis pou devlopman yon tanpèt sitokin ak enflamasyon sistemik, tou de ki menase lavi [4].
It is worth remembering that systemic inflammation is a multifaceted, phase-specific process with hyperallergic and depressed manifestations [272,300]. As a result, a cytokine storm, if we define it as critical cytokine levels, should have quantitative characteristics that greatly exceed reference values, such as TNF-α concentration in blood plasma >200 pg/mL (nan N 8 pg/mL) ak IL-6 konsantrasyon nan plasma san > 1000 pg/mL (nan N 5 pg/mL) [301]. Pi ba konsantrasyon cytokine, nan opinyon nou an, nesesite adopsyon an nan kritè entegral pou evalye repons enflamatwa sistemik la ak enflamasyon sistemik. Kounye a, pa gen okenn kritè verifikasyon quantitative ki distenge sendwòm tanpèt cytokine ak fòm ki pa kritik nan hypercytokinemia [302]. Senaryo sa a parèt pèmèt yo make li kòm yon "tanpèt cytokine," ki pi sanble ak yon "tanpèt nan yon vè dlo," "tanpèt nan yon tas te," oswa "tanpèt nan yon tas dlo" COVID{{8 }} [4].
Pandan se tan, pwosesis deklanchman lenfosit poliklonal ak repons otoiminitè inaktif ka afekte yon seri sistèm, ki gen ladan sistèm iminolojik, neroendokrin, kadyovaskilè, poumon, kutane ak dijestif [286,303]. Sepandan, nan prezans faktè risk adisyonèl, menm pwosesis sa yo ka lakòz devlopman nan maladi otoiminitè klasik apre COVID-19 [304–306].
Men, chans pou devlope maladi sa yo kòm rezilta transfè COVID-19 yo modès. Nan COVID-19, sentòm ki pa klasik nan yon repons otoiminitè yo pi souvan. Kidonk, imite pwoteyin SARSCoV-2 twa pwoteyin imen, DAB1, AIFM, ak SURF1, yo jwenn nan konplèks pre-Bötzinger (preBötC) nan tij sèvo a, ka kontribye nan ensifizans respiratwa COVID-19 [307 ]. Lòt otoantikò komen nan anpil maladi otoiminitè, tankou antikò antinikleyè (ANAs), antikò neutrofil anti-sitoplasmik (ANCA), ak antikò antifosfolipid (APL), yo te dekouvri nan 45 pousan nan COVID-19 pasyan [308]. Sepandan, nan pifò sitiyasyon, enpòtans patojèn faktè otoiminitè sa yo pa klè.
Pwoblèm "long COVID", ke yo rele tou "kondisyon apre COVID-19, ki pa espesifye" (Klasifikasyon Entènasyonal Maladi-10, ICD-10), "post-COVID{{4} } sendwòm", ak "kovid apre egi," ka fè idantifikasyon endikasyon kache yon repons otoiminitè pi enpòtan. Fatig ki pèsistan, anedoni, feblès nan misk, pwoblèm dòmi, enkyetid oswa menm depresyon, difikilte pou konsantre, myalji ak artralji, ak malfonksyònman otonòm se tout sentòm COVID long [309-313]. Nan apeprè 20 pousan nan pasyan yo, sentòm sa yo pèsiste pou 3-6 mwa oswa plis apre yo fin geri nan COVID-19. Yo ka jwenn COVID long tou nan pasyan ki gen COVID modere-19 [314]. Kòm yon rezilta, apre COVID grav-19 [311], lontan COVID mande atansyon espesyal. Mekanis patojèn long COVID yo poko enkoni. Domaj nan ògàn, sendwòm pòs-viral, sendwòm swen pòs kritik, ak lòt faktè yo te postule kòm kòz posib. Etandone iminopatogenesis COVID-19, wòl li nan malfonksyònman iminolojik alontèm, patikilyèman repons otoiminitè a, parèt yon posiblite diferan.
Anplis de sa, nouvo prèv sijere ke SARS-CoV-2 ka enfekte sistèm nève santral la ak selil nan sèvo, patikilyèman selil endothelial mikwovaskilè [315,316]. Tanpèt ipoksi ak sitokin, lè yo konbine avèk envazyon viral, ka konpwomèt baryè san-sèvo (BBB) epi lakòz domaj nan tisi nan sèvo [306,307]. Yo panse SARS-CoV-2 lakòz konsekans irevokabl nan sèvo a akòz degradasyon BBB, ki gen ladan demans nan moun ki predispoze [315]. Li se vo anyen ke destriksyon BBB jwe yon wòl kle nan iminopatogenesis nan maladi newolojik otoiminitè, kòm koòdone vaskilè sa a sèvi kòm yon antre pou selil iminitè periferik ak molekil efèktè yo rive jwenn yon ògàn sib iminitè-privilejye [317-319].
6. Konklizyon
Malgre gwo efò sanitè ak prevantif yo te fè pandan de dènye ane yo, pandemi COVID-19 rete aktif, epi previzyon optimis sou fen li poko jistifye. Kounye a pa gen okenn previzyon valide syantifikman sou konpòtman enfeksyon an nan lavni. SARS-CoV-2 ka diminye virulans li ak yon varyant relativman favorab, ak souch pitit li yo oswa espès yo pral disparèt oswa, tankou "refwadisman"-CoV (HCoV-OC43 ak HCoV-HKU1), pwovoke epizòd respiratwa sezonye komen. enfeksyon [320]. Sepandan, akòz byochimik inik viris la, altènativ mwens pozitif pou adapte SARSCoV-2 nan sosyete imen an posib tou.
