htLang
Kay / Konesans / Sanisfè

Konesans

Regilatè Epigenetic UTX ki lye ak X kontwole diferans sèks ant selil NK yo

Dec 27, 2023

Rezilta enfeksyon viral yo gen patipri sèks, ak gason jeneralman pi fasil pase fi. Paradoksal, kantite selil antiviral asasen natirèl (NK) yo ogmante nan gason. Nou demontre ke pandan ke kantite selil NK yo ogmante nan sourit gason, yo montre diminye fonksyon efèktè konpare ak fi nan sourit ak imen. Diferans sa yo pa t sèlman depann sou òmòn gonadal, paske yo te pèsiste nan sourit gonadectomized. Kdm6a (ki kode pwoteyin UTX la), yon regilatè epigenetik ki chape nan inaktivasyon X, te pi ba nan selil NK gason, pandan y ap defisi UTX selil NK nan sourit fi ogmante kantite selil NK ak redwi repons efèktè yo. Anplis de sa, sourit ki gen NK selil-entrisik UTX deficiency te montre ogmante letalite nan cytomegalovirus sourit. Analiz entegratif milti-omik te revele yon wòl enpòtan pou UTX nan reglemante aksè chromatin ak ekspresyon jèn enpòtan pou omeyostazi selil NK ak fonksyon efèktè. Ansanm, done sa yo enplike UTX kòm yon detèminan molekilè kritik nan diferans sèks nan selil NK.

Diferans sèks evolisyonèman konsève egziste nan tou de repons iminitè natirèl ak adaptasyon1,2. Pandan ke gason yo gen mwens sansib a otoiminite, yo menm tou yo monte yon repons iminitè antiviral mwens pisan pase fi. Pou egzanp, gason gen yon fado ki pi wo sou sitomegaloviris imen (HCMV) apre enfeksyon, sa ki sijere ogmante sansiblite nan menas viral4. Sa a te tou dènyèman ilistre pandan pandemi maladi coronavirus 2019 (COVID-19), kote yo te postule gwo patipri gason pou maladi grav pou reflete diferans sèks nan repons iminitè5. Plizyè etid sou imen ak sourit dènyèman te rapòte diferans nan distribisyon selil iminitè ak/oswa fonksyon nan gason ak fi6,7. Sepandan, baz molekilè pou diferans sa yo, ak mekanis yo pa ki diferans sa yo enfliyanse rezilta maladi yo, yo rete mal konprann. Diferans sèks nan mamifè yo defini pa sèlman òmòn gonadal divergent men tou pa dòz kwomozòm sèks1. Ekspresyon nan yon sou-ansanm nan jèn ki lye X, pou egzanp, pi wo nan fi (XX) pase gason (XY)8. Pandan ke fi yo sibi inaktivasyon X-kwomozòm o aza (XCI) pou kenbe nivo menm jan an nan ekspresyon pwoteyin ki lye ak X ant sèks, XCI se enkonplè, ak 3-7% nan jèn X-kwomozòm chape nan inaktivasyon nan sourit ak 20-30% chape nan inaktivasyon nan. moun8,9. Kòm sa yo, nivo diferans nan ekspresyon jèn ki lye nan X nan fi ak gason yo te lye ak diferans sèks nan yon pakèt kondisyon ki gen ladan defo tib neral10 ak maladi otoiminitè11,12. Kòm lenfosit natirèl tip 1 k ap sikile, selil NK yo sèvi kòm yon liy defans byen bonè kont manm fanmi èpèsviris yo13. Enpòtans selil NK yo nan iminite antiviral yo montre nan pasyan ki gen nimewo selil NK defo oswa fonksyonalite, ki trè sansib a enfeksyon pa èpèsviris tankou HCMV ak viris Epstein-Barr14. Nan sourit, selil NK yo obligatwa pou kontwole cytomegalovirus sourit (MCMV) ak lòt enfeksyon viral15. Sourit ki gen swa defisyans jenetik nan fonksyon selil NK oswa pèt nimewo selil NK yo gen yon ogmantasyon enpòtan nan tit viral ak mòtalite apre enfeksyon MCMV15-18. Kidonk, selil NK yo kritik nan iminite antiviral nan tou de sourit ak imen.

Desert ginseng-Improve immunity (9)

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

Etandone fonksyon an antiviral ki pisan nan selil NK, se poutèt sa li te inatandi ke gason ki sansib pou viris montre pi gwo kantite selil NK6,7. Pi lwen pase nimewo selil NK yo, lòt karakteristik selil NK ki te dimòfik seksyèlman yo pa apresye anvan yo ka konte pou diferans sèks pandan enfeksyon viral. Nou demontre ke pandan ke selil NK gason yo montre kapasite selilè amelyore nan sourit, yo montre diminye fonksyon efèktè nan sourit ak imen. Patipri sèks sa yo nan konpozisyon selil NK ak fonksyon yo pa t konplètman akòz diferans ormon, paske yo te pèsiste nan sourit gonadectomized. Atravè tès depistaj ekspresyon diferans, nou idantifye regilatè epigenetik ki lye nan X ak XCI escapee UTX li te ye, ki te eksprime nan nivo siyifikativman pi ba nan tou de selil NK gason sourit ak imen. UTX te regle tou de kapasite selil NK ak fonksyon efèktè nan yon fason ki depann de dòz la paske UTX haploinsufficiency nan selil NK fi yo te ase pou ogmante nimewo selil NK pandan y ap afekte pwodiksyon cytokine ak cytotoxicity. Fi selil NK UTX-defisyan yo montre pèsistans yap ogmante jiska nan vivo ak rezistans nan apoptoz ex vivo, osi byen ke ogmante sansiblite nan enfeksyon MCMV. Efè sa yo te endepandan de aktivite demethylase intrinsèque UTX a, kòm nimewo selil NK ak pwodiksyon entèferon (IFN) yo pa t chanje nan sourit ki eksprime yon mutan UTX 'demethylase-mouri'. Analiz entegratif lè l sèvi avèk tès la pou chromatin transposaz aksesib lè l sèvi avèk sekans (ATAC-seq), sekans RNA esansyèl (RNA-seq), ak anti-UTX CUT & Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation Assay) nan sovaj-tip (WT) ak UTX- selil NK ensufizant yo revele yon wòl enpòtan pou UTX nan reglemante ekspresyon loci jèn ki enplike nan kapasite selil NK ak repons efèktè yo. Konklizyon nou yo idantifye UTX kòm yon gwo chofè diferans sèks nan omeyostazi selil NK ak fonksyon efèktè atravè modulation ekspresyon jèn ki endepandan demethylase.

Desert ginseng-Improve immunity (23)

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

Klike la a pou w wè pwodwi Cistanche Enhance Immunity

【Mande plis】 Imèl:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

Rezilta yo

NK dimorphism seksyèl se endepandan de òmòn sèks gonadal

Yon envestigasyon resan ki te ekzamine larat sourit C57BL/6 rapòte ogmante kantite selil NK nan gason kont fi19. Konfòm ak done sa yo, nou obsève ke selil NK larat (idantifye kòm CD3− TCR − NK1.1+; Done pwolonje Fig. 1a) yo ogmante nan frekans (Fig. 1a, b) ak nimewo absoli (Fig. 1c). ) nan sourit gason C57BL/6 konpare ak fi. Konklizyon sa yo sijere ke lòt karakteristik seksyèlman dimòfik pi lwen pase nimewo selil NK yo ka kont pou ogmante sansiblite gason nan enfeksyon viral. An repons a enfeksyon viral, selil NK yo enpòtan anpil pou pwodiksyon bonè nan sitokin pro-enflamatwa, patikilyèman IFN- 20-22. Pou teste si diferans sèks egziste nan fonksyon NK selil-intrinsèk, nou konpare pwodiksyon cytokine effector nan selil NK izole nan sourit fi kont gason ex vivo. Stimulasyon ak pro-enflamatwa cytokines interleukin (IL)-12 ak IL{-15 te lakòz pi ba pwodiksyon IFN pa selil NK gason (figi 1d, e ak done pwolonje fig. 1b). Rezilta menm jan an te obsève an repons a IL-12 ak IL-18 (Done Pwolonje Fig. 1c, d), sijere yon defo respektif nan repons selil NK gason yo nan eksitasyon cytokine. Anplis de sa, selil NK imen yo (TCR − CD3− CD56+ ) izole nan selil mononikleyè san periferik (PBMCs) aktive ak IL-12 ak selil lesemi K562 te lakòz yon pi ba pousantaj IFN- + (Fig. 1f ak Done Pwolonje Fig. 1e) ak IFN- vle di entansite fliyoresans (MFI; Fig. 1g) nan gason kont fi selil NK. Kidonk, byenke nimewo selil NK yo ogmante, pwodiksyon cytokine efèktè selil NK gason yo toujou redwi nan tou de sourit ak imen an repons a sitokin pro-enflamatwa pwovoke pandan enfeksyon viral.

Sèks fi oswa gason baze sou yon konpoze òmòn gonadal (pa egzanp, estwojèn oswa androjèn) ak kwomozòm sèks (pa egzanp, 46XX oswa 46XY)1. Etid anvan yo te demontre efè dirèk nan òmòn gonadal nan règleman pwodiksyon IFN pa selil NK23, men li rete posib ke diferans sèks selil NK yo ta ka tou atribiye a faktè selil-intrinsèk yo. Pou idantifye efè òmòn sèks-medyatè, nou egzamine abondans selil NK ak fonksyon nan sourit gonadectomized. Gonadektomi echwe pou pou elimine diferans sèks nan frekans selil NK (Fig. 1h ak Done Pwolonje Fig. 1f), nimewo absoli (Fig. 1i) ak pwodiksyon IFN-pwoteyin an repons a eksitasyon cytokine (Fig. 1j, k ak Done Pwolonje Fig. 1g), ki endike òmòn gonadal yo pa responsab sèlman pou diferans sèks nan selil NK yo. Pandan ke sous-ansanm spirasyon selil NK yo idantifye pa ekspresyon CD11b ak CD27 gen kapasite diferans pou siviv ak fonksyon efèktè24, selil NK larat ki sòti nan swa WT oswa sourit gonadectomized fi ak gason pa t 'montre diferans enpòtan nan frekans nan sourit spirasyon selil NK (Done pwolonje Fig. . 1h–k). Rezilta sa yo endike ke prejije sèks yo obsève nan nimewo selil NK ak fonksyon efèktè yo pa akòz eta matirite diferans. Kidonk, nou te sipoze ke dòz kwomozòm sèks yo ka kontribye nan abondans selil NK diferans ak fonksyon ant sèks.

Desert ginseng-Improve immunity (3)

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

UTX chape X inaktivasyon epi li eksprime plis nan fi

Pandan ke 46XX fi yo sibi XCI pou kontwole dòz jèn ki lye ak X, yon ti gwoup jèn chape XCI (yo rele XCI escapees), souvan sa ki lakòz pi wo ekspresyon nan fi konpare ak gason25,26. Kidonk, ogmante ekspresyon XCI escapee nan fi konpare ak gason te kapab potansyèlman medyatè diferans sèks nan selil NK. Pandan ke diferan jèn chape X inaktivasyon nan imen ak sourit, senk jèn (XIST, DDX3X, KDM6A, EIF2S3, KDM5C) te deja idantifye kòm moun ki sove XCI nan tou de27. XIST te eskli nan plis analiz paske li pa eksprime nan selil gason akòz wòl li te ye nan XCI nan selil fi yo. Tout kat jèn ki rete yo te siyifikativman downregulated nan gason kont fi selil NK, nan tou de moun (Fig. 2a) ak sourit (Fig. 2b). Nivo transkripsyon Kdm6a (ki kode UTX) montre ekspresyon ki pi seksyèlman dimòfik nan selil NK moun ak sourit (figi 2a, b). Selil NK gason yo te eksprime tou pi ba nivo pwoteyin UTX konpare ak selil NK fi nan sourit (figi 2c, d). Diferans sa yo nan nivo transkripsyon Kdm6a ak nivo pwoteyin UTX te pèsiste nan tou de sourit gonadectomized (figi 2e-g) ak sourit kat jenotip nwayo (FCG) (Done pwolonje fig. 2a) kote konpleman kwomozòm sèks (XX oswa XY) dekonekte soti nan. ògàn sèks gonadal (òvèj oswa tèstikul)28. Done sa yo endike nivo ekspresyon Kdm6a (UTX) yo gen patipri sèks nan selil NK epi prensipalman dikte pa dòz X-kwomozòm olye ke òmòn gonadal.

UTX siprime kapasite selil NK

Pou detèmine si UTX medyatè diferans sèks yo obsève nan selil NK, nou te pwodwi yon seri de sourit ak pèt UTX ki depann de dòz la. Premyèman, nou te pwodwi sourit fi ki gen yon sipresyon eterozigot nan UTX nan selil NK (Kdm6afl / WT Ncr1Cre +, yo refere yo kòm UTXHet; Tablo Done Siplemantè 1) pou imite yon sèl kopi UTX ki eksprime nan gason. Nou konfime ekspresyon pwoteyin UTX selil NK ki sanble ant fi UTXHet ak sourit gason WT (Kdm6afl/y Ncr1Cre-) (Done pwolonje Fig. 2b). Sourit UTXHet fi yo te montre nimewo selil NK larat ki sanble konpare ak WT gason (Fig. 3a, b), epi tou de te montre kantite selil NK yo te konpare ak WT fi. Pa gen okenn diferans enpòtan nan spirasyon pa ekspresyon CD11b ak CD27 yo te obsève ant selil NK soti nan WT fi, WT gason, ak sourit UTXHet fi (Done pwolonje Fig. 2c). Kidonk, pèt yon kopi UTX te ase pou ogmante nimewo selil NK yo nan yon fason endepandan pou spirasyon. Apre sa, nou te pwodwi sourit ak yon sipresyon omozigot nan UTX (Kdm6afl/flNcr1Cre +, yo refere yo kòm UTXNKD; Done Siplemantè Tablo 1), sa ki lakòz pèt tou de kopi UTX nan selil NK. Ekspresyon pwoteyin UTX te siyifikativman pi ba nan selil fi UTXNKD NK konpare ak selil fi WT NK pa sikometri koule (Done pwolonje Fig. 2b), osi byen ke pi ba konpare ak selil NK ak yon sèl kopi UTX (ki se, gason WT ak fi UTXHet). ). Absans pwoteyin UTX nan gwosè a prevwa (180 kD) nan UTXNKD fi konpare ak selil WT NK te konfime pa Western blot (Done pwolonje Fig. 2d). NK selil frekans ak nimewo absoli ogmante ak diminye nimewo kopi UTX (figi 3c, d ak done pwolonje Fig. 3a). Done sa yo enplike UTX nan reglemante frekans selil NK ak nimewo absoli nan yon fason ki depann de dòz la.

Fig. 1 | Sex differences in IFN-γ production and NK cell numbers are independent of gonadal hormones. a–c, Representative dot plots (a), frequency (b), and absolute numbers (c) of splenic NK cells (CD3− TCRβ− NK1.1+ ) in female and male C57BL/6 mice (n = 15 per group). d,e, Percentage IFN-γ+ (d) and normalized IFN-γ MFI (e) of total splenic NK cells from female versus male mice cultured with no treatment (NT) or IL-15 (50 ng ml−1) and IL-12 (20 ng ml−1) for 4 h, normalized to MFI of female IL-15/IL-12 treatment (n = 8 per group). f,g, Percentage IFN-γ+ (f) and normalized IFN-γ MFI (g) of CD3− CD56+ female (n = 6) and male (n = 7) human NK cells cultured and stimulated with 10 ng ml−1 of IL-12 for 16 h in the presence of K562 cells, normalized to MFI of female IL-12 treatment. h, i, Frequency (h) and absolute numbers (i) of splenic NK cells in gonadectomized female and male mice (n = 18 per group). j,k, Percentage IFN-γ+ (j) and normalized IFN-γ MFI (k) of total splenic NK cells isolated from gonadectomized female and male mice and cultured with NT or IL-15 (50 ng ml−1) and IL-12 (20 ng ml−1) for 4 h (n = 12 per group). Data are representative of 2–4 independent experiments. Samples were compared using a two-tailed unpaired Student's t-test and data points are presented as individual mice with the mean ± s.e.m. (*P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001; ****P < 0.0001). Specific P values are as follows: b = 0.0002; c = 0.006; d = 0.0036; e = 0.0013; f = 0.04; g = 0.03; h < 0.0001; i = 0.0006; j = 0.0234; k = 0.0019.

Figi 1|Diferans sèks nan pwodiksyon IFN ak nimewo selil NK yo endepandan de òmòn gonadal yo. a–c, Reprezantatif pwen (a), frekans (b), ak nimewo absoli (c) nan selil NK larat (CD3− TCR − NK1.1+) nan sourit C57BL/6 fi ak gason (n { {7}} pou chak gwoup). d,e, Pousantaj IFN- + (d) ak IFN-MFI nòmalize (e) nan total selil NK lasèn ki soti nan sourit fi kont gason ki kiltive san tretman (NT) oswa IL{{10} } (50 ng ml-1) ak IL-12 (2{0 ng ml-1) pou 4 h, nòmalize nan MFI nan IL-15/IL{ {18}} tretman (n=8 pou chak gwoup). f,g, Pousantaj IFN{{20}} (f) ak IFN-MFI nòmal (g) CD3− CD56+ fi (n=6) ak gason (n {{ {25}}) selil NK imen kiltive ak ankouraje ak 10 ng ml-1 IL-12 pou 16 èdtan nan prezans selil K562, nòmalize nan MFI nan IL fi-12 tretman. h, i, Frekans (h) ak nimewo absoli (i) nan selil NK larat nan sourit fi ak gason gonadectomized (n=18 pou chak gwoup). j,k, Pousantaj IFN- + (j) ak IFN-MFI nòmalize (k) nan total selil NK lasèn izole nan sourit fi ak gason gonadectomized epi kiltive ak NT oswa IL-15 (50 ng ml− 1) ak IL-12 (20 ng ml-1) pou 4 h (n=12 pou chak gwoup). Done yo reprezante 2-4 eksperyans endepandan. Echantiyon yo te konpare lè l sèvi avèk yon tès t Elèv ki pa marye ak de-tail ak pwen done yo prezante kòm sourit endividyèl ak mwayèn ± sem (*P <0.05; **P <0.01; ***P <0.001; ****P). <0.0001). Valè P espesifik yo jan sa a: b=0.0002; c=0.006; d=0.0036; e=0.0013; f=0.04; g=0.03; h <0.0001; mwen=0.0006; j=0.0234; k=0.0019.

Pou defini mekanis ki kache nimewo selil NK ogmante nan sourit UTXNKD (CD45.2+), yo te pwodui yon rapò 1:1 nan sourit melanje zo mwèl chimerik (mBMC) ak WT (CD45.1+ ). . Sis semèn apre rekonstitisyon, nou obsève yon avantaj konpetitif ki make nan selil NK fi UTXNKD (CD45.2+) konpare ak WT nan benefisyè fi (CD451x2) apre transplantasyon mwèl zo (Done pwolonje Fig. 3b, c). Kontrèman ak selil NK, selil T ki soti nan menm donatè (UTXNKD, CD45.2+), ki se UTX ase akòz NK-espesifik sipresyon UTX, parèt rapò piki orijinal la (1: 1; Pwolonje Done Fig. .3b,c). Done sa yo sijere UTX reprime nimewo selil NK nan yon fason selil-intrinsèk pandan devlopman. Pou teste si fenotip sa a te kondwi pa diferans nan pwopagasyon, nou analize makè divizyon selilè Ki67 nan selil NK larat nan sourit WT: UTXNKD mBMC, sou fòm piki nan yon rapò 4:1 pou nòmalize nimewo selil ant jenotip yo. Paradoksal, selil UTXNKD NK yo te montre pi ba frekans selil Ki67+ epi yo te montre mwens dilution CFSE an repons a IL-15 (Done Pwolonje Fig. 3d,e). Rezilta sa yo sijere ke nimewo selil NK ki pi wo yo obsève nan sourit UTXNKD yo pa t akòz ogmante pwopagasyon. Bay rezilta sa yo, nou te sipoze ke frekans ki wo nan selil NK nan sourit UTXNKD (Fig. 3c, d) ta ka akòz kapasite selilè amelyore nan selil NK nan absans ekspresyon UTX. Pou teste posiblite sa a, yo te make selil NK lasèn WT (CD451x2) ak UTXNKD (CD45.2+) konjenik distenk yo ak Cell Trace Violet (CTV) epi yo te transfere nan moun k ap resevwa WT (CD45.1+ ). 1:1 rapò (Done pwolonje Fig. 3f). Nan jou 7 apre transfere, popilasyon an transfere te skewed nan direksyon UTXNKD selil NK nan larat moun k ap resevwa (Fig. 3e, f), demontre selil-intrinsèk UTX repwesyon nan omeyostazi selil NK ki gen matirite. Diferans sa a pa t akòz pwopagasyon chanje, paske dilution CTV pa tou de popilasyon transfere yo te minim nan jou 7 apre transfè (Done pwolonje Fig. 3g). Pou teste si UTX te reprime omeyostaz selil NK atravè règleman apoptoz, nou te konpare ekspresyon kaspase 3 k ap fè nan selil NK ki te enkube ak swa IL-15 pou kont li oswa avèk IL-15 ak yon pwodiktè apoptoz, Nutlin{{42. }}a29. Ekspresyon UTX ki pi ba yo korelasyon ak diminye selil NK kaspas 3+ nan prezans IL-15 ak Nutlin-3 yon tretman (figi 3g, h). Anplis, selil NK gason yo te montre tou yon diminisyon modès men siyifikatif nan frekans kaspas 3+ selil NK k ap fè fas an repons a Nutlin-3a konpare ak selil NK fi, ki te pèsiste tou nan sourit gonadectomized (Done pwolonje). Figi 3h–k). Anplis, règleman nan apoptoz selil NK ak siviv depann sou nivo ekspresyon relatif Bcl-2 (faktè anti-apoptotik)30, ki ka antagonize pa Bim (faktè pro-apoptotik)31. Selil UTXNKD NK yo te montre ogmante ekspresyon pwoteyin entraselilè Bcl -2 ak yon ogmantasyon modès nan Bim (Fig. 3i, j ak Done Pwolonje Fig. 3l) konpare ak selil WT NK. Sa a te lakòz yon ogmantasyon siyifikativman Bcl-2:Bim rapò nan selil UTXNKD NK (figi 3k). Selil NK gason yo te montre tou yon ogmantasyon siyifikatif nan rapò Bcl-2:Bim (Fig. 3l), ki te pèsiste apre gonadektomi (Fig. 3m). Ansanm, done sa yo demontre ke nivo UTX ki chanje yo ka kache diferans sèks nan kondisyon fizik selil NK atravè règleman ekspresyon Bcl-2.