SARS-CoV-2 gen yon wo nivo de varyasyon jenetik, yon gwo genomic, ak yon gwo pwoteòm, yo tout akonpaye pa polifonksyonalite pwononse nan pwoteyin li yo. Kòm yon rezilta, SARS-CoV-2 ka enfekte selil sib nan aparèy respiratwa anwo a, epitelyal alveoli yo (sitou tip 2 astrosit), ak trip yo, apre premye kontak. SARS-CoV-2 tou anpeche efè pwoteksyon byen bonè nan kalite I ak III IFN yo ak lòt sistèm defans antiviral natirèl. SARS-CoV-2 anplis lakòz fòmasyon nan senplast nan selil ki enfekte ak sante ak vesik ekstraselilè ki gen viris, ki ede li kontoune baryè byolojik epithelium la epi gaye nan tout kò a. Piske SARS-CoV-2 S-pwoteyin ka rekonèt non sèlman pi gwo reseptè a (ACE2) ak koreseptè li yo, men tou lòt reseptè (altènatif), SARS-CoV-2 ka potansyèlman enfekte yon gran varyete sib. selil nan tisi òganis lame a.
Menm jan ak anpil lòt enfeksyon viral egi, COVID-19 kapab, ak yon kou pwogresif, aplike kat etap prensipal patojèn:
(1) Envazyon ak fòse replikasyon viris la nan tisi tegumentary yo, sitou nan epithelium aparèy respiratwa a ak trip. Mekanis kle nan etap sa a se rekonesans selil sib pa viris la atravè estrikti reseptè yo ak bloke repons prensipal IFN-I-III la (bonè).
(2) Pèt viris ki pwovoke nan fonksyon baryè yo nan konsantre nan enflamasyon nan dysregulation nan natirèl la ak Lè sa a, repons iminitè adaptasyon kontwole pa faktè patojèn yo. Suppression selektif nan mekanis antiviral espesifik, aktivasyon poliklonal aveugles nan lenfosit, devlopman nan enflamasyon anch selon varyant nan yon pwosesis otoenflamatwa, ak nan kèk ka, yon pwosesis otoiminitè inaktif oswa menm klinikman manifeste se tout faktè ki ede ekspansyon viral pandan peryòd sa a.
(3) Jeneralizasyon viris la nan kò a, chanjman sistemik nan estati iminitè a, ak lòt paramèt omeyostazi ak yon gwo risk pou konplikasyon kritik.
(4) Etap konsekans alontèm yon enfeksyon viral ki asosye ak pèsistans alontèm viris la nan kò a, konsekans domaj prensipal (viral) ak segondè (otojèn) tisi yo, ki gen ladan posib vyolasyon entegrite BBB la. , malfonksyònman endothelial, hypercoagulation, ak chanjman ki pèsistan nan estati iminitè a.
SARS-CoV-2 prezante yon varyasyon jenetik patikilyèman wo, akòz gwo genòm li yo ak gwosè pwoteòm li yo, ansanm ak polifonksyonalite pwononse pwoteyin li yo. Gwo varyasyon nan pwoteyin Spike a, an patikilye, enfliyanse posiblite pou envazyon nan anpil diferan kalite selil, ki gen ladan alveolates, pa sèlman atravè reseptè prensipal la (ACE2), men tou atravè yon varyete de reseptè ak reseptè altènatif (Tablo 1). Kòm yon rezilta, efè pwoteyin SARS-CoV-2 S yo sou PRR iminosit yo (ki gen ladan TLR), SR, IL-17 reseptè, ak lòt molekil sansoryèl yo ka disfonksyonèl nan sistèm iminitè a, sa ki lakòz nan domaj tisi ak replikasyon viral nan selil divès kalite.
Kapasite S-pwoteyin la pou pwovoke fòmasyon senplast selilè yo epi pou sik yo tcheke, potansyèl pou devlopman fenomèn ADE a, ak itilizasyon vesik ekstraselilè pa viris la ka se mekanis pwoteksyon li kont faktè sa yo. repons iminitè umoral la, ki gen ladan sa ki asosye ak vaksen yo.
Prèske tout pwoteyin SARS-CoV-2 (Tablo 2) se faktè patojèn ki gen plizyè fonksyon ki aji sou divès mekanis iminite antiviral. Sepandan, efè ki pi gaye yo pwobableman asosye ak blokaj la nan prèske tout etap nan inisyasyon ak aplikasyon nan repons IFN (Figi 3 ak 4). Mekanis sa yo pèmèt viris la efektivman simonte fonksyon yo baryè nan tisi tegumentary nan peryòd inisyal la nan maladi a epi kontribye nan disfonksyon an nan repons iminitè a ki asosye ak IFN- nan etap pita nan pwosesis la enfeksyon. Anplis de sa, sikonstans sa a diminye efikasite itilizasyon pwodiktè sentèz IFN kòm terapi COVID-19.