Fig. 2 | X-linked UTX displays sexually dimorphic gene expression independent of sex hormones.a Normalized expression of XCI escapee genes using DICE database RNA-seq data on sorted NK cells from human females (n = 36) versus males (n = 54) normalized to females. b, Normalized expression of XCI escapee genes by quantitative PCR with reverse transcription (RT–qPCR) in splenic NK cells from female versus male mice (C57BL/6; 8 weeks old, n = 5 per group). Genes are ordered by increasing fold change between females and males from left to right. c,d, Representative histogram (c) and normalized MFI (d) of UTX protein expression in splenic NK cells from naive female versus male mice by flow cytometry, normalized to MFI of female mice (C57BL/6; 8 weeks old; n = 15 per group). e, Relative expression of Kdm6a (UTX) by RT–qPCR of isolated splenic NK cells normalized to females (n = 6 per group). f,g Representative histograms (f) and relative UTX MFI (g) of NK cells by flow cytometry from spleens of gonadectomized female and male mice (n = 6 per group) normalized to female. Samples were compared using unpaired two-tailed Student's t-test and data points are presented as individual mice with the mean ± s.e.m. (*P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001). Specific P values are as follows: a < 0.001; b: Ddx3x = 0.03, Kdm5c = 0.0017, Eif2s3 = 0.0113, Kdm6a = 0.000087; d = 0.003; e = 0.008; g = 0.0029).

Figi 2|UTX ki lye ak X montre ekspresyon jèn dimòfik seksyèlman endepandan de òmòn sèks yo.a Ekspresyon nòmalize jèn XCI ki sove lè l sèvi avèk done RNA-seq baz done DICE sou selil NK ki klase nan fi imen (n=36) kont gason (n {{4} }}) nòmalize pou fi. b, Nòmalize ekspresyon jèn XCI escapee pa PCR quantitative ak ranvèse transkripsyon (RT-qPCR) nan selil NK lasèn soti nan sourit fi kont gason (C57BL/6; 8 semèn fin vye granmoun, n=5 pou chak gwoup). Jèn yo bay lòd lè yo ogmante chanjman pliye ant fi ak gason de goch a dwat. c, d, Istogram reprezantan (c) ak MFI nòmalize (d) nan ekspresyon pwoteyin UTX nan selil NK larat ki soti nan sourit nayif fi kont gason pa sikometri koule, nòmalize nan MFI sourit fi (C57BL/6; 8 semèn fin vye granmoun; n { {12}} pou chak gwoup). e, Ekspresyon relatif nan Kdm6a (UTX) pa RT-qPCR nan selil izole NK lasèn nòmalize nan fi (n=6 pou chak gwoup). f,g Istogram reprezantan (f) ak relatif UTX MFI (g) nan selil NK pa sikometri koule soti nan larat nan sourit fi ak gason gonadectomized (n=6 pou chak gwoup) nòmalize nan fi. Echantiyon yo te konpare lè l sèvi avèk tès t Elèv ki pa marye ak de ke yo ak pwen done yo prezante kòm sourit endividyèl ak mwayèn ± sem (*P <0.{{20}}5; **P <0.01; ***P <0.001). Valè P espesifik yo jan sa a: a < 0.001; b: Ddx3x=0.03, Kdm5c=0.0017, Eif2s{3 = 0.0113, Kdm6a=0.000087; d=0.003; e=0.008; g=0.0029).

UTX amelyore fonksyon efè selil NK

Paske selil NK gason yo te parèt diminye pwodiksyon IFN (figi 1d, e) endepandan de òmòn gonadal (figi 1j,k) nou te chèche detèmine si fenotip sa a te regle pa nivo UTX yo. Apre eksitasyon sitokin, frekans ak kantite absoli selil ki pwodui IFN- -(figi 4a ak done pwolonje fig. 4a,b) ak IFN-MFI (figi 4a) te sanble ant gason WT ak fi UTXHet NK. selil yo. Pwodiksyon IFN pa selil fi UTXHet NK te entèmedyè ant fi WT ak fi selil UTXNKD NK (figi 4a ak done pwolonje fig. 4a, b). Tandans sa a te obsève tou lè w konpare akimilasyon IFN selil NK pa ELISA (figi 4b). Anplis, fenomèn sa a pa t espesifik nan IFN-, paske pwodiksyon granulocyte-macrophage koloni-stimulan faktè (GM-CSF), yon pro-enflamatwa NK efèktè molekil32, te tou redwi ak diminye kantite kopi UTX nan selil NK fi (figi 4c). ).

Anplis pwodiksyon cytokine, aktivite cytolytic selil NK enpòtan anpil pou defans antiviral33 ak antitumoral34. Pou evalye diferans sèks nan cytotoxicity selil NK, nou te fè tès touye ak gwo konplèks istokonpatibilite (MHC) klas I-defisi selil MC38 kòm sib. Nan yon efè 4: 1: rapò sib, selil gason WT NK parèt siyifikativman pi ba lysis selil sib konpare ak WT fi (Fig. 4d), ki te soutni nan sourit gonadectomized (Done pwolonje Fig. 4c). Defisyans selil sib selil NK gason yo pa t akòz diferans ki genyen nan degranulasyon, paske nivo CD107a yo te sanble ant selil NK fi ak gason (Done pwolonje Fig. 4d, e). Sepandan, gason te pwodwi nivo siyifikativman pi ba nan molekil sitotoksik perforin ak granzyme B an repons a IL -15 ak anti-NK1.1 aktive ligasyon reseptè (Done pwolonje Fig. 4d, e). Miyò, selil UTXHet ak gason WT NK yo te montre kapasite touye menm jan an (figi 4d), ki te entèmedyè ant selil fi WT ak UTXNKD NK (figi 4d). Ansanm, done sa yo sijere ke UTX amelyore sitotoksisite selil NK nan yon fason ki depann de dòz la.

Desert ginseng-Improve immunity (2)

cistanche tubulosa-amelyore sistèm iminitè

Lè nou konsidere efè yo obsève nan pèt UTX sou fonksyon efè selil NK, nou egzamine si sourit UTXNKD yo te pi vilnerab a enfeksyon viral. Pwodiksyon rapid IFN- ak GM-CSF enpòtan anpil pou NK selil-medyatè kontwòl antiviral20. Enpresyonan, sourit UTXNKD rapidman sikonbe nan enfeksyon (n=3/8 siviv) lè yo defi ak yon dòz subletal nan MCMV (Fig. 4e). Anplis, UTX-defisi selil NK larat parèt yon defo ki make nan pwodiksyon IFN- ak pwodiksyon granzyme B nan total selil NK nan jou 1.5 apre enfeksyon (Fig. 4f ak Done Pwolonje Fig. 4f, g). Anplis de sa, yo te obsève yon defo menm jan an nan pwodiksyon IFN- pa UTXNKD nan tout sous-ansanm spirasyon (Done pwolonje Fig. 4h), ki enplike UTX nan kontwòl pwodiksyon IFN- nan yon fason endepandan spirasyon. Pou konfime si dòz la nan ekspresyon UTX nan selil NK ki gen matirite asosye ak pwodiksyon an nan IFN- pandan enfeksyon viral nan vivo, nou te pwodwi sourit transjenik yo reyalize yon sipresyon UTX tamoksifèn-induire (Kdm6afl/fl Rosa26ERT2CRE +, aprè sa refere yo kòm iUTX-/). −; Done siplemantè Tablo 1). Sourit mBMC yo te pwodwi ak yon melanj 1:1 WT (CD45.1+) ak iUTX-/- (CD45.2+) pou limite sipresyon UTX nan lòj ematopoyetik la. WT: iUTX-/-mBMC sourit yo te trete ak tamoksifèn imedyatman anvan enfeksyon ak MCMV pou elimine ekspresyon UTX (figi 4g). IDX-/- (CD45.2+) Selil NK yo te pwodwi mwens IFN- konpare ak tokay WT yo (Fig. 4h ak Done Pwolonje Fig. 4i). Administrasyon tamoksifèn nan sourit WT: iUTX-/- mBMC te lakòz diferan degre pèt pwoteyin UTX epi li te montre yon korelasyon pozitif enpòtan ant nivo UTX intraselilè ak pwodiksyon IFN nan jou 1.5 apre enfeksyon (Fig. 4i). Rezilta sa yo demontre ke nivo selil-intrinsèk UTX nan selil NK ki gen matirite kontwole pwodiksyon molekil efèktè ak pwoteksyon ki vin apre kont enfeksyon MCMV.