Yon lòt karakteristik faktè patojèn SARS-CoV-2 se kapasite li pou aji sou prèske tout pwosesis prensipal devlopman estrès selilè pro-enflamatwa nan divès kalite selil, ki gen ladan fòmasyon enflamazom, estrès oksidatif, repons ki pa kodaj. RNAs, otofaji, ekspresyon faktè transkripsyon inivèsèl nan estrès selilè (pa egzanp, NF-κB), ak fòmasyon nan yon fenotip sekretè ki asosye ak rezo cytokine. Mekanis sa yo bay viris la yon opòtinite adisyonèl pou replike nan divès selil, pwovoke disfonksyon iminitè, ak fòme modèl enflamasyon nòmal.
Kounye a pa gen okenn dout ke COVID-19 ka devlope yon pwosesis oto-enflamatwa ak otoiminitè, ki ka byen mennen nan konplikasyon tankou sendwòm tankou MAS ak MIS-C/MIS-A. Konplikasyon sa yo, ansanm ak lòt kòz, kontribye nan maladi mikrosirkulatwa sistemik ak lòt manifestasyon enflamasyon sistemik ki enpòtan pou lavi yo. Se poutèt sa, tout faktè prensipal yo pou aparisyon yon repons oto-iminitè ka potansyèlman manifeste tèt yo nan COVID-19, ki gen ladan mimik molekilè nan anpil pwoteyin SARS-CoV-2, "Activation Bystander", "Epitope". gaye" (nan kondisyon destriksyon tisi), vyolasyon baryè byolojik nan ògàn iminitè privilejye yo, aktivasyon poliklonal lenfosit, ak deklanchman patolojik APC (kòm yon rezilta aksyon SAg).
Kounye a, yon evalyasyon konplè sou mekanis sa yo se youn nan direksyon syantifik ki pi enpòtan pou etidye patojenis non sèlman COVID-19, men tou lòt enfeksyon viral [320–324].
Yon pwoblèm espesyal nan enfeksyon an konsidere se fenomèn "kovid long", prensipalman ki asosye ak maladi alontèm nan sistèm nève santral la, chanjman ki pèsistan nan sistèm iminitè a (ki gen ladan lenfopeni alontèm), ak konplikasyon nan lòt ògàn yo. Pwobableman, nou pral wè yon foto pi konplè sou patojenèz "long COVID" kòm yon rezilta plis rechèch, ki gen ladan klarifikasyon sou wòl pwosesis otoiminitè ak otoenflamatwa, pwoblèm BBB, pèsistans viral, ak patoloji vaskilè komorbid.
Siy avètisman COVID-19 yo se:
• Prezans, nan kèk ka, pèsistans alontèm SARS-CoV-2 nan kò a nan pasyan iminodefisyan [324];
• Prezans, nan apeprè chak senkyèm ka, konsekans alontèm ki te koze pa enfeksyon an transfere nan fòm yon COVID long;
• Pi long (an konparezon ak SARS-CoV-1 ak MERS-CoV) retansyon SARS-CoV-2 RNA nan likid byolojik nan pasyan COVID{-19 (jiska 1-2 mwa) [ 325], osi byen ke deteksyon SARS-CoV-2 RNA nan plis pase youn sou dis pasyan ki gen rplonje nan 60 jou apre rekiperasyon nan premye enfeksyon [326];
• Prezans klinik COVID-19 nan kèk ka rplonje ak enfeksyon nan pasyan ki te pran vaksen an ki okòmansman pa t gen siy klinik eta iminodefisyans [327,328];
• Devlopman yon repons oto-iminitè inaktif epi, nan kèk ka, klinik enpòtan nan COVID-19;
• Kapasite potansyèl viris la pou li simonte aktivman faktè repons iminitè ki pa sèlman natirèl men tou.
Kidonk, depann sou karakteristik yon souch patikilye nan SARS-CoV-2, faktè anviwònman an, prezans nan patoloji komorbid, ak eta a nan sistèm iminitè a nan kò a, dinamik COVID-19 ka. sispann nan premye etap li yo (ki gen ladan varyant subclinical) oswa rive nan tèminal, etap kritik lavi nan maladi a ki asosye ak maladi sistemik miltip nan omeyostazi (Figi 6).
Figi 6. Etap patojenèz COVID-19. (1) Enfeksyon nan selil tisi tegumentary yo, depase sistèm IFN-depandan nan defans selilè iminite natirèl, bloke oswa ipèstimulasyon nan chemen siyal estrès selilè, ak lòt konsekans detrès selilè. (2) Malfonksyònman nan iminite adaptasyon ak pwosesis enflamasyon kanonik nan zòn envazyon an, vyolasyon konsantre nan fonksyon baryè enflamasyon an, malfonksyònman nan ògàn ki domaje a, ak jeneralizasyon viris nan kò a. (3) Ogmante chanjman nan omeyostazi kò a, fòmasyon nan fenomèn chanjman sistemik, ak devlopman nan enflamasyon sistemik. Wout endiksyon IFN ak aksyon IFN nan selil ki enfekte yo endike pa flèch ble. Lòt flèch endike direksyon diferan pwosesis patojèn yo kominike youn ak lòt. Blòk jenerasyon IFN ak enpak yo sou selil ki jenere pwoteyin SARS-CoV-2 yo montre nan liy wouj. Pwosesis ki asosye ak malfonksyònman iminitè yo make nan bwat ble; pwosesis otoenflamatwa yo make an wouj; se konsantre nan malfonksyònman enflamasyon make nan bwat vèt; se malfonksyònman tisi make nan bwat nwa, ak enflamasyon sistemik make nan bwat ranpli wouj.