Fig. 3 | UTX suppresses NK cell fitness. a,b, Frequency (F and M WT: n = 12; F UTXHet: n = 16; a) and absolute numbers (F WT: n = 6; M WT: n = 8; F UTXHet: n = 9; b) of NK cells in the spleen of female (F) WT, male (M) WT and F UTXHet mice. c,d, Frequency (WT: n = 12; UTXHet: n = 16; UTXNKD: n = 6; c) and absolute numbers (WT: n = 8; UTXHet: n = 12; UTXNKD: n = 6; d) of NK cells in spleen of F WT, UTXHet and UTXNKD mice. e, Representative contour plots of congenically distinct WT (CD451x2 ) and UTXNKD (CD45.2+ ) NK cells transferred into WT (CD45.1+ ) recipients at a 1:1 ratio before injection (left) and on day 7 after transfer (right). f, Frequency of WT and UTXNKD cells in the spleen of recipient mice before injection and day 7 after transfer (n = 6). g,h, Representative histograms (g) and percentage (h) of cleaved caspase 3+ NK cells of female WT, UTXHet, and UTXNKD mice cultured with IL-15 (5 ng ml−1) and either dimethylsulfoxide (DMSO; F WT: n = 7; F UTXHet: n = 11; F UTXNKD: n = 6) or 2.5 μM Nutlin-3a (F WT: n = 3; F UTXHet: n = 7; F UTXNKD: n = 3) for 24 h. i–k, Normalized Bcl-2 MFI (i), Bim MFI (j), and Bcl-2:Bim MFI ratio (k) in splenic NK cells from female WT and UTXNKD mice (n = 5). l,m, Bcl-2:Bim MFI ratio in splenic NK cells from female WT and male WT mice (n = 6; l) and gonadectomized female and male mice (n = 11; m). Data are representative of 2–4 independent experiments. Samples were compared using ordinary one-way analysis of variance (ANOVA; a–d), two-way ANOVA with Tukey's correction for multiple comparisons (h), or unpaired two-tailed Student's t-test (f, i–m). Data points are individual mice with the mean ± s.e.m. (NS, not significant; *P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001; ****P < 0.0001). Specific P values are as follows: a: F WT versus M WT = 0.0201, M WT versus UTXHet = 0.989, F WT versus UTXHet = 0.0327, WT versus UTXNKD = 0.001; b: F WT versus M WT = 0.0320, M WT versus UTXHet < 0.99, F WT versus UTXHet = 0.0029, WT versus UTXNKD = 0.001; c: WT versus UTXHet = 0.0375, UTXHet versus UTXNKD and WT versus UTXNKD < 0.0001; d: WT versus UTXHet = 0.0191, UTXHet versus UTXNKD = 0.0278, WT versus UTXNKD = 0.001; f: Pre-injection = 0.3304; day 7 = 0.001918; h: DMSO < 0.0001, Nutlin-3a–F WT versus F UTXHet = 0.0048, rest < 0.0001; i < 0.0001; j = 0.0004; k = 0.0025; l = 0.0115; m = 0.0227.

Figi 3|UTX siprime kapasite selil NK. a,b, Frekans (F ak M WT: n=12; F UTXHet: n=16; a) ak nimewo absoli (F WT: n=6; M WT: n {{ 4}}; F UTXHet: n=9; b) nan selil NK nan larat sourit fi (F) WT, gason (M) WT ak F UTXHet sourit yo. c,d, Frekans (WT: n=12; UTXHet: n=16; UTXNKD: n=6; c) ak nimewo absoli (WT: n=8; UTXHet: n {{10}}; UTXNKD: n=6; d) nan selil NK nan larat nan sourit F WT, UTXHet ak UTXNKD. e, Trase reprezantatif kontou selil WT (CD451x2) ak UTXNKD (CD45.2+) NK konjenik distenk yo transfere nan benefisyè WT (CD45.1+ ) nan yon rapò 1:1 anvan piki (agòch) ak nan jou 7 apre transfè (adwat). f, Frekans selil WT ak UTXNKD nan larat sourit benefisyè yo anvan piki ak jou 7 apre transfè (n=6). g,h, Istogram reprezantatif (g) ak pousantaj (h) nan selil kaspas 3+ NK fenmèl sourit WT, UTXHet, ak UTXNKD ki kiltive ak IL-15 (5 ng ml-1) ak swa dimethylsulfoxide (DMSO; F WT: n=7; F UTXHet: n=11; F UTXNKD: n=6) oswa 2.5 μM Nutlin-3a (F WT: n {{ {33}}; F UTXHet: n=7; F UTXNKD: n=3) pou 24 èdtan. i–k, Nòmalize Bcl-2 MFI (i), Bim MFI (j), ak Bcl{-2:Bim MFI rapò (k) nan selil NK larat ki soti nan sourit fi WT ak UTXNKD (n {{ 39}}). l,m, Bcl{{4{0}}:Bim MFI rapò nan selil NK larat ki soti nan sourit WT fi ak sourit WT gason (n=6; l) ak sourit fi ak gason gonadectomized (n {{ 42}}; m). Done yo reprezante 2-4 eksperyans endepandan. Echantiyon yo te konpare lè l sèvi avèk òdinè analiz yon sèl-fason nan divèjans (ANOVA; a–d), de-fason ANOVA ak koreksyon Tukey a pou konparezon miltip (h), oswa depaire de-ke T-tès Elèv la (f, i-m). Pwen done yo se sourit endividyèl ak mwayèn ± sem (NS, pa enpòtan; *P < 0.05; **P <0.01; * **P < 0.001; ****P < 0.0001). Valè P espesifik yo jan sa a: a: F WT kont M WT=0.0201, M WT kont UTXHet=0.989, F WT kont UTXHet=0.0327, WT kont UTXNKD { {63}}.001; b: F WT kont M WT=0.0320, M WT kont UTXHet <0.99, F WT kont UTXHet=0.0029, WT kont UTXNKD=0.001; c: WT kont UTXHet=0.0375, UTXHet kont UTXNKD ak WT kont UTXNKD <0.0001; d: WT kont UTXHet=0.0191, UTXHet kont UTXNKD=0.0278, WT kont UTXNKD=0.001; f: Pre-piki=0.3304; jou 7=0.001918; h: DMSO <0.0001, Nutlin-3a–F WT kont F UTXHet=0.0048, rès <0.0001; mwen <0.0001; j=0.0004; k=0.0025; l=0.0115; m=0.0227.

UTX kontwole selil NK nan yon fason endepandan demethylase

Kòm yon demethylase histon, UTX ka kontwole omeyostaz selil NK ak pwogram ekspresyon jèn efèktè yo lè li katalize retire yon gwoup methyl ki soti nan histon trimethylated H3 Lys27 (H3K27me3; yon mak histon represif) pou chromatin balans pou ekspresyon jèn aktif35. Sepandan, UTX tou posede aktivite demethylase-endepandan lè li kominike avèk regilatè epigenetik ak modifye kwomatin pou kowòdone ekspresyon jèn36,37. Pou eksplore wòl aktivite UTX demethylase nan modulation NK selil omeyostaz ak fonksyon efèktè, nou te ogmante sourit ki eksprime yon UTX katalitik inaktif (UTX 'demethylase-dead' oswa sourit UTXDMD; Siplemantè Done Tablo 1) ebèje p.His1146Ala ak p.Glu1148Ala. mitasyon pwen nan domèn katalitik38. Enteresan, sourit UTXDMD ak WT fi yo te montre frekans ki sanble ak kantite absoli selil NK las (figi 5a-c), pandan y ap sourit UTXNKD te montre nimewo selil NK las yo ogmante konpare ak tou de. Konklizyon sa yo sijere ke represyon UTX a nan nimewo selil NK te demethylase-endepandan. Anplis, pa gen okenn diferans ki te obsève ant selil WT ak UTXDMD NK nan kapasite nan pwodwi IFN- an repons a eksitasyon sitokin (Fig. 5d-f). Rezilta sa yo montre ke fonksyon UTX nan restriksyon nimewo selil NK ak ankouraje pwodiksyon IFN se demethylase-endepandan. Anplis de yon sèl kopi UTX, gason eksprime katalitik inaktif Kdm6c a (ki kode pwoteyin UTY a), homolog Y-kwomozòm ki lye nan UTX. Nou konfime ke UTY sèlman eksprime nan selil NK gason soti nan imen (Done pwolonje Fig. 5a) ak sourit (Done pwolonje Fig. 5b) epi li pa te chanje pa gonadectomy nan sourit (Done pwolonje Fig. 5b). Kòm diskite pi wo a, pa gen okenn diferans ki te wè nan nimewo selil NK oswa fonksyon efèktè ant gason WT (yon kopi UTX ak UTY) ak fi UTXHet (yon kopi UTX) sourit (figi 3a, b ak 4a, d), sijere yon wòl limite pou UTY nan reglemante omeyostazi selil NK ak fonksyon efèktè. Anplis de sa, sourit gason UTXNKD (Kdm6afl/y Ncr1cre+) te montre ogmante frekans selil NK ak nimewo absoli (Done pwolonje Fig. 5c, d) ak pwodwi mwens IFN- (Done pwolonje Fig. 5e-h), konpare ak kontwòl gason WT, ki miwa chanjman yo wè nan fi ki gen defisi UTX selil NK. (Fig. 3a,b ak 4a,b). Kidonk, pèt UTX nan selil NK gen efè menm jan an nan fi ak gason.

UTX kontwole NK selil transcriptome pa remodel chromatin

Etid ki sot pase yo te idantifye sikwi regilasyon selil NK (regulons) ki premye selil lenfoyid natirèl yo pou repons efèktè rapid menm anvan deklanchman selil NK 39. Kòm yon modifye epigenetik, UTX ka chanje transkripsyon lè li òganize chromatin nan eleman regilasyon nan loci4 jèn sib {{23} }. Pou envestige modifikasyon UTX-medyatè sou aksè kwomatin ak ekspresyon jèn nan selil NK, nou te fè ATAC-seq an tandem ak RNA-seq esansyèl sou WT sòt-pirifye (CD45.1+) ak UTXNKD (CD45.{{ 9}}) NK selil ki soti nan 4:1 WT: UTXNKD mBMC sourit (Done pwolonje Fig. 6a). Sèvi ak sourit mBMC pèmèt pou yon eksperyans entèn kontwole ak minimize faktè konfonn anviwònman an. Analiz prensipal-eleman (PCA) nan tou de done ATAC-seq ak RNA-seq revele echantiyon gwoupman pa jenotip (Done pwolonje Fig. 6b). ATAC-seq revele 3,569 pik diminye ak 2,113 pik ogmante nan aksè nan UTXNKD konpare ak selil WT NK (chanjman log2 pliye > ±0.5, ajiste valè P <0.05. , to dekouvèt fo (FDR) < 0.05; Done Siplemantè Tablo 2). Anplis, RNA-seq idantifye 701 diminye ak 554 ogmante jèn nan UTXNKD kont WT (log2 pliye chanjman> ± 0.5, ajiste valè P <0.05, FDR <0.05; Pwolonje Done Fig. 6c ak Tablo Done Siplemantè 3). Konklizyon sa yo sijere chanjman pwofon nan tou de jaden flè nan chromatin ak transcriptome nan selil NK nan absans UTX.

Desert ginseng-Improve immunity (15)

cistanche plant-ogmante sistèm iminitè

Analiz entegratif ATAC-seq ak RNA-seq idantifye 395 jèn ki tou de diferan aksesib epi eksprime ak yon korelasyon pozitif enpòtan (korelasyon Spearman: R=0.62, P <2.2 × 10-16) ant log2 an mwayèn. chanjman pliye nan pik ATAC-seq ak log2 chanjman pliye nan ekspresyon RNA-seq (Done pwolonje Fig. 6d). Fuzzy c-means gwoupman tou de gwoup done ATAC-seq ak RNA-seq yo te idantifye sis gwo gwoup ki te siyifikativman diminye (grap 1, 2, 3 ak 6) oswa ogmante (grap 4 ak 5) inaksesiblite (figi 6a) ak ekspresyon. (Fig. 6b) nan selil UTXNKD NK. Pou analiz anrichisman fonksyonèl, yo te itilize g:Profiler pou analize gwoup jèn ki eksprime diferan ki idantifye pa RNA-seq (figi 6c). Gwo chemen tankou pwosesis sistèm iminitè, pwodiksyon sitokin, pwodiksyon IFN, aktivasyon lenfosit ak pwosesis efè iminitè yo te asosye ak ekspresyon diminye nan UTXNKD (grap 1, 2, 3 ak 6; Fig. 6c). Pandan se tan, chemen tankou pwosesis devlopman, pwosesis byosentetik ak pwosesis metabolik yo te siyifikativman asosye ak ekspresyon ogmante nan UTXNKD (grap 4 ak 5; Fig. 6c). Nan nòt, analiz de jèn chemen lanmò selil revele jèn miltip yo dwe eksprime diferan (Done pwolonje Fig. 6e). Miyò, ekspresyon jèn anti-apoptotik Bcl2 la te ogmante, pandan y ap jèn pro-apoptotik Casp3 te diminye (Done pwolonje Fig. 6e). Ansanm, rezilta sa yo enplike pèt UTX rezilta yo nan modifikasyon aksè chromatin ak ekspresyon jèn ki asosye ak omeyostazi selil NK ak fonksyon efèktè.

Fig. 4 | UTX enhances NK cell effector function and is required for survival against viral infection. a Percentage IFN-γ+ and normalized IFN-γ MFI of NK cells from female WT (n = 8), male WT (n = 8), female UTXHet (n = 12) and female UTXNKD (n = 6) mice with no treatment (NT) or IL-15 (50 ng ml−1) and IL-12 (20 ng ml−1) for 4 h, normalized to MFI of female IL-15/IL-12 treatment. b,c, IFN-γ (b) and GM-CSF (c) concentrations measured by ELISA in supernatants from female WT (n = 4), UTXHet (n = 5) and UTXNKD (n = 3) NK cells with NT or IL-12 (20 ng ml−1) and IL-18 (10 ng ml−1) for 4 h. d, Specific lysis of MHCI-deficient MC38 (target) cells by female WT (n = 5), male WT (n = 8), female UTXHet (n = 12) or female UTXNKD (n = 6) NK (effector) cells for 16 h at a 4:1 effector: target ratio, normalized to lysis by female WT. e, Kaplan–Meier survival curves of WT and UTXNKD mice infected with MCMV (n = 8). Mantel–Cox test (P = 0.0093). f, Percentage IFN-γ+ (n = 14), normalized IFN-γ MFI (n = 14) and granzyme B (GzmB) MFI (n = 8) relative to WT in splenic NK cells on D1.5 after MCMV infection of 4:1 WT:UTXNKD mBMC mice. g, Schematic of 1:1 WT (CD45.1+ ) and iUTX−/− (CD45.2+ ) bone marrow (BM) transferred into busulfan-depleted hosts and treated with 1 mg tamoxifen for 3 d before MCMV infection. h, Percentage IFN-γ+ and normalized IFN-γ MFI of NK cells from 1:1 WT:iUTX−/− mBMC mice on D1.5 after MCMV infection, normalized to WT (n = 6). i, Two-tailed Pearson correlation of IFN-γ versus UTX MFI of NK cells (n = 12; r 2 = 0.775; P < 0.0001). Data are representative of 2–3 independent experiments. Two-way ANOVA (a–c), one-way ANOVA with Tukey's correction for multiple comparisons (d), or paired two-tailed Student's t-test (f,h) were used. Data points are individual mice with the mean ± s.e.m. *P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001; ****P < 0.0001. Specific P values: a: F WT versus M WT = 0.0027, F WT versus F UTXHet and F WT versus F UTXNKD < 0.0001, M WT versus F UTXHet = 0.269, F UTXHet versus F UTXNKD = 0.0007; b: WT versus UTXHet = 0.0037, UTXHet versus UTXNKD = 0.0011, WT versus UTXNKD < 0.0001; c: WT versus UTXHet = 0.0026, UTXHet versus UTXNKD = 0.0349, WT versus UTXNKD < 0.0001; d: F WT versus M WT = 0.0005, F WT versus F UTXHet and F WT versus F UTXNKD < 0.0001, M WT versus F UTXHet = 0.1616, F UTXHet versus F UTXNKD = 0.0439; f: %IFN-γ+ < 0.0001, IFN-γ MFI = 0.0024, GzmB = 0.0032; g: %IFN-γ+ < 0.0001, IFN-γ MFI = 0.0018. PI, post-infection.

Figi 4|UTX amelyore fonksyon efèktè selil NK epi li nesesè pou siviv kont enfeksyon viral. yon pousantaj IFN- + ak IFN-MFI nòmal nan selil NK ki soti nan WT fi (n=8), WT gason (n=8), UTXHet fi (n=12) ak sourit fi UTXNKD (n=6) ki pa gen okenn tretman (NT) oswa IL-15 (5{{70}} ng ml-1) ak IL{{1{{8{ {82}}}}}} (2{0 ng ml-1) pou 4 èdtan, nòmalize nan MFI nan tretman fi IL-15/IL-12. b,c, IFN- (b) ak GM-CSF (c) konsantrasyon mezire pa ELISA nan supernatant soti nan WT fi (n=4), UTXHet (n=5) ak UTXNKD (n {{2} 0}}) selil NK ak NT oswa IL-12 (20 ng ml-1) ak IL-18 (1{{1{{1{{115} }8}}4}} ng ml−1) pou 4 h. d, Liz espesifik selil MC38 (sib) ki pa gen MHCI pa WT fi (n {{30}}), WT gason (n=8), UTXHet fi (n=12). ) oswa fi UTXNKD (n=6) NK (efèktè) selil pou 16 èdtan nan yon efè 4:1: rapò sib, nòmalize nan liz pa WT fi. e, koub siviv Kaplan-Meier sourit WT ak UTXNKD ki enfekte ak MCMV (n=8). Tès Mantel-Cox (P=0.0093). f, Pousantaj IFN- + (n=14), nòmalize IFN-MFI (n=14) ak granzyme B (GzmB) MFI (n=8) parapò ak WT nan larat Selil NK sou D1.5 apre enfeksyon MCMV nan sourit 4:1 WT:UTXNKD mBMC. g, Chema 1:1 WT (CD45.1+) ak iUTX-/- (CD45.2+) mwèl zo (BM) transfere nan lame ki apovri nan busulfan epi trete ak 1 mg tamoksifèn pou 3 d anvan enfeksyon MCMV. h, Pousantaj IFN - + ak nòmalize IFN-MFI nan selil NK soti nan 1:1 WT: iUTX-/-mBMC sourit sou D1.5 apre enfeksyon MCMV, nòmalize nan WT (n=6). mwen, De-tailed Pearson korelasyon nan IFN- kont UTX MFI nan selil NK (n=12; r 2=0.775; P <0.0001). Done yo reprezante 2-3 eksperyans endepandan. Yo te itilize ANOVA de-fason (a–c), ANOVA yon sèl-fason ak koreksyon Tukey a pou konparezon miltip (d), oswa tès t Elèv (f,h). Pwen done yo se sourit endividyèl ak mwayèn ± sem *P <0.05; **P <0.01; ***P <0.001; ****P <0.0001. Valè P espesifik: a: F WT kont M WT=0.0027, F WT kont F UTXHet ak F WT kont F UTXNKD < 0.0001, M WT kont F UTXHet=0.269, F UTXHet kont F UTXNKD=0.0007; b: WT kont UTXHet=0.0037, UTXHet kont UTXNKD=0.0011, WT kont UTXNKD <0.0001; c: WT kont UTXHet=0.0026, UTXHet kont UTXNKD=0.0349, WT kont UTXNKD <0.0001; d: F WT kont M WT=0.0005, F WT kont F UTXHet ak F WT kont F UTXNKD < 0.0001, M WT kont F UTXHet=0.1616, F UTXHet kont F UTXNKD {{112 }}.0439; f: %IFN- + <0.0001, IFN- MFI=0.0024, GzmB=0.0032; g: %IFN- + <0,0001, IFN-MFI=0,0018. PI, apre enfeksyon.

Fig. 5 | UTX controls NK cell homeostasis and IFN-γ production independent of demethylase activity. a–c, Representative density plots (a), frequency (b), and absolute number (c) of NK cells in the spleens of female WT, UTXDMD, and UTXNKD mice (n = 5 per group). d–f, Representative contour plots (d), percentage IFN-γ+ (e), and normalized IFN-γ MFI (f) of female WT, UTXDMD, and UTXNKD NK cells (n = 5 per group) normalized to WT. Data are representative of 2–3 independent experiments. Samples were compared using one-way ANOVA with Tukey's correction for multiple comparisons. Data points are presented as individual mice with the mean ± s.e.m. *P < 0.05; **P < 0.01; ****P < 0.0001. Specific P values are as follows: b: WT versus UTXDMD = 0.7353, WT versus UTXNKD and UTXDMD versus UTXNKD < 0.0001; c: WT versus UTXDMD = 0.4888, WT versus UTXNKD and UTXDMD versus UTXNKD < 0.0001; e: WT versus UTXDMD = 0.855, WT versus UTXNKD = 0.0030, UTXDMD versus UTXNKD = 0.0380; f: WT versus UTXDMD = 0.1382, WT versus UTXNKD = 0.0079, UTXDMD versus UTXNKD = 0.0166.