Kontribisyon otè:
Konsepyalizasyon, EG, ak VC; ekri – preparasyon bouyon orijinal, EG, ak LS; ekri–revizyon ak koreksyon, EG, AS, VC; akizisyon finansman, AS Tout otè yo te li epi yo te dakò ak vèsyon ki te pibliye maniskri a.
Finansman:
Etid la rapòte te finanse pa RFBR ak NSFC, nimewo pwojè 21-51-55003, ak an pati pa kontra Gouvènman an nan Enstiti Imunoloji ak Fizyoloji.
Deklarasyon Komisyon Konsèy Revizyon Enstitisyonèl:
Pa aplikab.
Deklarasyon Konsantman Enfòme:
Pa aplikab.
Konfli enterè:
Otè yo pa deklare okenn konfli enterè. Fonksyonè yo pa te gen okenn wòl nan konsepsyon etid la; nan koleksyon, analiz, oswa entèpretasyon done yo; nan ekri maniskri a, oswa nan desizyon pou pibliye rezilta yo.
Referans
1. Malik, YS; Sircar, S.; Bhat, S.; Sharun, K.; Dhama, K.; Dadar, M.; Tiwari, R.; Chaicumpa, W. Emerging roman coronavirus (2019-nCoV) — senaryo aktyèl, pèspektiv evolisyonè ki baze sou analiz genòm ak devlopman resan yo. Veterinè. K. 2020, 40, 68–76. [CrossRef]
2. Dhama, K.; Khan, S.; Tiwari, R.; Sircar, S.; Bhat, S.; Malik, YS; Singh, KP; Chaicumpa, W.; Bonilla-Aldana, DK; RodriguezMorales, AJ Coronavirus Maladi 2019–COVID-19. Clin. Microbiol. Rev. 2020, 33. [CrossRef] [PubMed]
3. Goh, GK-M.; Dunker, AK; Foster, JA; Uversky, VN analiz twoub Shell predi pi gwo rezistans nan SARS-CoV-2 (COVID{-19) deyò kò a ak nan likid kò a. Mikwòb. Pathog. 2020, 144, 104177. [CrossRef]
4. Gusev, E.; Sarapultsev, A.; Hu, D.; Chereshnev, V. Pwoblèm Patojèn ak Terapi Patojèn nan COVID-19 nan pèspektiv Teyori Jeneral Sistèm Patolojik (Pwosesis Patolojik Jeneral). Ent. J. Mol. Sci. 2021, 22, 7582. [CrossRef] [PubMed]
5. Gusev, E.; Solomatina, L.; Zhuravleva, Y.; Sarapultsev, A. Pathogenesis nan Etap Fen Maladi Ren soti nan pwen de teyori a nan pwosesis Jeneral Patolojik nan enflamasyon. Ent. J. Mol. Sci. 2021, 22, 11453. [CrossRef] [PubMed]
6. Rai, KR; Shrestha, P.; Yang, B.; Chen, Y.; Liu, S.; Maarouf, M.; Chen, J.-L. Enfeksyon egi nan patojèn viral ak chape iminitè natirèl yo. Devan. Microbiol. 2021,12. [CrossRef]
7. Hu, B.; Guo, H.; Zhou, P.; Shi, Z.-L. Karakteristik SARS-CoV-2 ak COVID-19. Nat. Rev Microbiol. 2021, 19, 141–154. [CrossRef]
8. Rehman, SU; Shafique, L.; Ihsan, A.; Liu, Q. Trajèktwa Evolisyonè pou Aparisyon Nouvo Coronavirus SARS-CoV-2. Patojèn 2020, 9, 240. [CrossRef]
9. Jiang, C.; Li, X.; Ge, C.; Ding, Y.; Zhang, T.; Cao, S.; Meng, L.; Lu, S. Deteksyon molekilè SARS-CoV-2 ke yo te defye pa varyasyon viris ak enfeksyon asymptomatik. J. Pharm. Anal. 2021. [CrossRef]
10. Chilamakuri, R.; Agarwal, S. COVID-19: Karakteristik ak Terapi. Selil 2021, 10, 206. [CrossRef]
11. Peng, Q.; Peng, R.; Yuan, B.; Zhao, J.; Wang, M.; Wang, X.; Wang, Q.; Solèy, Y.; Fan, Z.; Qi, J.; et al. Karakterizasyon estriktirèl ak byochimik nsp12-nsp7-nsp8 Core Polymerase Complex soti nan SARS-CoV-2. Rep. selilè 2020, 31, 107774. [CrossRef] [PubMed]
12. Kumar, R.; Verma, H.; Singhvi, N.; Sood, U.; Gupta, V.; Singh, M.; Kumari, R.; Hira, P.; Nagar, S.; Talwar, C.; et al. Konparatif analiz jenomik SARS-CoV ki ap evolye rapid-2 revele modèl distribisyon filojeografik Mozayik. mSystems 2020, 5, e00505-20. [CrossRef] [PubMed]
13. Michel, CJ; Mayer, C.; Poch, O.; Thompson, JD Karakterizasyon jèn akseswar nan genòm coronavirus. Virol. J. 2020, 17, 131. [CrossRef] [PubMed]
14. Gorkhali, R.; Koirala, P.; Rijal, S.; Mainali, A.; Baral, A.; Bhattarai, HK Estrikti ak Fonksyon Gwo SARS-CoV-2 ak SARS-CoV Pwoteyin. Bioinform. Biol. Insights 2021, 15, 11779322211025876. [CrossRef]