Figi 5|UTX kontwole omeyostazi selil NK ak pwodiksyon IFN endepandan de aktivite demethylase. a–c, Konplo dansite reprezantan (a), frekans (b), ak nimewo absoli (c) nan selil NK nan larat sourit fi WT, UTXDMD, ak UTXNKD (n=5 pou chak gwoup). d–f, Kontour reprezantatif (d), pousantaj IFN- + (e), ak nòmalize IFN-MFI (f) nan selil WT, UTXDMD, ak UTXNKD NK fi (n=5 pou chak gwoup) nòmalize nan WT. Done yo reprezante 2-3 eksperyans endepandan. Yo te konpare echantiyon yo lè l sèvi avèk yon sèl-fason ANOVA ak koreksyon Tukey a pou konparezon miltip. Pwen done yo prezante kòm sourit endividyèl ak mwayèn ± sem *P <0.05; **P < 0.01; ****P < 0.0001. Valè P espesifik yo jan sa a: b: WT kont UTXDMD=0.7353, WT kont UTXNKD ak UTXDMD kont UTXNKD <0.0001; c: WT kont UTXDMD=0.4888, WT kont UTXNKD ak UTXDMD kont UTXNKD <0.0001; e: WT kont UTXDMD=0.855, WT kont UTXNKD=0.0030, UTXDMD kont UTXNKD=0.0380; f: WT kont UTXDMD=0.1382, WT kont UTXNKD=0.0079, UTXDMD kont UTXNKD=0.0166.

Lè nou konsidere diferans ki genyen nan tout genòm nan aksè ak ekspresyon jèn nou obsève pa ATAC-seq ak RNA-seq, nou menm tou nou eksplore efè dirèk UTX-medyatè. Nou te fè anti-UTX CUT & Tag ki te swiv pa sekans, ki pèmèt deteksyon rejyon ADN ki mare ak UTX lè l sèvi avèk yon metòd imunopresipitasyon ki baze sou antikò41. Anti-UTX CUT&Tag sou selil WT ak UTXNKD NK ki pirifye sòt revele 5,746 pik UTX-bound (FDR <0.01, ajiste valè P <0.05; Fig. 6d ak Done Siplemantè Tablo 4). PCA nan tou de done ATAC-seq ak RNA-seq revele echantiyon gwoupman pa jenotip (Done pwolonje Fig. 6f). Nou idantifye 191 jèn ki te mare UTX, diferansye aksesib pa ATAC-seq ak diferansye eksprime pa RNA-seq (Fig. 6d). Nan 191 jèn sa yo, yon majorite nan UTX-bound pik yo te lokalize nan pwomotè (20.58%), entwonik (46.94%) ak entèrjenik (27.4%) rejyon (Fig. 6e). Jèn remakab ki enplike nan omeyostaz selil NK (Bcl2 ak Thy1; Fig. 6f) 30,42 ak fonksyon efektè (Ifng ak Csf2) yo te mare UTX, diferan aksesib ak diferansye eksprime (Fig. 6g). Anplis, nan 191 jèn ki gen UTX yo, 140 jèn yo te diminye nan ekspresyon, pandan y ap rès 51 jèn yo te ogmante (Tablo Done Siplemantè 3) ki konfime yon rapò anvan nan selil T ki UTX fonksyone nan tou de aktive ak reprime transkripsyon jèn43. Analiz chemen Enrichr44 sou jèn 191 UTX-bound sa yo te revele diminye repons enflamatwa, siyal IFN ak sitotoksisite selil NK nan selil UTXNKD NK (Done pwolonje Fig. 6g). Kontrèman, ogmante pwosesis katabolik selilè ak chemen siyal apoptoz, ki gen ladan tou de jèn pro-apoptotik ak anti-apoptotik (pa egzanp, Bcl2, Bbc3 ak Gadd45g), yo te wè nan selil UTXNKD NK. Pami 865 UTX-bound pik ak ekspresyon ki depann de UTX ak diferans aksesibilite kwomatin (191 jèn inik), analiz regression lineyè te montre yon korelasyon pozitif enpòtan (Pearson a R=0.5165, P <0.0001) ant kwomatin. aksè ak ekspresyon jèn (Done Pwolonje Fig. 6h, i). Rejyon UTX ki te okipe nan Bcl2, Thy1, Ifng, ak Csf2 loci jèn yo te koresponn ak rejyon kote diferans nan aksè ak ekspresyon jèn yo te note tou (Fig. 6f, g). Done sa yo sijere UTX kontwole aksè chromatin ak chemen transkripsyon jèn enpòtan nan reglemante omeyostazi selil NK ak fonksyon.

Yo konnen UTX kominike avèk faktè transkripsyon (TF) pou òkestre transkripsyon jèn sib40. Pou idantifye motif TF putatif ak aksè diferans akòz pèt UTX, nou te fè analiz HOMER (Hypergeometric Optimization of Motif Enrichment) 45 TF motif sou pik diferansye aksesib ki idantifye pa ATAC-seq (Done pwolonje Fig. 6j). TF ki asosye ak fonksyon efè selil NK (pa egzanp, Runt (Runx1 and Runx2)46 ak T-box (Eomes, T-bet, Tbr1 and Tbx6)47 manm fanmi yo) te pi enpòtan epi yo te gen yon pi gwo pousantaj motif sib ki asosye ak diminye aksè nan UTXNKD (grap 1, 2, 3 ak 6; Done pwolonje Fig. 6j). Kontrèman, TF ki asosye ak pwopagasyon, diferansyasyon ak metabolis nan dwèt zenk la ak fanmi ETS TFs48 yo te pi plis asosye ak aksè ogmante (grap 4 ak 5; Done pwolonje Fig. 6j). Anplis de sa, analiz TF motif sou pik UTX-bound pa UTX CUT&Tag kore rezilta sa yo lè li revele TF kritik nan tou de pwosesis efè selil NK (T-bet, Eomes, Runx1 ak Tbx5) ak pwogram devlopman (ETS1 ak AP -1); Done pwolonje Fig. 6k). Done sa yo sijere tou de aksè diferans ak dirèk UTX obligatwa nan enpòtan TF obligatwa motif ki enplike nan reglemante kapasite selil NK ak pwosesis efèktè. Analiz sa yo sijere ke UTX modile jaden flè chromatin pou kontwole ekspresyon jèn ki enpòtan nan omeyostazi selil NK (Bcl2 ak Thy1) ak fonksyon efèktè (Ifng ak Csf2). Alafen, rezilta sa yo sijere yon modèl kote diferan nivo ekspresyon UTX ka kache dimorphism seksyèl nan selil NK kòm yon regilatè santral nan kapasite selil NK ak fonksyon efèktè (Fig. 6h).

Fig. 6 | Global changes in NK cell chromatin accessibility and transcription mediated by UTX. a–c, 4:1 WT: UTXNKD mBMCs were generated by transferring WT (CD45.1+ ) and UTXNKD (CD45.2+ ) bone marrow into lymphodepleted host mice (CD451x2 ) and allowed to reconstitute for 6 weeks. Splenic NK cells were sorted for ATAC-seq and RNA-seq library preparation (n = 3 per group). Line graphs (left) and heat map (right) of fuzzy c-means clustered differentially accessible peaks identified by ATAC-seq (a) and differentially expressed genes identified by RNA-seq (b) of splenic NK cells from WT: UTXNKD mBMC mice (adjusted P value < 0.05 and membership score > 0.5). Line graphs show the mean (black line) and standard deviation (red ribbon) of mean-centered normalized log2 values of significance (FDR and adjusted P value < 0.05). c, Pathway analysis of significant fuzzy c-means clustered RNA-seq genes using g: Profiler with point size indicating −log10(P value; calculated by g: GOSt using Fisher's one-tailed test). d–g, Anti-UTX CUT&Tag was performed in WT and UTXNKD NK cells and identified 5,746 unique UTX-bound peaks (n = 3 per group). d, Venn diagram outlining overlapping differentially accessible (DA) genes identified by ATAC-seq and differentially expressed (DE) genes identified by RNA-seq. e, Location of UTX-bound peaks. f,g, Representative gene tracks from UCSC Integrated Genome Browser of anti-UTX CUT&Tag ('anti-UTX'), ATAC-seq and RNA-seq of Bcl2 and Thy1 (f) and Ifng and Csf2 (g); y-axis depicts counts per million (CPM). h, Schematic of how differential UTX expression levels underlie sexual dimorphism in NK cell composition and function (left). Diagram of how UTX may be regulating gene programs involved in NK cell numbers and effector function during homeostasis and viral infection (right). Created with BioRender.com.

Figi 6|Chanjman mondyal nan aksè nan chromatin selil NK ak transkripsyon medyatè pa UTX. a–c, 4:1 WT: UTXNKD mBMC yo te pwodwi pa transfere WT (CD45.1+) ak UTXNKD (CD45.2+) mwèl zo nan sourit lame lenfodeplete (CD451x2) epi yo te pèmèt yo rekonstitye pou 6 semèn. Selil Splenic NK yo te klase pou preparasyon bibliyotèk ATAC-seq ak RNA-seq (n=3 pou chak gwoup). Grafik liy (agòch) ak kat chalè (adwat) nan c-vle di floue gwoupe pik diferansye aksesib idantifye pa ATAC-seq (a) ak jèn ki eksprime diferansye idantifye pa RNA-seq (b) nan selil NK lasèn ki soti nan sourit WT: UTXNKD mBMC (Ajiste valè P <0.05 ak nòt manm > 0.5). Grafik liy yo montre mwayen (liy nwa) ak devyasyon estanda (riban wouj) nan valè nòmal log2 ki genyen siyifikasyon (FDR ak valè P ajiste <0.05). c, Pathway analiz de siyifikatif fuzzy c-vle di gwoup RNA-seq jèn lè l sèvi avèk g: Profiler ak gwosè pwen ki endike -log10 (valè P; kalkile pa g: GOSt lè l sèvi avèk yon sèl-tailed tès Fisher a). d-g, Anti-UTX CUT & Tag te fèt nan selil WT ak UTXNKD NK epi yo te idantifye 5,746 pik inik UTX-bound (n=3 pou chak gwoup). d, Venn dyagram ki montre sipèpoze diferan aksesib a (DA) jèn idantifye pa ATAC-seq ak diferan eksprime (DE) jèn idantifye pa RNA-seq. e, Kote pik UTX yo. f,g, Reprezantan tras jèn ki soti nan UCSC Integrated Genome Browser nan anti-UTX CUT&Tag ("anti-UTX"), ATAC-seq ak RNA-seq nan Bcl2 ak Thy1 (f) ak Ifng ak Csf2 (g); aks y dekri konte pou chak milyon (CPM). h, Chematik ki jan diferan nivo ekspresyon UTX kache dimorphism seksyèl nan konpozisyon selil NK ak fonksyon (agòch). Dyagram sou fason UTX ka regle pwogram jèn ki enplike nan nimewo selil NK ak fonksyon efèktè pandan omeyostazi ak enfeksyon viral (adwat). Kreye ak BioRender.com.

Diskisyon

Sèks se yon varyab byolojik kritik nan detèmine rezilta nan enfeksyon viral3. Sa resamman te ilistre ak COVID-19, kote sèks gason yo te idantifye kòm yon gwo faktè risk pou maladi grav5. Anplis, etid resan yo te lye disfonksyon selil NK ak maladi COVID-19 grav49. Etandone enpòtans selil NK nan iminite antiviral, konprann kòz rasin diferans sèks nan byoloji selil NK pral gen enplikasyon byen lwen nan optimize repons efèktè andojèn yo. Nan etid sa a, nou demontre ke pi ba ekspresyon UTX nan selil NK gason kontribye nan ogmante kantite yo ak diminye fonksyonalite efèktè yo. NK selil UTX obligatwa pou kontwole kondisyon fizik selil NK, modile aksè nan motif obligatwa TF, ogmante aksè chromatin nan loci jèn efèktè yo, ak anpwazonnen selil NK pou repons rapid nan enfeksyon viral.

Anplis selil NK, yo rapòte dimòfis seksyèl nan selil B, monosit, netrofil, selil CD4+ T, ak selil CD8+ T25. Pandan ke yo te deja rapòte diferans sèks nan selil iminitè yo te medyatè pa òmòn sèks gonadal50-52, li rete posib ke yon sou-ansanm nan diferans sa yo ka tou atribiye a ekspresyon diferans UTX. Pou sipòte posibilite sa a, yo te asosye defisyans UTX ak diminye selil T ak nimewo selil NK T envaryab53-55; ak transkripsyon UTX yo pi ba nan selil gason ak selil fi yo pou plizyè kalite selil iminitè (selil CD4+ T, CD8+ selil T, monosit, selil B) yo te mande nan baz done DICE56. Plis etid fenotipik yo bezwen pou detèmine wòl UTX nan modile diferans sèks nan lòt kalite selil iminitè yo. NK selil-medyatè fonksyon efèktè gen ladan pwodiksyon cytokine ak ekspresyon molekil sitotoksik. Analiz milti-omik nou yo sijere ke UTX sere paysage chromatin nan selil NK yo byen vit reponn a defi viral lè yo ogmante aksè ak transkripsyon nan loci effector. Etid sa yo te revele jèn 191 (ki gen ladan Ifng ak Csf2) 20,32 ki te an menm tan mare pa UTX, diferan aksesib ak eksprime. Diminye IFN- ak GM-CSF cytokine pwodiksyon ak kapasite cytolytic andikape nan UTX-ensufizant selil NK sipòte wòl UTX nan fè pwomosyon fonksyonalite efè pandan enflamasyon. Sepandan, ka gen konsekans adisyonèl endirèk nan règleman jèn ki medyatè UTX ki jwe wòl enpòtan nan fonksyon efè selil NK, jan sa pwouve pa jèn adisyonèl ki eksprime diferan men ki pa mare pa UTX.

Kòm yon demethylase H3K27me3, UTX balanse chromatin pou ekspresyon jèn aktif57. Anplis aktivite katalitik li yo, UTX fonksyone nan konplèks multiprotein ak lòt regilatè epigenetik (pa egzanp, SWI/SNF, MLL4/5, ak p300) pou medyatè renovasyon chromatin nan yon fason endepandan demethylase36,57. Nou rapòte fonksyon demethylase-endepandan UTX nan reglemante omeyostazi ak pwogram efèktè nan selil NK. Sa a se kontrèman ak wòl UTX nan selil NK T envaryab, nan ki aktivite demethylase li yo obligatwa53. Kidonk, mekanis molekilè pa ki fonksyon UTX yo ka espesifik nan liyaj. Nan sipò ipotèz sa a, yo te rapòte UTX pou kominike avèk TF espesifik nan liyaj T nan selil T pou vize loci40 effector. Analiz motif HOMER nou an te revele entèraksyon potansyèl UTX ak Runx1, Runx2, Eomes, ak lòt TF ki enpòtan pou fonksyon efè selil NK pandan enfeksyon viral46,47. Anplis, analiz sa yo montre tou entèraksyon UTX ak KLF1, KLF5, Sp2, ak lòt TF ki asosye ak pwopagasyon selil NK, diferansyasyon, ak metabolis48. Anplis de sa, rezilta nou yo sipòte etid pibliye deja kote UTX nan lòt kalite selil yo te rapòte kowòdone repons ak T-bet, Eomes, ak Tbx5 (ref. 40), ETS1 (ref. 48) ak AP-1 ( ref.58). Finalman, Runx1 te montre pou kominike avèk UTX-reglemante BRG1 ak SWI/SNF konplèks46. Sepandan, akòz nati korelatif analiz HOMER, yo bezwen plis etid ak ko-immunoprecipitation ak espektrometri mas pou verifye eksperimantal entèraksyon sa yo in situ. Anplis de sa, kòm yon konstititif XCI sove, UTX ka gen mekanis selil-kalite espesifik nan de posiblite: (i) pisin nan kofaktè prezan ak (ii) disponiblite nan patnè epigenetik obligatwa li yo. UTX depann sou pwodwi segondè nan chemen metabolik pou kofaktè (pa egzanp, Fe(II), -ketoglutarate, ak oksijèn) enpòtan anpil pou aktivite anzimatik li yo59. Kidonk, depann sou eta metabolik la, gen pisin diferan nan kofaktè aksesib pou fonksyon demethylase UTX a, ki pèmèt diferan nivo aktivite katalitik ki baze sou kalite selil la. Anplis de sa, fonksyonalite UTX a ka depann sou aktivite ak nivo ekspresyon patnè obligatwa li yo (pa egzanp, MLL3/4, SWI/SNF, ak p300) ki kode otosomalman.

Desert ginseng-Improve immunity (21)

benefis cistanche pou gason-ranfòse sistèm iminitè

Peze faktè ki defini gwoup pasyan yo ak repons iminitè diferan pral pèmèt nou pase yon apwòch terapetik 'yon sèl-size-fits-all' nan yon paradigm medikaman presizyon. Defisyans UTX te asosye ak sendwòm Kabuki ak sendwòm Turner60, de kondisyon imen ki asosye ak disregulasyon iminitè ak enfeksyon ogmante. Konklizyon nou yo sijere posiblite pou defisi UTX nan selil NK imen yo ka kontribye nan diminye siveyans imuno viral yo obsève nan pasyan sa yo, byenke travay nan lavni yo pral bezwen sipòte ipotèz sa a. Anplis, konprann diferans sèks nan fonksyon selil NK oblije enkòpore sèks kòm yon faktè byolojik nan desizyon tretman. Nan gason ki gen maladi viral grav, pou egzanp, amelyore aktivite UTX selil NK ka bay benefis terapetik. Nou espere ke Sur sa yo pral enpòtan non sèlman nan anviwònman an nan enfeksyon viral, men tou nan lòt enfeksyon ak kansè, kote selil NK jwe yon wòl enpòtan tou. Konklizyon sa yo ka gen tou enplikasyon enpòtan pou terapi adopsyon selilè, kote selil NK yo se sijè a enterè entans61.

Referans

1. Wilkinson, NM, Chen, HC, Lechner, MG & Su, MA Diferans sèks nan iminite. Annu Rev Immunol. 40, 75–94 (2022).

2. Klein, SL & Flanagan, KL Diferans sèks nan repons iminitè yo. Nat. Rev Immunol. 16, 626–638 (2016).

3. Pardue, M.-L. & Wizemann, TM Eksplore kontribisyon byolojik nan sante moun: èske sèks enpòtan? The National Academy Press https://doi.org/10.17226/10028 (2001).

4. Gianella, S. et al. Diferans sèks nan replikasyon CMV ak pèsistans VIH pandan ART suppressive. Louvri Forum Enfekte. Dis. 7, ofaa289 (2020).

5. Takahashi, T. & Iwasaki, A. Diferans sèks nan repons iminitè yo. Syans 371, 347–348 (2021).

6. Patin, E. et al. Varyasyon natirèl nan paramèt selil iminitè natirèl yo se preferans kondwi pa faktè jenetik. Nat. Imunol. 19, 302–314 (2018).

7. Huang, Z. et al. Efè sèks ak aje sou jaden flè selil iminitè a jan yo evalye analiz transcriptomic yon sèl selil. Pwosedi. Natl Acad. Sci. USA 118, e2023216118 (2021).

8. Talebizadeh, Z., Simon, SD & Butler, MG X kwomozòm ekspresyon jèn nan tisi imen: konparezon gason ak fi. Genomics 88, 675-681 (2006).

9. Fang, H., Disteche, CM & Berletch, JB X inaktivasyon ak chape: karakteristik epigenetik ak estriktirèl. Devan. selil Dev. Biol. 7, 219 (2019).

10. Chen, X. et al. Diferans sèks nan defo nan tib neral nan sourit p53-nil se ki te koze pa diferans nan konpleman nan X, pa Y. Dev. Neurobiol. 68, 265–273 (2008).

11. Smith-Bouvier, DL et al. Yon wòl pou konpleman kwomozòm sèks nan patipri fi nan maladi otoiminitè. J. Exp. Med. 205, 1099–1108 (2008).

12. Souyris, M. et al. TLR7 chape nan inaktivasyon kwomozòm X nan selil iminitè yo. Sci. Imunol. 3, eaap8855 (2018).

13. Hammer, Q., Ruckert, T. & Romagnani, C. Espesifik selil asasen natirèl pou enfeksyon viral. Nat. Imunol. 19, 800–808 (2018).