15. Zhang, Q.; Xiang, R.; Huo, S.; Zhou, Y.; Jiang, S.; Wang, Q.; Yu, F. Mekanis molekilè nan entèraksyon ant SARS-CoV-2 ak selil lame ak terapi entèvansyon. Transduct siyal. Sib. La. 2021, 6, 233. [CrossRef]
16. Hasan, SS; Attrish, D.; Ghosh, S.; Choudhury, PP; Uversky, VN; Aljabali, AA; Lundstrom, K.; Uhal, BD; Rezaei, N.; Seyran, M.; et al. Omoloji sekans remakab nan pwoteyin ORF10 la entwospekte achitekti SARS-CoV-2. Ent. J. Biol. Macromol. 2021, 181, 801–809. [CrossRef]
17. Liu, T.; Jia, P.; Fang, B.; Zhao, Z. Diferans ekspresyon transkripsyon viral soti nan sekans RNA yon sèl selil nan pasyan modere ak grav COVID-19 ak enplikasyon li yo pou severite ka yo. Devan. Microbiol. 2020, 11, 603509. [CrossRef]
18. Mena, EL; Donahue, CJ; Vaites, LP; Li, J.; Rona, G.; O'Leary, C.; Lignitto, L.; Miwatani-Minter, B.; Paulo, JA; Dhabaria, A.; et al. Konplèks ORF10–Cullin-2–ZYG11B pa obligatwa pou enfeksyon SARS-CoV-2. Pwosedi. Natl. Acad. Sci. USA 2021, 118, e2023157118. [CrossRef]
19. Pancer, K.; Milewska, A.; Owczarek, K.; Dabrowska, A.; Kowalski, M.; Łabaj, PP; Branicki, W.; Sanak, M.; Pyrc, K. SARS-CoV-2 ORF10 a pa esansyèl nan vitro oswa nan vivo nan imen. PLoS Pathog. 2020, 16, e1008959. [CrossRef]
20. Gordon, DE; Jang, MG; Bouhaddou, M.; Krogan, NJ A SARS-CoV-2-Kat Entèaksyon Pwoteyin Imèn ak Pwoteyin Devwale Objektif Dwòg yo ak potansyèl Repurposing Dwòg. bioXriv 2020. [CrossRef]
21. Lam, J.-Y.; Yuen, C.-K.; IP, JD; Wong, W.-M.; Pou, KK-W.; Yuen, K.-Y.; Kok, K.-H. Pèt orf3b nan tansyon SARS-CoV-2 k ap sikile yo. Emerg. Mikwòb Enfekte. 2020, 9, 2685–2696. [CrossRef] [PubMed]
22. Cui, J.; Li, F.; Shi, Z.-L. Orijin ak evolisyon coronavirus patojèn yo. Nat. Rev Microbiol. 2019, 17, 181–192. [CrossRef] [PubMed]
23. Aldaais, EA; Yegnaswamy, S.; Albahrani, F.; Alsowaiket, F.; Alramadan, S. Sekans ak analiz estriktirèl COVID-19 E ak M pwoteyin ak MERS viris E ak M pwoteyin—Yon etid konparatif. Byochim. Biophys. Rep. 2021, 26, 101023. [CrossRef] [PubMed]
24. Bakhshandeh, B.; Jahanafrooz, Z.; Abbasi, A.; Goli, MB; Sadeghi, M.; Mottaqi, MS; Zamani, M. Mitasyon nan SARS-CoV-2; Konsekans nan estrikti, fonksyon, ak patojèn viris la. Mikwòb. Pathog. 2021, 154, 104831. [CrossRef] [PubMed]
25. Camporota, L.; Chiumello, D.; Busana, M.; Gattinoni, L.; Marini, JJ Fizyoloji COVID-19-asosye sendwòm detrès respiratwa egi. Lancet Respir. Med. 2020, 9, 1201–1208. [CrossRef]
26. Asakura, H.; Ogawa, H. COVID-19-koagulopati ki asosye ak koagulasyon entravaskilè gaye. Ent. J. Hematol. 2020, 113, 45–57. [CrossRef]
27. Petersen, E.; Koopmans, M.; Ale, U.; Hamer, DH; Petrosillo, N.; Castelli, F.; Storgaard, M.; Al Khalili, S.; Simonsen, L. Konpare SARS-CoV-2 ak SARS-CoV ak pandemi grip yo. Lancet enfekte. Dis. 2020, 20, e238–e244. [CrossRef]
28. Wu, F.; Zhao, S.; Yu, B.; Chen, Y.-M.; Wang, W.; Song, Z.-G.; Hu, Y.; Dao, Z.-W.; Tian, J.-H.; Pei, Y.-Y.; et al. Yon nouvo coronavirus ki asosye ak maladi respiratwa moun nan peyi Lachin. Nature 2020, 579, 265–269. [CrossRef]
29. Hasan, SS; Capstick, T.; Ahmed, R.; Kow, CS; Mazhar, F.; Komèsan, HA; Zaidi, STR Mòtalite nan pasyan COVID-19 ki gen sendwòm detrès respiratwa egi ak kortikoterapi itilize Yon revizyon sistematik ak meta-analiz. Ekspè Rev. Med. 2020, 14, 1149–1163. [CrossRef]
30. Aktè, T.; Uddin, N.; Das, J.; Akhter, A.; Choudhury, TR; Kim, S. Evolution of grave ecute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) as coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic: A global health emergency. Sci. Total Environ. 2020, 730, 138996. [CrossRef]
31. Shoaib, MH; Ahmed, FR; Sikandar, M.; Yousuf, RI; Saleem, MT Yon vwayaj soti nan SARS-CoV-2 pou rive nan COVID-19 ak pi lwen: Yon apèsi konplè sou pidemyoloji, dyagnostik, patojèn, ak apèsi sou pwogrè nan jesyon terapetik li yo. Devan. Pharmacol. 2021, 12, 576448. [CrossRef]
32. Okamoto, M.; Tsukamoto, H.; Kouwaki, T.; Seya, T.; Oshiumi, H. Rekonesans RNA viral pa reseptè rekonesans modèl nan endiksyon iminite natirèl ak enflamasyon twòp pandan enfeksyon viral respiratwa. Imunol viral. 2017, 30, 408–420. [CrossRef] [PubMed]
33. Prabhudas, MR; Baldwin, CL; Bollyky, PL; Bowdish, DME; Drickamer, K.; Febbraio, M.; Herz, J.; Kobzik, L.; Krieger, M.; Loike, J.; et al. Yon Klasifikasyon Definitif Konsantman nan Reseptè Scavenger ak wòl yo nan Sante ak Maladi. J. Immunol. 2017, 198, 3775–3789. [CrossRef]
34. Gusev, EY; Zotova, NV; Zhuravleva, YA; Chereshnev, V. Wòl fizyolojik ak patojèn nan reseptè scavenger nan imen. Med Immunol. 2020, 22, 7–48. [CrossRef]
35. Wei, C.; Wan, L.; Yan, Q.; Wang, X.; Zhang, J.; Yang, X.; Zhang, Y.; Fan, C.; Li, D.; Deng, Y.; et al. HDL-scavenger reseptè B tip 1 fasilite antre SARS-CoV-2. Nat. Metab. 2020, 2, 1391–1400. [CrossRef] [PubMed]
36. Chen, X.; Liu, S.; Goraya, MU; Maarouf, M.; Huang, S.; Chen, J.-L. Akèy repons iminitè a Enfeksyon Viris Grip A. Devan. Imunol. 2018, 9, 320. [CrossRef]
37. Onomoto, K.; Noguchi, K.; Yoneyama, M. Règleman nan siyal RIG-I-like reseptè-medyatè: Entèraksyon ant lame ak faktè viral. Selil. Mol. Imunol. 2021, 18, 539–555. [CrossRef]
38. Au-Yeung, N.; Mandhana, R.; Horvath, CM Règleman transkripsyon STAT1 ak STAT2 nan chemen entèferon JAK-STAT la. JAK-STAT 2013, 2, e23931. [CrossRef]
39. Hilleman, MR Estrateji ak mekanis pou siviv lame ak patojèn nan enfeksyon viral egi ak ki pèsistan. Pwosedi. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 14560–14566. [CrossRef]
40. Xia, H.; Cao, Z.; Xie, X.; Zhang, X.; Chen, JY-C.; Wang, H.; Menachri, VD; Rajsbaum, R.; Shi, P.-Y. Evasyon entèferon tip I pa SARS-CoV-2. Rep. selilè 2020, 33, 108234. [CrossRef]
41. Renner, K.; Schwittay, T.; Chaabane, S.; Gottschling, J.; Müller, C.; Tiefenböck, C.; Salewski, J.-N.; Winter, F.; Buchtler, S.; Balam, S.; et al. Iporeaktivite selil T grav nan pasyan ki ayere COVID-19 gen rapò ak pèsistans viris pwolonje ak move rezilta. Nat. Komin. 2021, 12, 3006. [CrossRef] [PubMed]
42. Huang, S.-W.; Wang, S.-F. SARS-CoV-2 Varyasyon jenetik ak viral ki gen rapò ak antre: Enplikasyon sou severite COVID-19, chape iminitè, ak enfeksyon. Ent. J. Mol. Sci. 2021, 22, 3060. [CrossRef] [PubMed]
43. Santacroce, L.; Charitos, IA; Carretta, DM; De Nitto, E.; Lovero, R. kowonaviris imen (HCoV) ak mekanis molekilè enfeksyon SARS-CoV-2. Klin. Wochenschr. 2020, 99, 93–106. [CrossRef] [PubMed]
44. Hadfield, J.; Megill, C.; Bell, SM; Huddleston, J.; Potter, B.; Callender, C.; Sagulenko, P.; Bedford, T.; Neher, RA Nextstrain: Suivi an tan reyèl nan evolisyon patojèn. Bioinformatics 2018, 34, 4121–4123. [CrossRef]
45. Karim, SSA; Karim, QA Omicron SARS-CoV-2 variant: Yon nouvo chapit nan pandemi COVID-19. Lancet 2021, 398, 2126–2128. [CrossRef]
46. Sant Nasyonal pou Vaksinasyon ak Maladi Respiratwa (NCIRD), Divizyon Maladi Viral. Syans Brèf: Omicron (B.1.1.529) Variant. Nan CDC COVID-19 Science Briefs; Sant pou Kontwòl ak Prevansyon Maladi (US): Atlanta, GA, USA, 2020.