14. Orange, JS Deficiency selil asasen natirèl. J. Alèji Clin. Imunol. 132, 515–525 (2013).

15. Bukowski, JF, Warner, JF, Dennert, G. & Welsh, RM Etid transfè adoptif ki demontre efè antiviral selil asasen natirèl yo nan vivo. J. Exp. Med. 161, 40–52 (1985).

16. Brown, MG et al. Patisipasyon vital nan yon reseptè deklanchman selil asasen natirèl nan rezistans nan enfeksyon viral. Syans 292, 934–937 (2001).

17. Welsh, RM, Brubaker, JO, Vargas-Cortes, M. & O'Donnell, CL repons selil asasen natirèl (NK) nan enfeksyon viris nan sourit ki gen iminodefisyans grav konbine. Eksitasyon selil NK yo ak kontwòl selil NK depandan enfeksyon viris yo fèt poukont fonksyon selil T ak B yo. J. Exp. Med. 173, 1053–1063 (1991).

18. Bancroft, GJ, Shellam, GR & Chalmer, JE Enfliyans jenetik sou ogmantasyon nan selil asasen natirèl pandan enfeksyon cytomegalovirus murin: korelasyon ak modèl rezistans. J. Immunol. 126, 988–994 (1981).

19. Menees, KB et al. Chanjman ki depann de sèks ak laj nan pwofil selil iminitè lasan ak fenotip selil NK ak fonksyon nan sourit C57BL/6J. Iminitè. Aje 18, 3 (2021).

20. Mujal, AM, Delconte, RB & Solèy, JC Selil asasen natirèl: soti nan karakteristik natirèl ak adaptasyon. Ann. Rev Immunol. 39, 417–447 (2021).

21. Loh, J., Chu, DT, O'Guin, AK, Yokoyama, WM & Virgin, HWT Selil asasen natirèl yo itilize perforin ak gamma interferon pou kontwole enfeksyon cytomegalovirus murin nan larat ak fwa. J. Virol. 79, 661–667 (2005).

22. Orange, JS, Wang, B., Terhorst, C. & Biron, CA Egzijans pou entèferon-gama ki pwodui nan selil asasen natirèl nan defans kont enfeksyon sitomegaloviris murin ak amelyorasyon chemen defans sa a pa administrasyon interleukin-12. J. Exp. Med. 182, 1045–1056 (1995).

23. Nakaya, M., Tachibana, H. & Yamada, K. Efè estwojèn sou popilasyon selil entèferon-gama pwodwi nan splenosit sourit. Biosci. Biotechnol. Byochim. 70, 47–53 (2006).

24. Chiossone, L. et al. Matirite selil NK sourit yo se yon pwogram devlopman 4-etap. San 113, 5488–5496 (2009).

25. Wainer Katsir, K. & Linial, M. Jenn imen chape X-inactivation revele pa done ekspresyon sèl selil yo. BMC Genomics 20, 201 (2019).

26. Yang, F., Babak, T., Shendure, J. & Disteche, CM Global sondaj sou chape soti nan inaktivasyon X pa RNA-sekans nan sourit. Genomic Res. 20, 614–622 (2010).

27. Berletch, JB et al. Chape soti nan inaktivasyon X varye nan tisi sourit. PLoS Genet. 11, e1005079 (2015).

28. Arnold, AP Kat jenotip debaz ak modèl sourit XY*: aktyalizasyon sou enpak sou rechèch SABV. Neurosci. Konpòtman biyo. Rev. 119, 1–8 (2020).

29. Hasegawa, H. et al. Aktivasyon p53 pa Nutlin-3a, yon antagonis MDM2, pwovoke apoptoz ak senesans selilè nan selil lesemi selil T adilt yo. Lesemi 23, 2090–2101 (2009).

30. Riggan, L. et al. Faktè transkripsyon Fli1 mete restriksyon sou fòmasyon selil NK precurseur memwa pandan enfeksyon viral. Nat. Imunol. 23, 556–567 (2022).

31. Min-Oo, G., Bezman, NA, Madera, S., Solèy, JC & Lanier, LL Proapoptotic Bim kontwole kontraksyon selil NK espesifik antijèn ak jenerasyon pisin selil NK memwa apre enfeksyon cytomegalovirus. J. Exp. Med. 211, 1289–1296 (2014).

32. Louis, C. et al. GM-CSF ki sòti nan selil NK pote atrit enflamatwa epi li negatif reglemante pa CIS. J. Exp. Med. 217, e20191421 (2020).

33. Bjorkstrom, NK, Strunz, B. & Ljunggren, HG Selil asasen natirèl nan iminite antiviral. Nat. Rev Immunol. 22, 112–123 (2022).

34. Smyth, MJ et al. Perforin se yon gwo kontribitè nan kontwòl selil NK nan metastaz timè. J. Immunol. 162, 6658–6662 (1999).

35. Van der Meulen, J., Speleman, F. & Van Vlierberghe, P. H3K27me3 demethylase UTX nan devlopman nòmal ak maladi. Epigenetics 9, 658-668 (2014).

36. Wang, SP et al. Yon rezo regilasyon transkripsyon UTX-MLL4-p300 kowòdone fòme peyizaj aktif aktif pou fè transkripsyon. Mol. Selil 67, 308–321 (2017).

37. Gozdecka, M. et al. UTX-medyatè amelyore ak renovasyon chromatin siprime lesemogenèz myeloid atravè règleman envès noncatalytic nan pwogram ETS ak GATA. Nat. Genet. 50, 883–894 (2018).

38. Wang, C. et al. UTX kontwole diferansyasyon mesoderm nan selil souch anbriyon yo endepandan de aktivite H3K27 demethylase. Pwosedi. Natl Acad. Sci. USA 109, 15324–15329 (2012).

39. Shih, HY et al. Akizisyon devlòpmantal nan regulomes kache fonksyonalite natirèl selil lenfoyid. Selil 165, 1120–1133 (2016).

40. Miller, SA, Mohn, SE & Weinmann, AS Jmjd3 ak UTX jwe yon wòl endepandan demethylase nan renovasyon chromatin pou kontwole ekspresyon jèn manm fanmi depandan de T-box. Mol. Selil 40, 594–605 (2010).

41. Kaya-Okur, HS et al. CUT & Tag pou pwofil epigenomik efikas nan ti echantiyon ak selil sèl. Nat. Komin. 10, 1930 (2019).

42. Kupz, A. et al. Kontribisyon selil 1+ NK Ou yo nan pwodiksyon pwoteksyon IFN-gama pandan enfeksyon Salmonella typhimurium. Pwosedi. Natl Acad. Sci. USA 110, 2252–2257 (2013).

43. Langmead, B. & Salzberg, SL Fast gapped-read aliyman ak Bowtie 2. Nat. Metòd 9, 357–359 (2012).

44. Chen, EY et al. Enrichr: entèaktif ak kolaborasyon lis jèn HTML5 zouti analiz anrichisman. BMC Bioinformatics 14, 128 (2013).

45. Heinz, S. et al. Senp konbinezon de faktè transkripsyon ki detèmine liyaj prensipal eleman regilasyon cis ki nesesè pou idantite makrofaj ak selil B yo. Mol. Selil 38, 576–589 (2010).

46. ​​Rapp, M. et al. Nwayo-obligatwa faktè-beta ak faktè transkripsyon Runx ankouraje repons adaptive selil asasen natirèl. Sci. Imunol. 2, eaan3796 (2017).

47. Simonetta, F., Pradier, A. & Roosnek, E. T-bet ak eomesodermin nan devlopman selil NK, spirasyon ak fonksyon. Devan. Imunol. 7, 241 (2016).

48. Presnell, JS, Schnitzler, CE & Browne, WE KLF/SP transkripsyon faktè evolisyon fanmi: ekspansyon, diversification ak inovasyon nan ekaryot. Genomic Biol. Evol. 7, 2289–2309 (2015).

49. Kramer, B. et al. Siyati IFN-alfa bonè ak malfonksyònman ki pèsistan yo se karakteristik distenktif selil NK nan COVID--19 grav. Iminite 54, 2650–2669 (2021).

50. D'Agostino, P. et al. Òmòn sèks yo modile medyatè enflamatwa ki pwodui pa macrophages. Ann. NY Acad. Sci. 876, 426–429 (1999).

51. Lu, FX et al. Fòs iminite selil B nan makak rhesus fi kontwole pa selil CD8+ T ki anba enfliyans òmòn esteroyid nan òvèj. Clin. Eksp. Imunol. 128, 10–20 (2002).

52. Singh, RP & Bischof, DS Òmòn sèks ak sèks enfliyanse ekspresyon makè selil T regilasyon nan pasyan SLE. Devan. Imunol. 12, 619268 (2021).

53. Cook, KD et al. T follicular helper selil-depandan clearance nan yon enfeksyon viris ki pèsistan mande pou ekspresyon selil T nan histon demethylase UTX la. Iminite 43, 703–714 (2015).

54. Beyaz, S. et al. Histone demethylase UTX kontwole pwogram epigenetik liyaj-espesifik nan selil T asasen natirèl invariant. Nat. Imunol. 18, 184–195 (2017).

55. Mitchell, JE et al. UTX ankouraje CD8+ selil T medyatè defans antiviral men diminye rezistans selil T yo. Rep. Selilè 35, 108966 (2021).

56. Schmiedel, BJ et al. Enpak polimorfism jenetik sou ekspresyon jèn selil iminitè imen yo. Selil 175, 1701–1715 (2018).

57. Bosselut, R. Pleyotropic fonksyon demethylases H3K27Me3 nan diferansyasyon selil iminitè. Tandans Immunol. 37, 102–113 (2016).

58. Kechin, A., Boyarskikh, U., Kel, A. & Filipenko, M. cutPrimers: yon nouvo zouti pou koupe egzat nan primè soti nan lekti nan sekans pwochen jenerasyon vize. J. Konpitè. Biol. 24, 1138–1143 (2017).

59. Hong, S. et al. Idantifikasyon JmjC domèn ki gen UTX ak JMJD3 kòm histon H3 lizin 27 demethylases. Pwosedi. Natl Acad. Sci. USA 104, 18439–18444 (2007).

60. Van Laarhoven, PM et al. Jenn sendwòm Kabuki KMT2D ak KDM6A: analiz fonksyonèl demontre wòl enpòtan nan devlopman kranio-facial, kè ak sèvo. Hum. Mol. Genet. 24, 4443–4453 (2015).

61. Rezvani, K. Terapi selil adoptif lè l sèvi avèk selil asasen natirèl. Bone Marrow Transpl. 54, 785–788 (2019).

Ou ka renmen tou