47. Kandeel, M.; Mohamed, MEM; El-Lateef, HMA; Venugopala, KN; El-Beltagi, HS Omicron variant evolisyon genomic ak filogenetics. J. Med. Virol. 2021. [CrossRef]
48. Dhawan, M.; Priyanka, OPC Omicron SARS-CoV-2 variant: Rezon ki fè aparisyon ak leson aprann-Korespondans. Ent. J. Surg. 2021, 97, 106198. [CrossRef]
49. Del Rio, C.; Omè, SB; Malani, PN Winter of Omicron — Pandemi COVID-19 k ap evolye a. JAMA 2022, 327, 319. [CrossRef]
50. Burki, TK Omicron variant ak rapèl vaksen COVID-19. Lancet Respir. Med. 2021, 10, E17. [CrossRef]
51. Wang, X.; Powell, CA Ki jan yo tradui konesans nan COVID-19 nan prevansyon nan varyant Omicron. Clin. Transl. Med. 2021, 11, e680. [CrossRef]
52. Torjesen, I. COVID-19: Omicron ka gen plis transmisyon pase lòt variants ak an pati rezistan a vaksen ki egziste deja, syantis yo pè. BMJ 2021, 375, n2943. [CrossRef] [PubMed]
53. Dyer, O. COVID-19: Omicron ap lakòz plis enfeksyon men mwens admisyon nan lopital pase Delta, done Sid Afriken yo montre. BMJ 2021, 375, n3104. [CrossRef] [PubMed] 54. Christie, B. COVID-19: Premye etid yo bay espwa ke omicron pi modere pase lòt variants. BMJ 2021, 375, n3144. [CrossRef] [PubMed]
55. SeyedAlinaghi, S.; Mirzapour, P.; Dadras, O.; Pashaei, Z.; Karimi, A.; MohsseniPour, M.; Soleymanzadeh, M.; Barzegary, A.; Afsahi, AM; Vahedi, F.; et al. Karakterizasyon diferan varyant SARS-CoV-2 ak morbidite ak mòtalite ki gen rapò: Yon revizyon sistematik. Lajan ewo. J. Med Res. 2021, 26, 51. [CrossRef] [PubMed]
56. Ugurel, OM; Ata, O.; Turgut-Balik, D. Yon analiz ajou varyasyon nan SARS-CoV-2 genòm. Tik. J. Biol. 2020, 44, 157–167. [CrossRef] [PubMed]
57. Harvey, WT; Carabelli, AM; Jackson, B.; Gupta, RK; Thomson, EC; Harrison, EM; Ludden, C.; Reeve, R.; Rambaut, A.; COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium; et al. SARS-CoV-2 varyant, mitasyon pike, ak chape iminitè. Nat. Rev Microbiol. 2021, 19, 409–424. [CrossRef]
58. Chen, J.; Wang, R.; Wang, M.; Wei, G.-W. Mitasyon Ranfòse SARS-CoV-2 Enfeksyon. J. Mol. Biol. 2020, 432, 5212–5226. [CrossRef]
59. Li, F. Estrikti, Fonksyon, ak Evolisyon Pwoteyin Spike Coronavirus. Ann. Rev Virol. 2016, 3, 237–261. [CrossRef]
60. Harrison, AG; Lin, T.; Wang, P. Mekanis SARS-CoV-2 Transmisyon ak Patojèn. Tandans Immunol. 2020, 41, 1100–1115. [CrossRef]
61. Simões e Silva, AC; Silveira, KD; Ferreira, AJ; Teixeira, MM ACE2, anjyotansin-(1-7) ak Mas reseptè aks nan enflamasyon ak fibwoz. Br. J. Pharmacol. 2013, 169, 477–492. [CrossRef]
62. Cuervo, NZ; Grandvaux, N. ACE2: Prèv wòl kòm reseptè antre pou SARS-CoV-2 ak enplikasyon nan komorbidite. eLife 2020, 9, e61390. [CrossRef] [PubMed] 63. Mèt, SF; Jufri, NF; Ibrahim, FW; Raub, SHA Reseptè klasik ak altènatif pou estrateji terapetik SARS-CoV-2. Rev Med Virol. 2020, 31, 1–9. [CrossRef] [PubMed]
64. Ji, H.-L.; Zhao, R.; Matalon, S.; Matthay, MA Elevasyon Plasmin(ogen) kòm yon Faktè Risk Komen pou Sansiblite COVID-19. Fizyol. Rev. 2020, 100, 1065–1075. [CrossRef]
65. Evans, JP; Liu, S.-L. Wòl faktè lame yo nan antre SARS-CoV-2. J. Biol. Chem. 2021, 297, 100847. [CrossRef] [PubMed]
66. Wrapp, D.; Wang, N.; Corbett, KS; Goldsmith, JA; Hsieh, C.-L.; Abiona, O.; Graham, BS; McLellan, JS estrikti Cryo-EM nan 2019-nCoV Spike nan konfòmasyon prefizyon an. Syans 2020, 367, 1260–1263. [CrossRef] [PubMed]
67. Hatmal, MM; Alshaer, W.; Al-Hatamleh, MAI; Hatmal, M.; Smadi, O.; Taha, MO; Oweida, AJ; Boer, JC; Mohamud, R.; Plebanski, M. Konparezon konplè estriktirèl ak molekilè nan pwoteyin Spike nan SARS-CoV-2, SARS-CoV ak MERS-CoV, ak entèraksyon yo ak ACE2. Cells 2020, 9, 2638. [CrossRef]
68. Simmons, G.; Reeves, JD; Rennekamp, A.; Amberg, SM; Piefer, AJ; Bates, P. Karakterizasyon kowonaviris ki asosye ak sendwòm respiratwa egi grav (SARS-CoV) spike glycoprotein mediated viral entry. Pwosedi. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 4240–4245. [CrossRef]
69. Prabhakara, C.; Godbole, R.; Sil, P.; Jahnavi, S.; Gulzar, S.-E.; van Zanten, TS; Sheth, D.; Subhash, N.; Chandra, A.; Shivaraj, A.; et al. Estrateji pou vize antre SARS-CoV-2 ak enfeksyon lè l sèvi avèk mekanis doub anpèchman pa inhibiteur asidifikasyon. PLOS Pathog. 2021, 17, e1009706. [CrossRef]
70. Shang, C.; Zhuang, X.; Zhang, H.; Li, Y.; Zhu, Y.; Lu, J.; Ge, C.; Cong, J.; Li, T.; Tian, M.; et al. Inibitè asidifikasyon endozomal yo siprime replikasyon SARS-CoV-2 epi soulaje nemoni viral nan sourit transjenik hACE2. Virol. J. 2021, 18, 46. [CrossRef]
71. Gan, HH; Twaddle, A.; Marchand, B.; Gunsalus, KC Modélisation estriktirèl nan SARS-CoV-2 Spike/Human ACE2 Konplèks Entèfas ka Idantifye Variants ki gen gwo afinite ki asosye ak Ogmantasyon Transmisibilite. J. Mol. Biol. 2021, 433, 167051. [CrossRef]
72. Ou, J.; Zhou, Z.; Dai, R.; Zhang, J.; Zhao, S.; Wu, X.; Lan, W.; Ren, Y.; Cui, L.; Lan, Q.; et al. Mitasyon V367F nan SARS-CoV-2 Spike RBD ki parèt pandan faz transmisyon bonè a amelyore enfeksyon viral grasa Ogmantasyon Afinite Reseptè ACE2 Imèn. J. Virol. 2021, 95, JVI0061721. [CrossRef] [PubMed]
73. Weisblum, Y.; Schmidt, F.; Zhang, F.; DaSilva, J.; Poston, D.; Lorenzi, JC; Muecksch, F.; Rutkowska, M.; Hoffmann, H.-H.; Michailidis, E.; et al. Chape anba antikò netralize pa SARS-CoV-2 varyant pwoteyin Spike. eLife 2020, 9, e61312. [CrossRef] [PubMed]
74. Zheng, B.; Yuan, M.; Ma, Q.; Wang, S.; Tan, Y.; Xu, Y.; Wi, J.; Gao, Y.; Solèy, X.; Yang, Z.; et al. Peyizaj la nan SARS-CoV-2 pike selil ki entèraksyon ak pwoteyin nan tisi imen yo. Ent. Immunopharmacol. 2021, 95, 107567. [CrossRef] [PubMed]
75. Lokhande, KB; Apte, GR; Shrivastava, A.; Singh, A.; Pal, JK; Swamy, KV; Gupta, RK Detekte entèraksyon ki genyen ant ajan ki relye idrat kabòn yo ak glikan N-lye nan glikoprotein SARS-CoV-2 lè l sèvi avèk syans molekilè ak simulation. J. Biomol. Estrikti. Dyn. 2020, 1–19. [CrossRef]
76. Verma, J.; Subbarao, N. Yon etid konparatif nan pwoteyin Spike moun betacoronavirus: Estrikti, fonksyon, ak terapetik. Arch. Virol. 2021, 166, 697–714. [CrossRef] [PubMed]
77. Mycroft-West, CJ; Su, D.; Pagani, mwen; Rudd, TR; Elli, S.; Gandhi, NS; Guimond, SE; Miller, GJ; Meneghetti, MCZ; Nader, HB; et al. Eparin anpeche envazyon selilè pa SARS-CoV-2: Depandans estriktirèl nan entèraksyon an nan Spike S1 Reseptè-Binding Domèn nan ak Heparin. Tronc. Haemost. 2020, 120, 1700–1715. [CrossRef]
78. Kim, C.-H. SARS-CoV-2 Adaptasyon Evolisyonè pou Antre Lame ak Rekonesans Reseptè O-Acetyl Sialylation nan entèraksyon viris-lame. Ent. J. Mol. Sci. 2020, 21, 4549. [CrossRef]
79. Clausen, TM; Sandoval, DR; Spliid, CB; Pihl, J.; Perrett, HR; Pent, CD; Narayanan, A.; Majowicz, SA; Kwong, EM; McVicar, RN; et al. Enfeksyon SARS-CoV-2 depann de silfat eparan selilè ak ACE2. Cell 2020, 183, 1043–1057.e15. [CrossRef]
80. Cagno, V.; Tseligka, ED; Jones, ST; Tapparel, C. Heparan Sulfate Proteoglycans, ak atachman viral: Vrè reseptè oswa patipri adaptasyon? Viris 2019, 11, 596. [CrossRef]
81. Seyran, M.; Takayama, K.; Uversky, VN; Lundstrom, K.; Palù, G.; Sherchan, SP; Attrish, D.; Rezaei, N.; Aljabali, AAA; Ghosh, S.; et al. Baz estriktirèl antre akselere selil lame pa SARS-CoV-2†. FEBS J. 2020, 288, 5010–5020. [CrossRef]
For more information:1950477648nn@gmail.com
